292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0034 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0034  protein of unknown function DUF150  100 
 
 
160 aa  316  7.999999999999999e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186641  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1213  protein of unknown function DUF150  38.82 
 
 
170 aa  103  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0139  protein of unknown function DUF150  42.25 
 
 
154 aa  103  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3420  hypothetical protein  37.25 
 
 
167 aa  99.8  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1781  hypothetical protein  31.61 
 
 
191 aa  88.2  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000171519  normal  0.0471019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0651  protein of unknown function DUF150  37.9 
 
 
169 aa  85.1  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00506938  normal  0.180527 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1464  hypothetical protein  37.5 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1628  hypothetical protein  35.98 
 
 
166 aa  82  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0396  hypothetical protein  42.53 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0150175  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1307  protein of unknown function DUF150  33.86 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0365  protein of unknown function DUF150  31.21 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00296353  normal  0.904382 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  37.23 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  37.14 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3193  hypothetical protein  27.74 
 
 
175 aa  77  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1418  hypothetical protein  28.57 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01345  hypothetical protein  34.35 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14540  hypothetical protein  31.75 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110302  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  28.46 
 
 
205 aa  74.7  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0367  hypothetical protein  32.93 
 
 
173 aa  73.9  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000973153  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  29.05 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  34.86 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2311  hypothetical protein  29.71 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0442926  normal  0.0676785 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  32 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0298  hypothetical protein  43.82 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000302311  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2492  protein of unknown function DUF150  27.39 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0695  hypothetical protein  32.03 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000302569  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1367  hypothetical protein  29.13 
 
 
220 aa  70.9  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54901  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3968  protein of unknown function DUF150  25.75 
 
 
196 aa  70.9  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0606  protein of unknown function DUF150  32.61 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000662285  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3595  protein of unknown function DUF150  26.58 
 
 
160 aa  70.5  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7750  protein of unknown function DUF150  28.12 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3516  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1017  protein of unknown function DUF150  29.14 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1046  hypothetical protein  30.94 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000583244  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1324  hypothetical protein  26.09 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1263  hypothetical protein  29.27 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  26.38 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  34.4 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4042  hypothetical protein  27.94 
 
 
178 aa  67.4  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0029117  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  34.4 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0400  protein of unknown function DUF150  34.91 
 
 
180 aa  67  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158996  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2778  hypothetical protein  31.06 
 
 
155 aa  67  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000007785  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2430  hypothetical protein  45.59 
 
 
172 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  27.89 
 
 
152 aa  67  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1066  hypothetical protein  28.78 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000674656  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0573  protein of unknown function DUF150  34.38 
 
 
147 aa  67  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.300735  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  33.04 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  29.63 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  27.61 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  34.38 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  29.11 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  29.52 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2150  protein of unknown function DUF150  24.46 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1507  protein of unknown function DUF150  30.3 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.417111  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  27.03 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  32.69 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2114  hypothetical protein  23.75 
 
 
166 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  35.64 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1058  hypothetical protein  31.45 
 
 
171 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0222222  normal  0.0438439 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3639  hypothetical protein  29.25 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125209  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  29.69 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3915  hypothetical protein  24.22 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1329  hypothetical protein  26.53 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000301231  hitchhiker  0.0000903983 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  34.95 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1413  hypothetical protein  29.45 
 
 
205 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149258  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  34.65 
 
 
151 aa  63.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0253  hypothetical protein  27.95 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3864  hypothetical protein  25.85 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000526442  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3855  hypothetical protein  25.85 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000468139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3668  hypothetical protein  25.85 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000060287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3558  hypothetical protein  25.85 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000119608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3576  hypothetical protein  25.85 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128893  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0775  hypothetical protein  29.75 
 
 
157 aa  63.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.360947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3829  hypothetical protein  25.85 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.0936e-62 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  27.38 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3954  hypothetical protein  25.85 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590574  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  34.4 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  34.95 
 
 
169 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  34.95 
 
 
169 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2469  hypothetical protein  27.21 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000177785  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  33.98 
 
 
169 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  30.95 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  38.81 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  38.81 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  31.25 
 
 
169 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  38.81 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  32.35 
 
 
171 aa  61.6  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  39.39 
 
 
151 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  39.39 
 
 
151 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  39.39 
 
 
151 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  32.99 
 
 
151 aa  61.2  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  32.29 
 
 
153 aa  61.2  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  30.16 
 
 
176 aa  60.8  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  29.93 
 
 
161 aa  60.8  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0250  protein of unknown function DUF150  33.6 
 
 
142 aa  60.5  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  39.39 
 
 
151 aa  60.5  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  33.01 
 
 
173 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  31.37 
 
 
171 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  39.39 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  39.39 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1712  protein of unknown function DUF150  32.03 
 
 
190 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>