291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0250 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0250  protein of unknown function DUF150  100 
 
 
142 aa  282  1.0000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1497  hypothetical protein  51.45 
 
 
138 aa  142  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0657507  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0357  hypothetical protein  48.55 
 
 
138 aa  136  8.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1677  hypothetical protein  48.25 
 
 
140 aa  136  1e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00187557  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1491  hypothetical protein  45.99 
 
 
140 aa  133  9e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00182887  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0133  hypothetical protein  51.8 
 
 
140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0151  hypothetical protein  55.04 
 
 
140 aa  131  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0173  hypothetical protein  54.26 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.961573  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0224  hypothetical protein  48.89 
 
 
140 aa  122  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0370769  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0678  hypothetical protein  38.85 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  39.13 
 
 
151 aa  100  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  40.15 
 
 
151 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  40.15 
 
 
151 aa  97.8  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  38.06 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  38.06 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  35.04 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  39.42 
 
 
152 aa  95.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  37.23 
 
 
153 aa  95.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  36.5 
 
 
176 aa  94.4  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  36.76 
 
 
161 aa  94  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  39.55 
 
 
169 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  39.55 
 
 
169 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  36.5 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  36.5 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  36.5 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  36.5 
 
 
154 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  36.5 
 
 
154 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  36.5 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  36.5 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  36.5 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  36.76 
 
 
172 aa  90.1  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  36.15 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  35.77 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  37.23 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  34.35 
 
 
153 aa  88.6  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  38.81 
 
 
152 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  38.81 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  34.72 
 
 
150 aa  88.6  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  35.77 
 
 
150 aa  88.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  36.5 
 
 
165 aa  88.6  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  34.35 
 
 
153 aa  88.2  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  36.92 
 
 
140 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  35.38 
 
 
151 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  35.38 
 
 
151 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  33.09 
 
 
165 aa  88.2  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  35.38 
 
 
151 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  34.04 
 
 
157 aa  87.4  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  35.61 
 
 
152 aa  87.8  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  34.56 
 
 
151 aa  87.4  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  34.56 
 
 
151 aa  87.4  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  35.04 
 
 
150 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  35.04 
 
 
150 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  35.04 
 
 
150 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  35.61 
 
 
152 aa  87  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  35.04 
 
 
154 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  35.04 
 
 
154 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  33.82 
 
 
151 aa  86.7  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  38.39 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  38.06 
 
 
169 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  34.85 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  35.04 
 
 
191 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  33.09 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  33.09 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  33.09 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  34.31 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  34.31 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  35.04 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  33.09 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  34.31 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  35.97 
 
 
153 aa  84.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  36.15 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  35.25 
 
 
161 aa  84.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  35.82 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  34.07 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  38.06 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  33.82 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0665  hypothetical protein  37.96 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  38.53 
 
 
158 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  39.45 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08070  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0408486  normal  0.217563 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  31.85 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  35.56 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  30.99 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  35.04 
 
 
151 aa  80.1  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0155  hypothetical protein  27.92 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  37.5 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  33.56 
 
 
162 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  32.85 
 
 
158 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  29.55 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14540  hypothetical protein  29.77 
 
 
179 aa  77  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110302  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  27.97 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  32.82 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2984  hypothetical protein  36.67 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  27.97 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0067  hypothetical protein  29.25 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  32.35 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  37.96 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0072  hypothetical protein  29.25 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.301721 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1227  protein of unknown function DUF150  27.97 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>