246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0678 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0678  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  296  5e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1491  hypothetical protein  41.38 
 
 
140 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00182887  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0151  hypothetical protein  38.36 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0250  protein of unknown function DUF150  38.85 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1677  hypothetical protein  40.69 
 
 
140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00187557  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0173  hypothetical protein  37.67 
 
 
140 aa  108  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.961573  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0357  hypothetical protein  38.89 
 
 
138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1497  hypothetical protein  38.19 
 
 
138 aa  107  6e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0657507  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0133  hypothetical protein  37.67 
 
 
140 aa  106  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0224  hypothetical protein  38.36 
 
 
140 aa  103  9e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0370769  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  35.62 
 
 
151 aa  87.4  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  34.69 
 
 
153 aa  84.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  34.01 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  37.86 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  34.06 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  32.65 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  32.65 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  30.77 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  34.06 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  32.88 
 
 
153 aa  77  0.00000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  32.61 
 
 
151 aa  77  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  34.06 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  30.14 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  34.58 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  32.61 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0201  hypothetical protein  37.38 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0967046  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  32.61 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  32.61 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  32.61 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  31.51 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  31.76 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0177  hypothetical protein  37.38 
 
 
199 aa  72  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.020604  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  29.77 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  27.46 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  31.76 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  34.35 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  31.51 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  35.59 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  37.29 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  28.95 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  31.16 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  30.82 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  35.51 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  30.53 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  26.76 
 
 
152 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0072  hypothetical protein  27.81 
 
 
166 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.301721 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  30.28 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  31.51 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3730  hypothetical protein  31.54 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.233176  normal  0.972926 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  29.79 
 
 
156 aa  67  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  36.36 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  33.98 
 
 
178 aa  67.4  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  37.27 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  26.35 
 
 
154 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0067  hypothetical protein  27.15 
 
 
166 aa  67  0.00000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  28.26 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  33.05 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  33.05 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  28.87 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  31.58 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  33.05 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  31.29 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  28.77 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0773  protein of unknown function DUF150  32.24 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  34.91 
 
 
199 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  27.4 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  33.64 
 
 
152 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  29.58 
 
 
150 aa  62.8  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  29.58 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  29.58 
 
 
150 aa  62.8  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3160  hypothetical protein  27.22 
 
 
173 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000242539  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  28.08 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  29.58 
 
 
150 aa  62.8  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  28.87 
 
 
140 aa  62  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  31.36 
 
 
169 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  29.58 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  28.87 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  28.87 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  28.87 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  30.28 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  28.77 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  28.87 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  28.87 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  30.28 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2411  protein of unknown function DUF150  29.73 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  28.87 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  30.28 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  28.77 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  30.28 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  31.4 
 
 
150 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  30.28 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  28.77 
 
 
150 aa  62  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  31.4 
 
 
153 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  24.49 
 
 
158 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3037  hypothetical protein  28.47 
 
 
181 aa  60.8  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0110897  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  30.26 
 
 
154 aa  60.5  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  28.87 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>