More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_3040 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  354  3.9999999999999996e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  58.9 
 
 
199 aa  190  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  53.66 
 
 
196 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  50 
 
 
203 aa  157  7e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  50 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  48.82 
 
 
206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  48.5 
 
 
204 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  48.5 
 
 
204 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  47.9 
 
 
204 aa  141  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0164  hypothetical protein  48.5 
 
 
204 aa  137  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  47.5 
 
 
225 aa  136  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  49.07 
 
 
286 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  51.33 
 
 
207 aa  135  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4390  hypothetical protein  42.47 
 
 
201 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  45.66 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3438  hypothetical protein  44.44 
 
 
205 aa  127  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4070  hypothetical protein  41.4 
 
 
201 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  43.93 
 
 
238 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1050  hypothetical protein  45.3 
 
 
314 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  43.21 
 
 
219 aa  124  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  43.21 
 
 
219 aa  124  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  43.03 
 
 
259 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  43.93 
 
 
220 aa  122  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  43.37 
 
 
259 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0477  hypothetical protein  44.51 
 
 
272 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.981594  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  42.17 
 
 
262 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  42.59 
 
 
224 aa  121  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  41.62 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  43.87 
 
 
257 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  44.52 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  43.12 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  40.36 
 
 
263 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  43.62 
 
 
153 aa  115  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1251  hypothetical protein  40.13 
 
 
209 aa  114  8.999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  41.71 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2493  hypothetical protein  41.72 
 
 
186 aa  112  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0301958  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0222  hypothetical protein  41.56 
 
 
201 aa  112  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0609  hypothetical protein  42.01 
 
 
181 aa  111  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  41.28 
 
 
251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  41.28 
 
 
251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  42.28 
 
 
151 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  41.33 
 
 
186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  42.14 
 
 
279 aa  106  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  40 
 
 
176 aa  104  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  40.43 
 
 
150 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  41.06 
 
 
152 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  41.06 
 
 
152 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  40.14 
 
 
153 aa  102  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08070  hypothetical protein  39.86 
 
 
177 aa  102  4e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0408486  normal  0.217563 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  35.14 
 
 
151 aa  97.8  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  40.27 
 
 
151 aa  96.7  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  39.16 
 
 
161 aa  97.1  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  39.37 
 
 
140 aa  97.1  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  45.1 
 
 
153 aa  96.3  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  45.1 
 
 
150 aa  96.3  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  37.59 
 
 
153 aa  96.7  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  37.76 
 
 
153 aa  95.1  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  35.1 
 
 
157 aa  95.1  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  40.32 
 
 
161 aa  95.1  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  39.33 
 
 
159 aa  93.6  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  31.54 
 
 
152 aa  93.2  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  45.13 
 
 
145 aa  93.2  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  39.68 
 
 
153 aa  92.8  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  37.8 
 
 
154 aa  92.8  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3856  protein of unknown function DUF150  34.78 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.0726856 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  37.01 
 
 
154 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  37.01 
 
 
150 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  37.01 
 
 
150 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  37.01 
 
 
150 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  37.01 
 
 
154 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  39.74 
 
 
161 aa  92.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  40.4 
 
 
152 aa  92  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  37.01 
 
 
150 aa  92  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  31.54 
 
 
152 aa  92  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  39.23 
 
 
151 aa  92  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  43.8 
 
 
169 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  37.3 
 
 
150 aa  91.3  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  38.71 
 
 
151 aa  91.3  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  37.3 
 
 
150 aa  91.3  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  39.83 
 
 
151 aa  91.3  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  37.3 
 
 
150 aa  91.3  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  37.3 
 
 
150 aa  91.3  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  37.3 
 
 
150 aa  91.3  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  37.3 
 
 
150 aa  91.3  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  37.3 
 
 
154 aa  90.9  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  37.3 
 
 
154 aa  90.9  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  39.81 
 
 
165 aa  90.9  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  38.71 
 
 
153 aa  90.9  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  37.01 
 
 
140 aa  90.9  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  37.3 
 
 
150 aa  90.9  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  37.3 
 
 
150 aa  90.9  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  37.3 
 
 
150 aa  90.9  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  42.98 
 
 
169 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  38.89 
 
 
151 aa  90.1  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  39.81 
 
 
151 aa  90.9  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  42.15 
 
 
152 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  41.32 
 
 
173 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  35.88 
 
 
165 aa  90.5  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  42.98 
 
 
169 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  36.29 
 
 
151 aa  90.5  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>