242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_2116 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_2116  di-/tripeptide transporter  100 
 
 		 492 aa  978    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1932  amino acid/peptide transporter  43.88 
 
 		 536 aa  408  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000463259  hitchhiker  0.00239553 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1490  hypothetical protein  41.26 
 
 		 495 aa  375  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1493  hypothetical protein  40.84 
 
 		 495 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2148  hypothetical protein  34.73 
 
 		 493 aa  305  9.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2122  hypothetical protein  33.68 
 
 		 493 aa  292  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0006  hypothetical protein  35.14 
 
 		 484 aa  277  3e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.28636  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0003  hypothetical protein  34.44 
 
 		 484 aa  263  4.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.992067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  27.2 
 
 		 495 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  28.25 
 
 		 501 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  28.25 
 
 		 501 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  28.25 
 
 		 501 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  28.04 
 
 		 501 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  27.84 
 
 		 501 aa  173  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3785  inner membrane transporter YhiP  26.26 
 
 		 490 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0323752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3966  inner membrane transporter YhiP  26.48 
 
 		 490 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.826151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3795  inner membrane transporter YhiP  26.27 
 
 		 490 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3905  inner membrane transporter YhiP  26.27 
 
 		 490 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3862  inner membrane transporter YhiP  26.27 
 
 		 490 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31175  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  27.62 
 
 		 500 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2006  amino acid/peptide transporter  27.62 
 
 		 500 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0749107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2346  putative tripeptide transporter permease  27.62 
 
 		 500 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0609489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  27.62 
 
 		 500 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1995  putative tripeptide transporter permease  27.62 
 
 		 500 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46141  normal  0.0309863 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01594  hypothetical protein  27.62 
 
 		 500 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00471162  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  27.62 
 
 		 500 aa  167  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  27.62 
 
 		 500 aa  167  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  27.62 
 
 		 500 aa  167  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4843  inner membrane transporter YhiP  25.51 
 
 		 489 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.953433 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0219  amino acid/peptide transporter  24.95 
 
 		 489 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0220  inner membrane transporter YhiP  24.95 
 
 		 489 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3696  inner membrane transporter YhiP  24.95 
 
 		 489 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3826  inner membrane transporter YhiP  24.74 
 
 		 489 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03345  predicted transporter  24.74 
 
 		 489 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3978  inner membrane transporter YhiP  24.74 
 
 		 489 aa  164  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03298  hypothetical protein  24.74 
 
 		 489 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.240113  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0652  tripeptide permease TppB  27.42 
 
 		 504 aa  164  5.0000000000000005e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.068993  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3785  inner membrane transporter YhiP  24.74 
 
 		 489 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  28.36 
 
 		 502 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1525  di-/tripeptide transporter  27.59 
 
 		 528 aa  162  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0251804  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  26.67 
 
 		 506 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  25.36 
 
 		 506 aa  152  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  25.93 
 
 		 492 aa  150  5e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  25.93 
 
 		 492 aa  149  8e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2720  hypothetical protein  25.72 
 
 		 500 aa  143  6e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0509  putative tripeptide transporter permease  23.76 
 
 		 514 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2233  putative tripeptide transporter permease  25.31 
 
 		 506 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2851  hypothetical protein  25.51 
 
 		 500 aa  142  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  24.95 
 
 		 516 aa  136  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  25.75 
 
 		 499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1778  putative tripeptide transporter permease  24.48 
 
 		 501 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1886  putative tripeptide transporter permease  24.48 
 
 		 511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348979  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2548  putative tripeptide transporter permease  23.75 
 
 		 488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  25.74 
 
 		 501 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  24.55 
 
 		 516 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  24.54 
 
 		 494 aa  126  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  25.84 
 
 		 528 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  23.71 
 
 		 507 aa  124  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  25.83 
 
 		 495 aa  123  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  25.1 
 
 		 498 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  23.95 
 
 		 510 aa  121  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  25.2 
 
 		 497 aa  120  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  23.78 
 
 		 499 aa  120  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  23.72 
 
 		 527 aa  117  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  23.4 
 
 		 510 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  24.18 
 
 		 497 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  24.25 
 
 		 534 aa  114  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0759  major facilitator superfamily peptide/H(+)symporter  25.21 
 
 		 513 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  26.53 
 
 		 497 aa  113  8.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  23.8 
 
 		 509 aa  113  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  23.31 
 
 		 498 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  23.6 
 
 		 497 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  24.56 
 
 		 501 aa  107  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  24.56 
 
 		 501 aa  107  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  24.5 
 
 		 502 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  25.64 
 
 		 504 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  23.73 
 
 		 517 aa  104  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  24.94 
 
 		 496 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2239  amino acid/peptide transporter  25.69 
 
 		 603 aa  103  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478529  normal  0.0257492 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  22.96 
 
 		 524 aa  103  7e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  24.78 
 
 		 512 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  24.78 
 
 		 512 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  23.64 
 
 		 507 aa  102  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  23.52 
 
 		 517 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  24.78 
 
 		 501 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4440  amino acid/peptide transporter  24.32 
 
 		 513 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1102  amino acid/peptide transporter  21.15 
 
 		 546 aa  100  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3089  amino acid/peptide transporter  20.94 
 
 		 516 aa  100  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000368989  normal  0.0911268 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0770  inner membrane transporter YbgH  26.11 
 
 		 493 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.493131 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3261  amino acid/peptide transporter  24.39 
 
 		 506 aa  99.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0234728 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3183  amino acid/peptide transporter  22.53 
 
 		 517 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0376329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  22.84 
 
 		 497 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0867  inner membrane transporter YbgH  26.05 
 
 		 493 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0818  inner membrane transporter YbgH  26.11 
 
 		 493 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0832  inner membrane transporter YbgH  26.11 
 
 		 493 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  hitchhiker  0.00189799 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2910  amino acid/peptide transporter  20.94 
 
 		 516 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.380758  normal  0.476442 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2992  amino acid/peptide transporter  20.94 
 
 		 516 aa  99  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0360187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0757  inner membrane transporter YbgH  26.11 
 
 		 493 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1117  amino acid/peptide transporter  21.15 
 
 		 523 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  23.88 
 
 		 489 aa  98.2  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>