168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1263 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1263  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  312  9.999999999999999e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1628  hypothetical protein  48.1 
 
 
166 aa  141  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01345  hypothetical protein  45.75 
 
 
153 aa  135  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0139  protein of unknown function DUF150  34.81 
 
 
154 aa  89.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0651  protein of unknown function DUF150  35.29 
 
 
169 aa  89.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00506938  normal  0.180527 
 
 
-
 
NC_002950  PG0253  hypothetical protein  33.11 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3420  hypothetical protein  28.12 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1213  protein of unknown function DUF150  28.46 
 
 
170 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  29.93 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  29.93 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0034  protein of unknown function DUF150  28 
 
 
160 aa  60.8  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186641  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  37.89 
 
 
154 aa  59.7  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1507  protein of unknown function DUF150  29.7 
 
 
186 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.417111  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2430  hypothetical protein  35.71 
 
 
172 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2311  hypothetical protein  32.52 
 
 
176 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0442926  normal  0.0676785 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  32.35 
 
 
161 aa  57  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  34.95 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  32.54 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  30.99 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1066  hypothetical protein  35.79 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000674656  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14540  hypothetical protein  32.98 
 
 
179 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110302  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3193  hypothetical protein  36.14 
 
 
175 aa  55.1  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  37.08 
 
 
173 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  29.85 
 
 
151 aa  54.7  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3968  protein of unknown function DUF150  35.42 
 
 
196 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  30.83 
 
 
157 aa  54.3  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  30.77 
 
 
151 aa  53.9  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0367  hypothetical protein  35.63 
 
 
173 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000973153  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  36.96 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1367  hypothetical protein  30.1 
 
 
220 aa  54.3  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54901  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1046  hypothetical protein  35.96 
 
 
150 aa  53.9  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000583244  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  29.2 
 
 
153 aa  53.9  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  32.32 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  36.26 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  30.88 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  29.06 
 
 
205 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  30.88 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4042  hypothetical protein  34.88 
 
 
178 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0029117  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  27.41 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  30.88 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  30.88 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  36.26 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  32.58 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0298  hypothetical protein  28.8 
 
 
176 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000302311  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1324  hypothetical protein  34.44 
 
 
219 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  36.59 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  33.7 
 
 
169 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  33.7 
 
 
169 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  31.48 
 
 
153 aa  52.4  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  31.5 
 
 
152 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  30.14 
 
 
172 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  31.63 
 
 
154 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2411  protein of unknown function DUF150  40.85 
 
 
162 aa  52.4  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3595  protein of unknown function DUF150  27.89 
 
 
160 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  25.93 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  25.93 
 
 
140 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  35.14 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  25.93 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  25.93 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  35.14 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  35.14 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  35.14 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  35.14 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  35.87 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  25.93 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  25.93 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  25.93 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  25.93 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  25.93 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  25.93 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  25.93 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  25.93 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2079  hypothetical protein  32.63 
 
 
192 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  25.93 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2125  hypothetical protein  32.63 
 
 
192 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0426445  normal  0.0108816 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  25.19 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2062  hypothetical protein  32.63 
 
 
192 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  35.14 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  32.93 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  25.93 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5837  hypothetical protein  34.15 
 
 
174 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  33.7 
 
 
169 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  35.35 
 
 
151 aa  50.4  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  28.35 
 
 
152 aa  50.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  31.37 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1329  hypothetical protein  30.63 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000301231  hitchhiker  0.0000903983 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3855  hypothetical protein  30.63 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000468139  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  28.85 
 
 
151 aa  50.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3668  hypothetical protein  30.63 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000060287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3558  hypothetical protein  30.63 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000119608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3576  hypothetical protein  30.63 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128893  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1781  hypothetical protein  39.51 
 
 
191 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000171519  normal  0.0471019 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3829  hypothetical protein  30.63 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.0936e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3954  hypothetical protein  30.63 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590574  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0400  protein of unknown function DUF150  26.38 
 
 
180 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158996  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  30.66 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3864  hypothetical protein  30.63 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000526442  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  29.13 
 
 
165 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  30 
 
 
151 aa  50.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3915  hypothetical protein  30.63 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>