267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0224 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0224  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0370769  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0151  hypothetical protein  87.86 
 
 		 140 aa  253  8e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0133  hypothetical protein  87.14 
 
 		 140 aa  251  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0173  hypothetical protein  85.71 
 
 		 140 aa  248  3e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.961573  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1491  hypothetical protein  55.4 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00182887  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0357  hypothetical protein  54.68 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1677  hypothetical protein  52.86 
 
 		 140 aa  151  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00187557  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1497  hypothetical protein  53.24 
 
 		 138 aa  150  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0657507  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0250  protein of unknown function DUF150  48.89 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0678  hypothetical protein  38.36 
 
 		 149 aa  103  9e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  35.46 
 
 		 161 aa  84.3  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  36.62 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  33.1 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  32.61 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  35.29 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  38.74 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  36.44 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  33.82 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  37.8 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  36.69 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  37.84 
 
 		 153 aa  76.6  0.00000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  35.29 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  31.36 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  48.19 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0695  hypothetical protein  35.42 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000302569  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  46.99 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  33.9 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0201  hypothetical protein  34.29 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0967046  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  42.86 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0177  hypothetical protein  36.29 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.020604  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  42.86 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0665  hypothetical protein  38.4 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658224 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  33.09 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0813  hypothetical protein  36.72 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000388693  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  44.68 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  41.76 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  41.76 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  34.45 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  30.71 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  34.19 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  31.91 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  42.86 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  30.71 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2114  hypothetical protein  28.78 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  31.39 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  41.76 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  41.76 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  31.39 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1626  protein of unknown function DUF150  37.59 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  31.34 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  31.34 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  31.34 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  41.76 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  40.91 
 
 		 153 aa  72  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  36.36 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  36.36 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  36.36 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  40.66 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  36.36 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  36.36 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  32.35 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  36.36 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  36.36 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  36.36 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  36.36 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  29.29 
 
 		 196 aa  72  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  30.6 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  34.19 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1944  hypothetical protein  37.9 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  38.04 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  30.99 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1662  hypothetical protein  45.05 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  30.88 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  29.08 
 
 		 176 aa  70.5  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  31.36 
 
 		 154 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3595  protein of unknown function DUF150  29.5 
 
 		 160 aa  70.1  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  30.83 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  30.6 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3915  hypothetical protein  36.36 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3864  hypothetical protein  36.36 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000526442  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3855  hypothetical protein  36.36 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000468139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1329  hypothetical protein  36.36 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000301231  hitchhiker  0.0000903983 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3668  hypothetical protein  36.36 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000060287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3558  hypothetical protein  36.36 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000119608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3576  hypothetical protein  36.36 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128893  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  35.45 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3954  hypothetical protein  36.36 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590574  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  34.55 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14540  hypothetical protein  34.03 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3829  hypothetical protein  36.36 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.0936e-62 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  32.48 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  36.36 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  35.45 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  33.09 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  35.45 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  35.45 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2469  hypothetical protein  36.36 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000177785  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3639  hypothetical protein  35.66 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125209  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  35.45 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  35.45 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>