242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1413 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1413  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149258  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1424  protein of unknown function DUF150  79.02 
 
 
222 aa  324  6e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2114  hypothetical protein  45.96 
 
 
166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3595  protein of unknown function DUF150  42.5 
 
 
160 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23480  hypothetical protein  40 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0456205 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3968  protein of unknown function DUF150  40.33 
 
 
196 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2492  protein of unknown function DUF150  37.65 
 
 
162 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1507  protein of unknown function DUF150  36.46 
 
 
186 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.417111  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1208  protein of unknown function DUF150  38.32 
 
 
192 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0220811  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7750  protein of unknown function DUF150  41.32 
 
 
203 aa  98.6  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3516  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3193  hypothetical protein  36.69 
 
 
175 aa  98.2  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  37.5 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10290  hypothetical protein  35.71 
 
 
220 aa  95.1  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1518  hypothetical protein  39.02 
 
 
170 aa  94.7  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1017  protein of unknown function DUF150  36.81 
 
 
177 aa  92.8  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5837  hypothetical protein  37.75 
 
 
174 aa  92.4  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14540  hypothetical protein  34.76 
 
 
179 aa  92  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110302  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2150  protein of unknown function DUF150  36.05 
 
 
179 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1418  hypothetical protein  36.59 
 
 
162 aa  89.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1324  hypothetical protein  36.99 
 
 
219 aa  89  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1367  hypothetical protein  37.65 
 
 
220 aa  88.2  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54901  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1058  hypothetical protein  39.18 
 
 
171 aa  88.2  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0222222  normal  0.0438439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0775  hypothetical protein  38.27 
 
 
157 aa  87.8  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.360947  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1440  protein of unknown function DUF150  42.17 
 
 
208 aa  87.8  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06980  hypothetical protein  38.89 
 
 
195 aa  87.4  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.106451  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1712  protein of unknown function DUF150  36.3 
 
 
190 aa  84.3  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2311  hypothetical protein  37.04 
 
 
176 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0442926  normal  0.0676785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1179  hypothetical protein  36.16 
 
 
308 aa  81.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00453705  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2203  protein of unknown function DUF150  46.09 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000153569  decreased coverage  0.000471354 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4042  hypothetical protein  38.03 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0029117  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11450  hypothetical protein  39.69 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0199556  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  31.18 
 
 
161 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  32.93 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3565  hypothetical protein  39.66 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00347083  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  32.34 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  32.74 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2079  hypothetical protein  34.04 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2125  hypothetical protein  34.04 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0426445  normal  0.0108816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2062  hypothetical protein  34.04 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  31.33 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  33.14 
 
 
162 aa  72  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  31.29 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12857  hypothetical protein  41.38 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000766125  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  38.28 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  31.14 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  28.49 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  34 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  30 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2984  hypothetical protein  30.67 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1213  protein of unknown function DUF150  29.41 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  35.85 
 
 
152 aa  64.3  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  30.56 
 
 
153 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  32.67 
 
 
153 aa  63.9  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3420  hypothetical protein  26.17 
 
 
167 aa  63.2  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0151  hypothetical protein  40.74 
 
 
140 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0173  hypothetical protein  40.74 
 
 
140 aa  62.8  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.961573  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  38.76 
 
 
161 aa  62.4  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1677  hypothetical protein  33.91 
 
 
140 aa  62  0.000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00187557  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0357  hypothetical protein  40.96 
 
 
138 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  26.22 
 
 
153 aa  61.2  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1626  protein of unknown function DUF150  32.82 
 
 
154 aa  61.2  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  31.01 
 
 
165 aa  60.5  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0224  hypothetical protein  33.91 
 
 
140 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0370769  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  31.48 
 
 
151 aa  60.5  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  32.32 
 
 
150 aa  59.3  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0133  hypothetical protein  39.51 
 
 
140 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1307  protein of unknown function DUF150  32.56 
 
 
160 aa  60.1  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3639  hypothetical protein  29.7 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125209  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  36.45 
 
 
154 aa  59.7  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0034  protein of unknown function DUF150  29.03 
 
 
160 aa  58.9  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186641  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1497  hypothetical protein  40.74 
 
 
138 aa  58.9  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0657507  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1046  hypothetical protein  29.11 
 
 
150 aa  58.9  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000583244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1329  hypothetical protein  29.7 
 
 
156 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000301231  hitchhiker  0.0000903983 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3855  hypothetical protein  29.7 
 
 
156 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000468139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3668  hypothetical protein  29.7 
 
 
156 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000060287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3558  hypothetical protein  29.7 
 
 
156 aa  58.9  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000119608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3576  hypothetical protein  29.7 
 
 
156 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128893  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3829  hypothetical protein  29.7 
 
 
156 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.0936e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3954  hypothetical protein  29.7 
 
 
156 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590574  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3864  hypothetical protein  29.7 
 
 
156 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000526442  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0298  hypothetical protein  32.19 
 
 
176 aa  58.5  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000302311  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0139  protein of unknown function DUF150  34.78 
 
 
154 aa  58.5  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1359  hypothetical protein  24.85 
 
 
158 aa  58.5  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0045809  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2469  hypothetical protein  31.52 
 
 
156 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000177785  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1066  hypothetical protein  29.75 
 
 
150 aa  58.2  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000674656  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  32.33 
 
 
151 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0695  hypothetical protein  31.54 
 
 
157 aa  57.4  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000302569  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  37.5 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  29.27 
 
 
151 aa  56.2  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08070  hypothetical protein  30.61 
 
 
177 aa  56.6  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0408486  normal  0.217563 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  32.61 
 
 
161 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3915  hypothetical protein  29.09 
 
 
156 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  37.5 
 
 
171 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  32.32 
 
 
157 aa  54.7  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  32.28 
 
 
151 aa  55.1  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1476  protein of unknown function DUF150  37.74 
 
 
143 aa  54.7  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000465706  unclonable  0.0000025252 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1491  hypothetical protein  31.62 
 
 
140 aa  53.5  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00182887  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  34.88 
 
 
153 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  29.93 
 
 
156 aa  53.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>