More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3820 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  367  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0609  hypothetical protein  60.67 
 
 		 181 aa  205  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2493  hypothetical protein  55.74 
 
 		 186 aa  188  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0301958  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  46.88 
 
 		 238 aa  131  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  46.88 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  44.44 
 
 		 251 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  42.68 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  44.44 
 
 		 251 aa  125  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  40.43 
 
 		 206 aa  125  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  44.3 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  41.46 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  43.67 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  43.67 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  45.45 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  41.81 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0222  hypothetical protein  45.45 
 
 		 201 aa  123  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  46.3 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  40.22 
 
 		 207 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  44.94 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  51.37 
 
 		 286 aa  121  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  43.51 
 
 		 194 aa  121  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  39.46 
 
 		 255 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  42.59 
 
 		 225 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  43.95 
 
 		 262 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  42.21 
 
 		 204 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  42.21 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  43.62 
 
 		 259 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  40.51 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  43.95 
 
 		 259 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3438  hypothetical protein  44.44 
 
 		 205 aa  114  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  44 
 
 		 253 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4390  hypothetical protein  41.03 
 
 		 201 aa  111  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0477  hypothetical protein  44.3 
 
 		 272 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.981594  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4070  hypothetical protein  40.38 
 
 		 201 aa  110  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1251  hypothetical protein  40.38 
 
 		 209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  41.33 
 
 		 178 aa  108  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  41.5 
 
 		 260 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  39.49 
 
 		 263 aa  106  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0164  hypothetical protein  42.58 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1440  protein of unknown function DUF150  38.26 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.266374  normal  0.102283 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  37.67 
 
 		 153 aa  102  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  38.78 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  37.76 
 
 		 159 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1050  hypothetical protein  40.52 
 
 		 314 aa  99  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  40.13 
 
 		 153 aa  98.2  5e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  42.57 
 
 		 279 aa  98.6  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  37.58 
 
 		 154 aa  98.2  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  38.26 
 
 		 151 aa  97.4  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  33.55 
 
 		 158 aa  97.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  38.82 
 
 		 153 aa  95.1  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  35.57 
 
 		 153 aa  94.4  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  39.04 
 
 		 176 aa  94.4  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3855  hypothetical protein  34.72 
 
 		 156 aa  92  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000468139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3668  hypothetical protein  34.72 
 
 		 156 aa  92  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000060287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3558  hypothetical protein  34.72 
 
 		 156 aa  92  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000119608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3576  hypothetical protein  34.72 
 
 		 156 aa  92  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128893  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  38.36 
 
 		 154 aa  92  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3829  hypothetical protein  34.72 
 
 		 156 aa  92  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.0936e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3954  hypothetical protein  34.72 
 
 		 156 aa  92  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590574  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3864  hypothetical protein  34.72 
 
 		 156 aa  92  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000526442  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1329  hypothetical protein  34.72 
 
 		 156 aa  92  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000301231  hitchhiker  0.0000903983 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3639  hypothetical protein  34.03 
 
 		 156 aa  92  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125209  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2469  hypothetical protein  34.93 
 
 		 156 aa  91.7  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000177785  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  38.79 
 
 		 152 aa  90.5  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1961  hypothetical protein  32.19 
 
 		 153 aa  90.5  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00677493  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  35.81 
 
 		 161 aa  90.5  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  32.17 
 
 		 152 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3915  hypothetical protein  34.03 
 
 		 156 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  35.71 
 
 		 165 aa  88.6  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  35.42 
 
 		 151 aa  88.2  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  35.42 
 
 		 151 aa  88.2  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  35.42 
 
 		 151 aa  88.2  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  35.42 
 
 		 151 aa  88.2  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  31.47 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  36.09 
 
 		 151 aa  86.3  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  30.2 
 
 		 153 aa  86.7  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  36.71 
 
 		 196 aa  86.3  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  32.64 
 
 		 157 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  33.56 
 
 		 152 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  33.56 
 
 		 152 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  34.03 
 
 		 151 aa  85.1  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  36.11 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08070  hypothetical protein  36.84 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0408486  normal  0.217563 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  36.11 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  31.25 
 
 		 153 aa  84  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  36.11 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  36.11 
 
 		 154 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  36.11 
 
 		 154 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1813  protein of unknown function DUF150  38.85 
 
 		 159 aa  84  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.549773  normal  0.686814 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  34.25 
 
 		 157 aa  84  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  36.11 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  36.11 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  36.11 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09340  hypothetical protein  32.65 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000007629  normal  0.602574 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  35.42 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  35.42 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  35.42 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  35.42 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  35.42 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  32.64 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>