257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0775 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0775  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  307  4e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.360947  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3595  protein of unknown function DUF150  67.5 
 
 
160 aa  219  8e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  63.38 
 
 
205 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2114  hypothetical protein  56.58 
 
 
166 aa  169  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3968  protein of unknown function DUF150  51.85 
 
 
196 aa  139  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3193  hypothetical protein  50 
 
 
175 aa  138  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1058  hypothetical protein  56.67 
 
 
171 aa  136  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0222222  normal  0.0438439 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2492  protein of unknown function DUF150  45.95 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1418  hypothetical protein  46.71 
 
 
162 aa  127  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1367  hypothetical protein  45.22 
 
 
220 aa  127  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54901  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14540  hypothetical protein  45.64 
 
 
179 aa  127  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110302  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7750  protein of unknown function DUF150  47.13 
 
 
203 aa  123  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3516  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1324  hypothetical protein  46.1 
 
 
219 aa  123  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5837  hypothetical protein  46.15 
 
 
174 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1518  hypothetical protein  42.14 
 
 
170 aa  103  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1413  hypothetical protein  39.51 
 
 
205 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149258  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1017  protein of unknown function DUF150  43.26 
 
 
177 aa  97.1  8e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11450  hypothetical protein  38.04 
 
 
160 aa  97.1  9e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0199556  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1424  protein of unknown function DUF150  38.75 
 
 
222 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1712  protein of unknown function DUF150  44 
 
 
190 aa  95.1  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  42.74 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1440  protein of unknown function DUF150  47.86 
 
 
208 aa  93.2  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23480  hypothetical protein  37.04 
 
 
181 aa  92.8  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0456205 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2150  protein of unknown function DUF150  39.47 
 
 
179 aa  91.7  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  39.37 
 
 
157 aa  91.3  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  32.03 
 
 
153 aa  90.5  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2311  hypothetical protein  42.75 
 
 
176 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0442926  normal  0.0676785 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1507  protein of unknown function DUF150  45.45 
 
 
186 aa  87.4  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.417111  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1208  protein of unknown function DUF150  39.75 
 
 
192 aa  84.7  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0220811  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  34.27 
 
 
157 aa  84.7  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4042  hypothetical protein  39.13 
 
 
178 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0029117  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3565  hypothetical protein  45.28 
 
 
268 aa  84.7  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00347083  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1179  hypothetical protein  39.52 
 
 
308 aa  84  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00453705  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  30.41 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0034  protein of unknown function DUF150  29.75 
 
 
160 aa  82  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186641  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2079  hypothetical protein  37.97 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2125  hypothetical protein  37.97 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0426445  normal  0.0108816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2062  hypothetical protein  37.97 
 
 
192 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  34.27 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1048  hypothetical protein  31.29 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000120853  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  30.92 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  29.05 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  43.14 
 
 
159 aa  77  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2203  protein of unknown function DUF150  47.74 
 
 
173 aa  77  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000153569  decreased coverage  0.000471354 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10290  hypothetical protein  42.73 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  30.82 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  27.21 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  34.97 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  31.51 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  31.51 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  30.82 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  29.17 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  28.38 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  30.82 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  30.82 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  28.77 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  32.35 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  32.24 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  30.14 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  30.41 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  33.11 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  33.11 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  32.21 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  32.65 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  33.56 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  32.24 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  31.21 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  29.14 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  28.47 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  29.25 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  29.25 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  29.25 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2469  hypothetical protein  35.48 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000177785  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1329  hypothetical protein  33.62 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000301231  hitchhiker  0.0000903983 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3855  hypothetical protein  33.62 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000468139  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3915  hypothetical protein  33.62 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3668  hypothetical protein  33.62 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000060287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3558  hypothetical protein  33.62 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000119608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3576  hypothetical protein  33.62 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3864  hypothetical protein  33.62 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000526442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3954  hypothetical protein  33.62 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3829  hypothetical protein  33.62 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.0936e-62 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  27.92 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  30.92 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  27.92 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  28.77 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  28.77 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  28.77 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  28.77 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  34 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  34.86 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  27.27 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  27.27 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  29.73 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  28.19 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12857  hypothetical protein  33.79 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000766125  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>