213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1712 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1712  protein of unknown function DUF150  100 
 
 
190 aa  367  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2311  hypothetical protein  45.1 
 
 
176 aa  108  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0442926  normal  0.0676785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3968  protein of unknown function DUF150  39.62 
 
 
196 aa  105  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14540  hypothetical protein  38.85 
 
 
179 aa  104  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110302  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4042  hypothetical protein  40.76 
 
 
178 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0029117  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2079  hypothetical protein  37.65 
 
 
192 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2125  hypothetical protein  37.65 
 
 
192 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0426445  normal  0.0108816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2062  hypothetical protein  37.65 
 
 
192 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2150  protein of unknown function DUF150  38.22 
 
 
179 aa  102  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3595  protein of unknown function DUF150  39.35 
 
 
160 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1418  hypothetical protein  36.94 
 
 
162 aa  99.8  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3193  hypothetical protein  40.43 
 
 
175 aa  94.7  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  37.18 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7750  protein of unknown function DUF150  35.9 
 
 
203 aa  92.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3516  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12857  hypothetical protein  37.8 
 
 
183 aa  90.9  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000766125  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2114  hypothetical protein  38.93 
 
 
166 aa  89  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1367  hypothetical protein  35.29 
 
 
220 aa  88.2  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54901  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1058  hypothetical protein  42.38 
 
 
171 aa  88.2  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0222222  normal  0.0438439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0775  hypothetical protein  40.79 
 
 
157 aa  87.8  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.360947  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5837  hypothetical protein  34.76 
 
 
174 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1413  hypothetical protein  33.12 
 
 
205 aa  85.5  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149258  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1324  hypothetical protein  35.71 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1518  hypothetical protein  32.08 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1507  protein of unknown function DUF150  42.19 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.417111  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1424  protein of unknown function DUF150  36.73 
 
 
222 aa  81.3  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23480  hypothetical protein  34.62 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0456205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2492  protein of unknown function DUF150  38.16 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1017  protein of unknown function DUF150  35.71 
 
 
177 aa  75.1  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10290  hypothetical protein  38.46 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2203  protein of unknown function DUF150  38.85 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000153569  decreased coverage  0.000471354 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11450  hypothetical protein  35.48 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0199556  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1440  protein of unknown function DUF150  40.12 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1208  protein of unknown function DUF150  45.79 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0220811  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3565  hypothetical protein  37.93 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00347083  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1179  hypothetical protein  36.84 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00453705  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3420  hypothetical protein  27.22 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1213  protein of unknown function DUF150  32.71 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0034  protein of unknown function DUF150  30.19 
 
 
160 aa  63.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186641  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  36.36 
 
 
153 aa  63.2  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  36.36 
 
 
153 aa  62.8  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  32.08 
 
 
153 aa  60.5  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06980  hypothetical protein  32.73 
 
 
195 aa  60.8  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.106451  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  30.92 
 
 
251 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  30.92 
 
 
251 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  31.63 
 
 
157 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  32.65 
 
 
159 aa  58.9  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  31.63 
 
 
157 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  28.93 
 
 
161 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  32.89 
 
 
257 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  29.03 
 
 
152 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  32.99 
 
 
161 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  32.08 
 
 
151 aa  57.8  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  28.03 
 
 
159 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  28.04 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  29.33 
 
 
201 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0665  hypothetical protein  30.1 
 
 
152 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658224 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0695  hypothetical protein  30.08 
 
 
157 aa  57  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000302569  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  29.61 
 
 
255 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  33.02 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  28.04 
 
 
151 aa  55.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3855  hypothetical protein  27.34 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000468139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3668  hypothetical protein  27.34 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000060287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3558  hypothetical protein  27.34 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000119608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3576  hypothetical protein  27.34 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128893  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3954  hypothetical protein  27.34 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590574  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1329  hypothetical protein  27.34 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000301231  hitchhiker  0.0000903983 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3864  hypothetical protein  27.34 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000526442  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3829  hypothetical protein  27.34 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.0936e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3915  hypothetical protein  27.34 
 
 
156 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  29.14 
 
 
238 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0813  hypothetical protein  32 
 
 
157 aa  54.7  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000388693  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  27.1 
 
 
151 aa  54.7  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  31.82 
 
 
151 aa  54.7  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  32.08 
 
 
159 aa  53.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  29.92 
 
 
154 aa  54.3  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  31.03 
 
 
151 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3639  hypothetical protein  26.77 
 
 
156 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125209  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  24.24 
 
 
151 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  31.78 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  28 
 
 
154 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2430  hypothetical protein  32.35 
 
 
172 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  53.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2469  hypothetical protein  27.34 
 
 
156 aa  53.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000177785  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08070  hypothetical protein  31.58 
 
 
177 aa  53.1  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0408486  normal  0.217563 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  30.68 
 
 
151 aa  52.8  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  30.19 
 
 
150 aa  52.4  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  30.19 
 
 
150 aa  52.4  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  30.19 
 
 
150 aa  52.4  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  32.18 
 
 
151 aa  52  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  29.2 
 
 
165 aa  51.6  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  34.67 
 
 
140 aa  51.6  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  29.29 
 
 
173 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  30.3 
 
 
157 aa  50.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  30.21 
 
 
158 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  28.04 
 
 
153 aa  50.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1813  protein of unknown function DUF150  29.52 
 
 
159 aa  50.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.549773  normal  0.686814 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  31.03 
 
 
151 aa  50.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  28.28 
 
 
159 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  30.21 
 
 
158 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  29 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>