161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0365 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0365  protein of unknown function DUF150  100 
 
 
179 aa  355  1.9999999999999998e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00296353  normal  0.904382 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0400  protein of unknown function DUF150  45.86 
 
 
180 aa  155  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158996  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0298  hypothetical protein  44.12 
 
 
176 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000302311  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0396  hypothetical protein  47.1 
 
 
173 aa  122  4e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0150175  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0367  hypothetical protein  40.94 
 
 
173 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000973153  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1781  hypothetical protein  38.95 
 
 
191 aa  111  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000171519  normal  0.0471019 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1464  hypothetical protein  39.1 
 
 
179 aa  107  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0034  protein of unknown function DUF150  31.21 
 
 
160 aa  77.4  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186641  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0139  protein of unknown function DUF150  35.51 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  31.17 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  33.12 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1628  hypothetical protein  31.68 
 
 
166 aa  63.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  30.66 
 
 
154 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3968  protein of unknown function DUF150  32.21 
 
 
196 aa  62  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  37.36 
 
 
159 aa  60.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3420  hypothetical protein  36.56 
 
 
167 aa  60.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1213  protein of unknown function DUF150  35.79 
 
 
170 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  37.65 
 
 
159 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  34.59 
 
 
160 aa  59.3  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  30.58 
 
 
161 aa  58.9  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1307  protein of unknown function DUF150  31.34 
 
 
160 aa  58.5  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2984  hypothetical protein  34.59 
 
 
160 aa  58.2  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  31.82 
 
 
159 aa  57.8  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  30.58 
 
 
151 aa  57.4  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1324  hypothetical protein  35.78 
 
 
219 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2411  protein of unknown function DUF150  25.85 
 
 
162 aa  55.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1367  hypothetical protein  35.4 
 
 
220 aa  55.5  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54901  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  30 
 
 
162 aa  54.7  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  31.76 
 
 
152 aa  54.3  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1418  hypothetical protein  30.56 
 
 
162 aa  54.3  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  26.45 
 
 
151 aa  54.3  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  28.1 
 
 
151 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  28.1 
 
 
151 aa  53.9  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0253  hypothetical protein  36.59 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  28.93 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0651  protein of unknown function DUF150  31.18 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00506938  normal  0.180527 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  28.1 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  27.27 
 
 
151 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  27.27 
 
 
151 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  27.27 
 
 
151 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2311  hypothetical protein  34.9 
 
 
176 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0442926  normal  0.0676785 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  28.38 
 
 
151 aa  52  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  25.58 
 
 
172 aa  51.6  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1424  protein of unknown function DUF150  28.03 
 
 
222 aa  51.6  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3639  hypothetical protein  25.5 
 
 
156 aa  51.6  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125209  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1329  hypothetical protein  25.96 
 
 
156 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000301231  hitchhiker  0.0000903983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  27.27 
 
 
151 aa  50.8  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  27.27 
 
 
151 aa  50.8  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  27.27 
 
 
151 aa  50.8  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  27.27 
 
 
151 aa  50.8  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3855  hypothetical protein  25 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000468139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3668  hypothetical protein  25 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000060287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3558  hypothetical protein  25 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000119608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3576  hypothetical protein  25 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128893  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3829  hypothetical protein  25 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.0936e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3954  hypothetical protein  25 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590574  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3864  hypothetical protein  25 
 
 
156 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000526442  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  26.88 
 
 
152 aa  50.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  29.84 
 
 
152 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3915  hypothetical protein  25.96 
 
 
156 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  29.84 
 
 
152 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  28.1 
 
 
165 aa  49.3  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  31.76 
 
 
154 aa  49.3  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  28.85 
 
 
151 aa  49.3  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2469  hypothetical protein  25.5 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000177785  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  29.41 
 
 
151 aa  49.3  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  30 
 
 
205 aa  48.9  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  30.59 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  27.72 
 
 
152 aa  48.5  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  30.39 
 
 
151 aa  48.5  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  27.88 
 
 
156 aa  48.1  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  32.58 
 
 
168 aa  48.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  27.5 
 
 
150 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  27.5 
 
 
140 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  27.5 
 
 
150 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  27.5 
 
 
150 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  27.5 
 
 
150 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  27.5 
 
 
150 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  27.5 
 
 
150 aa  48.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  27.5 
 
 
140 aa  47.8  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1046  hypothetical protein  31.52 
 
 
150 aa  47.8  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000583244  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  27.5 
 
 
154 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  34.38 
 
 
157 aa  47.8  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  25 
 
 
157 aa  47.8  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  34.67 
 
 
153 aa  47.8  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  26.74 
 
 
154 aa  47.8  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  27.5 
 
 
154 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  25 
 
 
157 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  30 
 
 
173 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1413  hypothetical protein  26.58 
 
 
205 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149258  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4042  hypothetical protein  32.65 
 
 
178 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0029117  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1066  hypothetical protein  31.52 
 
 
150 aa  47  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000674656  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  29.69 
 
 
151 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2778  hypothetical protein  28.83 
 
 
155 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000007785  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  30.61 
 
 
153 aa  47.4  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  31.25 
 
 
145 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  27.5 
 
 
150 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  29.11 
 
 
153 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  30.36 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  27.5 
 
 
150 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>