235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11450 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_11450  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  308  1e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0199556  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3595  protein of unknown function DUF150  43.56 
 
 
160 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3193  hypothetical protein  46.15 
 
 
175 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2114  hypothetical protein  42.31 
 
 
166 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  41.38 
 
 
205 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23480  hypothetical protein  42.04 
 
 
181 aa  92  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0456205 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3968  protein of unknown function DUF150  39.01 
 
 
196 aa  90.5  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1418  hypothetical protein  42 
 
 
162 aa  89.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0775  hypothetical protein  36.81 
 
 
157 aa  84.3  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.360947  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1017  protein of unknown function DUF150  37.16 
 
 
177 aa  84.3  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1058  hypothetical protein  39.38 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0222222  normal  0.0438439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14540  hypothetical protein  35.62 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110302  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1367  hypothetical protein  41.86 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54901  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1413  hypothetical protein  39.69 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149258  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2492  protein of unknown function DUF150  36.54 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1208  protein of unknown function DUF150  40.13 
 
 
192 aa  74.3  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0220811  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1324  hypothetical protein  36.84 
 
 
219 aa  74.3  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1424  protein of unknown function DUF150  34.87 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1518  hypothetical protein  32.75 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10290  hypothetical protein  36.09 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1507  protein of unknown function DUF150  40.8 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.417111  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  36.02 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2311  hypothetical protein  34.81 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0442926  normal  0.0676785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7750  protein of unknown function DUF150  38.94 
 
 
203 aa  67.8  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3516  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12857  hypothetical protein  37.11 
 
 
183 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000766125  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  33.04 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5837  hypothetical protein  36.89 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  34.53 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1712  protein of unknown function DUF150  36.97 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  34.53 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  30.72 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  32.09 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  31.94 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4042  hypothetical protein  38.46 
 
 
178 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0029117  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2203  protein of unknown function DUF150  42.06 
 
 
173 aa  64.3  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000153569  decreased coverage  0.000471354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2079  hypothetical protein  35.86 
 
 
192 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2125  hypothetical protein  35.86 
 
 
192 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0426445  normal  0.0108816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2062  hypothetical protein  35.86 
 
 
192 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2984  hypothetical protein  34.07 
 
 
160 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49788e-30 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  32.41 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  32.41 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  32.41 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  36.61 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0155  hypothetical protein  32.23 
 
 
166 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  32.41 
 
 
151 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0133  hypothetical protein  31.2 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  34.82 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  43.33 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  31.51 
 
 
151 aa  60.8  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  43.48 
 
 
154 aa  60.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1299  hypothetical protein  32.59 
 
 
160 aa  60.8  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613288  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  34.23 
 
 
153 aa  60.5  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  35.25 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  31.03 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  31.03 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  35 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  31.34 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  30 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1440  protein of unknown function DUF150  41.53 
 
 
208 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  31.03 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0173  hypothetical protein  38.27 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.961573  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  31.25 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  31.62 
 
 
151 aa  58.9  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  33.61 
 
 
157 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  30.56 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3680  hypothetical protein  32.86 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000126023  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  30.82 
 
 
151 aa  58.9  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  30.33 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  32.77 
 
 
173 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  30.34 
 
 
151 aa  58.2  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1213  protein of unknown function DUF150  40 
 
 
170 aa  58.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1233  hypothetical protein  31.78 
 
 
155 aa  58.2  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000841958  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0995  hypothetical protein  34.11 
 
 
154 aa  58.2  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000184773  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  33.91 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2150  protein of unknown function DUF150  31.41 
 
 
179 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1476  protein of unknown function DUF150  30.94 
 
 
143 aa  57.8  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000465706  unclonable  0.0000025252 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0832  protein of unknown function DUF150  35.14 
 
 
164 aa  57.8  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000130104  hitchhiker  0.000000375903 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  34.58 
 
 
150 aa  57.4  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  34.58 
 
 
150 aa  57.4  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  34.58 
 
 
150 aa  57.4  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  31.09 
 
 
158 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3565  hypothetical protein  46.48 
 
 
268 aa  57  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00347083  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  32.77 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09340  hypothetical protein  33.58 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000007629  normal  0.602574 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  27.78 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3420  hypothetical protein  34.18 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  30.84 
 
 
153 aa  57  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  32.77 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  32.77 
 
 
157 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0067  hypothetical protein  28.77 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  32.09 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0151  hypothetical protein  37.04 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  34.91 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0665  hypothetical protein  29.46 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658224 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  33.94 
 
 
196 aa  55.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  34.62 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  27.27 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  35 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  32.52 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>