286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1213 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1213  protein of unknown function DUF150  100 
 
 
170 aa  340  4e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3420  hypothetical protein  41.18 
 
 
167 aa  117  7.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0034  protein of unknown function DUF150  38.82 
 
 
160 aa  101  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186641  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0139  protein of unknown function DUF150  35.22 
 
 
154 aa  87.8  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  32.06 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0651  protein of unknown function DUF150  33.9 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00506938  normal  0.180527 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3968  protein of unknown function DUF150  35.66 
 
 
196 aa  80.9  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1418  hypothetical protein  36.94 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3595  protein of unknown function DUF150  31.54 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3193  hypothetical protein  28.78 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1058  hypothetical protein  34.96 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0222222  normal  0.0438439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1628  hypothetical protein  31.76 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1413  hypothetical protein  29.41 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149258  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1307  protein of unknown function DUF150  38.24 
 
 
160 aa  72  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2114  hypothetical protein  32.79 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0396  hypothetical protein  43.96 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0150175  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  31.01 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14540  hypothetical protein  30.41 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110302  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1367  hypothetical protein  33.94 
 
 
220 aa  67.4  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54901  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1263  hypothetical protein  28.46 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1324  hypothetical protein  32.11 
 
 
219 aa  67.4  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1712  protein of unknown function DUF150  32.71 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  34.62 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1464  hypothetical protein  36.9 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  29.41 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2778  hypothetical protein  30.17 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000007785  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  39.18 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0298  hypothetical protein  39.8 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000302311  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2430  hypothetical protein  30 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  38.14 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  33.65 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2311  hypothetical protein  29.63 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0442926  normal  0.0676785 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  33.01 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  33.67 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  33.67 
 
 
154 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2492  protein of unknown function DUF150  33.86 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  32.06 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  31.78 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0606  protein of unknown function DUF150  30.5 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000662285  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0253  hypothetical protein  30.67 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  27.94 
 
 
157 aa  62.4  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  30.23 
 
 
168 aa  62.4  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2150  protein of unknown function DUF150  31.25 
 
 
179 aa  61.2  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  28.85 
 
 
156 aa  61.2  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  30 
 
 
151 aa  60.8  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  32.65 
 
 
171 aa  60.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0365  protein of unknown function DUF150  31.14 
 
 
179 aa  60.8  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00296353  normal  0.904382 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  28.12 
 
 
157 aa  60.8  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1424  protein of unknown function DUF150  29.59 
 
 
222 aa  60.8  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0400  protein of unknown function DUF150  30 
 
 
180 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158996  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  33.65 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1440  protein of unknown function DUF150  33.94 
 
 
208 aa  59.7  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01345  hypothetical protein  33.66 
 
 
153 aa  60.1  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  41.56 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  29.73 
 
 
153 aa  59.7  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4042  hypothetical protein  34.44 
 
 
178 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0029117  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7750  protein of unknown function DUF150  25 
 
 
203 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3516  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  33.96 
 
 
140 aa  58.9  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5837  hypothetical protein  37.84 
 
 
174 aa  58.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  33.07 
 
 
152 aa  58.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  28.79 
 
 
154 aa  58.5  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  32.26 
 
 
238 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0695  hypothetical protein  27.56 
 
 
157 aa  58.2  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000302569  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2493  hypothetical protein  31.03 
 
 
186 aa  58.2  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0301958  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  36.13 
 
 
176 aa  58.5  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  30.3 
 
 
151 aa  58.2  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1227  protein of unknown function DUF150  31.63 
 
 
171 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11450  hypothetical protein  40 
 
 
160 aa  58.2  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0199556  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0367  hypothetical protein  32.33 
 
 
173 aa  58.2  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000973153  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1781  hypothetical protein  31.51 
 
 
191 aa  57.8  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000171519  normal  0.0471019 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  30.47 
 
 
150 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  30.47 
 
 
150 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  30.47 
 
 
150 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  30.47 
 
 
150 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  30.47 
 
 
150 aa  57.8  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  30.47 
 
 
150 aa  57.8  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  30 
 
 
154 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0989  hypothetical protein  32.31 
 
 
153 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.233502  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1063  hypothetical protein  32.31 
 
 
153 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295932  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0773  protein of unknown function DUF150  31.58 
 
 
164 aa  57.4  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1913  hypothetical protein  32.31 
 
 
153 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  27.82 
 
 
152 aa  57.4  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2566  hypothetical protein  32.31 
 
 
153 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000987168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1760  hypothetical protein  32.31 
 
 
153 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0177  hypothetical protein  32.31 
 
 
153 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00695056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1738  hypothetical protein  32.31 
 
 
153 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00684436  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1509  hypothetical protein  32.31 
 
 
153 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985298  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  30 
 
 
154 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  31.78 
 
 
166 aa  57  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  30.39 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  29.77 
 
 
150 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  29.63 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  29.9 
 
 
157 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  29.09 
 
 
152 aa  56.6  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  41.33 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2062  hypothetical protein  29.57 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  24.84 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2079  hypothetical protein  29.57 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  38.71 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  30.3 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>