215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1440 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1440  protein of unknown function DUF150  100 
 
 		 208 aa  393  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2114  hypothetical protein  51.63 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  46.52 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3595  protein of unknown function DUF150  44.97 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3968  protein of unknown function DUF150  50.29 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1413  hypothetical protein  44.52 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149258  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2492  protein of unknown function DUF150  46.01 
 
 		 162 aa  108  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3193  hypothetical protein  45.33 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1424  protein of unknown function DUF150  42.86 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1418  hypothetical protein  45.61 
 
 		 162 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1507  protein of unknown function DUF150  48.41 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.417111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5837  hypothetical protein  43.89 
 
 		 174 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14540  hypothetical protein  43.71 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0775  hypothetical protein  43.11 
 
 		 157 aa  99.8  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.360947  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10290  hypothetical protein  42.77 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1058  hypothetical protein  48.32 
 
 		 171 aa  97.1  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0222222  normal  0.0438439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1367  hypothetical protein  44.57 
 
 		 220 aa  95.5  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54901  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1324  hypothetical protein  44.79 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23480  hypothetical protein  41.33 
 
 		 181 aa  90.5  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0456205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7750  protein of unknown function DUF150  42.19 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1518  hypothetical protein  39.33 
 
 		 170 aa  84.7  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2079  hypothetical protein  39.89 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11450  hypothetical protein  41.07 
 
 		 160 aa  80.9  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0199556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2125  hypothetical protein  39.89 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0426445  normal  0.0108816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2062  hypothetical protein  39.89 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2311  hypothetical protein  41.5 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0442926  normal  0.0676785 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2150  protein of unknown function DUF150  40.27 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4042  hypothetical protein  42.86 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0029117  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1208  protein of unknown function DUF150  50 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0220811  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3565  hypothetical protein  56.41 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00347083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1017  protein of unknown function DUF150  36.42 
 
 		 177 aa  73.9  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1712  protein of unknown function DUF150  41.28 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3420  hypothetical protein  32.24 
 
 		 167 aa  72  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12857  hypothetical protein  38.65 
 
 		 183 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000766125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2203  protein of unknown function DUF150  37.3 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000153569  decreased coverage  0.000471354 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  45.35 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1179  hypothetical protein  39.64 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00453705  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06980  hypothetical protein  47.47 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.106451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  37.86 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  41.38 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1213  protein of unknown function DUF150  40.23 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  30.82 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  31.48 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0810  hypothetical protein  35.04 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0615439  hitchhiker  0.00120973 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  44.19 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  40.7 
 
 		 154 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08070  hypothetical protein  39.33 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0408486  normal  0.217563 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  36.54 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  32.48 
 
 		 151 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1046  hypothetical protein  32.43 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000583244  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1066  hypothetical protein  32.43 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000674656  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  35.4 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09340  hypothetical protein  41.46 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000007629  normal  0.602574 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0133  hypothetical protein  34 
 
 		 140 aa  54.3  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  39.22 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  38.2 
 
 		 157 aa  54.3  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  35.65 
 
 		 150 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0034  protein of unknown function DUF150  31.36 
 
 		 160 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186641  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  37.39 
 
 		 150 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  37.39 
 
 		 150 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  37.39 
 
 		 150 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0896  hypothetical protein  37.8 
 
 		 139 aa  53.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000785256  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  37.93 
 
 		 161 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  35.65 
 
 		 150 aa  53.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  31.78 
 
 		 154 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2984  hypothetical protein  37.89 
 
 		 160 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1677  hypothetical protein  34.29 
 
 		 140 aa  53.5  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00187557  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  35.65 
 
 		 150 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  38.3 
 
 		 160 aa  52.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  30.56 
 
 		 151 aa  53.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  37.93 
 
 		 152 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0173  hypothetical protein  30.43 
 
 		 140 aa  53.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.961573  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  37.93 
 
 		 152 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  38.26 
 
 		 150 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  38.26 
 
 		 150 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  38.26 
 
 		 150 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  38.26 
 
 		 150 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  38.26 
 
 		 150 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  38.26 
 
 		 150 aa  52.8  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  39.08 
 
 		 150 aa  52.4  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0151  hypothetical protein  29.57 
 
 		 140 aa  52.4  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  52  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0606  protein of unknown function DUF150  25.18 
 
 		 147 aa  52  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000662285  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  36.21 
 
 		 151 aa  52  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  36.52 
 
 		 154 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  36.52 
 
 		 154 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4219  hypothetical protein  35.87 
 
 		 169 aa  52  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000438537  normal  0.129114 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  33.01 
 
 		 151 aa  51.6  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  48.28 
 
 		 153 aa  51.6  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  48.28 
 
 		 153 aa  51.6  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  37.39 
 
 		 154 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  35.71 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0487  hypothetical protein  36.52 
 
 		 150 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249933  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  35.59 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  42.5 
 
 		 161 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  33.62 
 
 		 165 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  37.39 
 
 		 154 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  32.04 
 
 		 157 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1050  hypothetical protein  38.14 
 
 		 314 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1159  protein of unknown function DUF150  37.27 
 
 		 171 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>