297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3595 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3595  protein of unknown function DUF150  100 
 
 
160 aa  313  5e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0775  hypothetical protein  67.5 
 
 
157 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.360947  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2114  hypothetical protein  59.21 
 
 
166 aa  176  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  59.86 
 
 
205 aa  174  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3193  hypothetical protein  60 
 
 
175 aa  160  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3968  protein of unknown function DUF150  55.41 
 
 
196 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1367  hypothetical protein  46.99 
 
 
220 aa  139  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54901  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1418  hypothetical protein  49.01 
 
 
162 aa  138  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14540  hypothetical protein  48.98 
 
 
179 aa  136  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110302  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7750  protein of unknown function DUF150  51.22 
 
 
203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3516  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1324  hypothetical protein  47.56 
 
 
219 aa  133  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2492  protein of unknown function DUF150  48.65 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1058  hypothetical protein  54.09 
 
 
171 aa  128  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0222222  normal  0.0438439 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1413  hypothetical protein  42.5 
 
 
205 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5837  hypothetical protein  45.58 
 
 
174 aa  120  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1518  hypothetical protein  43.4 
 
 
170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11450  hypothetical protein  43.56 
 
 
160 aa  108  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0199556  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1424  protein of unknown function DUF150  39.38 
 
 
222 aa  107  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2311  hypothetical protein  44.97 
 
 
176 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0442926  normal  0.0676785 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23480  hypothetical protein  38.18 
 
 
181 aa  104  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0456205 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1179  hypothetical protein  43.18 
 
 
308 aa  102  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00453705  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4042  hypothetical protein  40.94 
 
 
178 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0029117  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1712  protein of unknown function DUF150  41.94 
 
 
190 aa  98.2  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2062  hypothetical protein  43.04 
 
 
192 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2079  hypothetical protein  43.04 
 
 
192 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2125  hypothetical protein  43.04 
 
 
192 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0426445  normal  0.0108816 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  35.42 
 
 
165 aa  95.5  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1507  protein of unknown function DUF150  40.48 
 
 
186 aa  95.5  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.417111  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1440  protein of unknown function DUF150  45.24 
 
 
208 aa  94.4  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2150  protein of unknown function DUF150  40.69 
 
 
179 aa  92  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1017  protein of unknown function DUF150  37.67 
 
 
177 aa  91.3  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  31.37 
 
 
153 aa  90.9  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1208  protein of unknown function DUF150  38.99 
 
 
192 aa  89  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0220811  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3565  hypothetical protein  47.1 
 
 
268 aa  89  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00347083  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  37.41 
 
 
154 aa  87.8  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10290  hypothetical protein  38.75 
 
 
220 aa  87.8  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  32.43 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  31.76 
 
 
151 aa  85.1  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  34.69 
 
 
152 aa  85.1  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  32.5 
 
 
159 aa  85.1  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  35.66 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  33.99 
 
 
161 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  34.9 
 
 
157 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12857  hypothetical protein  37.74 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000766125  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  36.36 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  31.76 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  35.76 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  36.64 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08070  hypothetical protein  35.88 
 
 
177 aa  81.3  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0408486  normal  0.217563 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  29.73 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  35.66 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1227  protein of unknown function DUF150  35.76 
 
 
171 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  34.21 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2203  protein of unknown function DUF150  45.79 
 
 
173 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000153569  decreased coverage  0.000471354 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  37.06 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  31.76 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  31.08 
 
 
151 aa  79  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  33.77 
 
 
157 aa  79  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  31.54 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  30.41 
 
 
152 aa  79  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  31.76 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  30.61 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  31.76 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0133  hypothetical protein  30.94 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  31.08 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  35.03 
 
 
171 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  35.53 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  39.45 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  32.43 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  31.08 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  31.08 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  31.08 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  28.57 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  31.08 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  37.82 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  31.54 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  31.08 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  31.08 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  31.91 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1213  protein of unknown function DUF150  26.67 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  31.62 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  28.57 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  32.26 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  29.73 
 
 
152 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  29.73 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  33.11 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  32.65 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  29.22 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  28.57 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  29.22 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  28.57 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  31.54 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3420  hypothetical protein  29.73 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1677  hypothetical protein  30.94 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00187557  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  30.2 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  30 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  29.73 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  30.41 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  29.05 
 
 
150 aa  72  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>