More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3968 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3968  protein of unknown function DUF150  100 
 
 		 196 aa  380  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  53.8 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1418  hypothetical protein  50.9 
 
 		 162 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3595  protein of unknown function DUF150  55.41 
 
 		 160 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2114  hypothetical protein  54.09 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1367  hypothetical protein  52.73 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54901  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1324  hypothetical protein  51.1 
 
 		 219 aa  138  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3193  hypothetical protein  49.01 
 
 		 175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7750  protein of unknown function DUF150  48.85 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14540  hypothetical protein  54.2 
 
 		 179 aa  122  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0775  hypothetical protein  51.85 
 
 		 157 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.360947  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1424  protein of unknown function DUF150  41.08 
 
 		 222 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1413  hypothetical protein  40.33 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149258  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1058  hypothetical protein  50.83 
 
 		 171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0222222  normal  0.0438439 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1518  hypothetical protein  45.4 
 
 		 170 aa  114  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5837  hypothetical protein  45.4 
 
 		 174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2492  protein of unknown function DUF150  40.96 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2150  protein of unknown function DUF150  43.4 
 
 		 179 aa  99  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1712  protein of unknown function DUF150  38.12 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1017  protein of unknown function DUF150  37.29 
 
 		 177 aa  94.7  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23480  hypothetical protein  39.58 
 
 		 181 aa  93.6  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0456205 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10290  hypothetical protein  41.61 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1179  hypothetical protein  43.65 
 
 		 308 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00453705  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2203  protein of unknown function DUF150  47.27 
 
 		 173 aa  92  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000153569  decreased coverage  0.000471354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2311  hypothetical protein  43.92 
 
 		 176 aa  92  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0442926  normal  0.0676785 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4042  hypothetical protein  43.62 
 
 		 178 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0029117  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3565  hypothetical protein  47.85 
 
 		 268 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00347083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11450  hypothetical protein  39.01 
 
 		 160 aa  90.5  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0199556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  35.63 
 
 		 159 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2062  hypothetical protein  42.31 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2079  hypothetical protein  42.31 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2125  hypothetical protein  42.31 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0426445  normal  0.0108816 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1440  protein of unknown function DUF150  51.61 
 
 		 208 aa  84.7  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06980  hypothetical protein  43.84 
 
 		 195 aa  84.3  9e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.106451  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  39.25 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  38.06 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  38.81 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1507  protein of unknown function DUF150  42.2 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.417111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  37.78 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1208  protein of unknown function DUF150  42.5 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0220811  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  35.46 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  31.52 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12857  hypothetical protein  37.33 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000766125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  32.28 
 
 		 151 aa  77.8  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  34.75 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  40.65 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  36.43 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  39.6 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  31.68 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  33.08 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  30.86 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  42.27 
 
 		 145 aa  74.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1213  protein of unknown function DUF150  35.56 
 
 		 170 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  35.71 
 
 		 154 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  39.37 
 
 		 153 aa  74.3  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  34.85 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  40 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  34.75 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  33.08 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  33.13 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  41.84 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  41.84 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  38.58 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  36.15 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  35.82 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  39.81 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0810  hypothetical protein  28.48 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0615439  hitchhiker  0.00120973 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  35.61 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  35.38 
 
 		 151 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  35.38 
 
 		 151 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  39 
 
 		 153 aa  72  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  39.39 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  34.95 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  35.46 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  36 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  31.62 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  36 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  38 
 
 		 152 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  32.65 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  32.65 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  39.02 
 
 		 151 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  35.38 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  36.92 
 
 		 151 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  32.65 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  38 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  43.62 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  30.88 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  38.78 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  35 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  38.54 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  35 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  27.16 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>