262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0006 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006365  plpp0006  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  966    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.28636  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0003  hypothetical protein  76.24 
 
 		 484 aa  733    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.992067  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2148  hypothetical protein  41.34 
 
 		 493 aa  376  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2122  hypothetical protein  40.83 
 
 		 493 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1493  hypothetical protein  39.5 
 
 		 495 aa  352  7e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1490  hypothetical protein  39.09 
 
 		 495 aa  349  6e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1932  amino acid/peptide transporter  35.29 
 
 		 536 aa  315  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000463259  hitchhiker  0.00239553 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2116  di-/tripeptide transporter  35.14 
 
 		 492 aa  282  1e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  26.36 
 
 		 502 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  26.07 
 
 		 501 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  26.07 
 
 		 501 aa  144  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  25.85 
 
 		 501 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  26.07 
 
 		 501 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  26.07 
 
 		 501 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  24.78 
 
 		 500 aa  137  4e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  24.78 
 
 		 500 aa  137  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  24.78 
 
 		 500 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2006  amino acid/peptide transporter  24.78 
 
 		 500 aa  137  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0749107  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  24.78 
 
 		 500 aa  137  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  24.78 
 
 		 500 aa  137  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01594  hypothetical protein  24.78 
 
 		 500 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00471162  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1995  putative tripeptide transporter permease  24.78 
 
 		 500 aa  137  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46141  normal  0.0309863 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2346  putative tripeptide transporter permease  23.89 
 
 		 500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0609489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  22.69 
 
 		 506 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0509  putative tripeptide transporter permease  24.89 
 
 		 514 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  23.9 
 
 		 506 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  24.94 
 
 		 501 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  26.81 
 
 		 492 aa  119  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  26.57 
 
 		 492 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2720  hypothetical protein  25 
 
 		 500 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2851  hypothetical protein  25.1 
 
 		 500 aa  118  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3785  inner membrane transporter YhiP  23.14 
 
 		 490 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0323752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  23.59 
 
 		 516 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  23.71 
 
 		 516 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0652  tripeptide permease TppB  24.74 
 
 		 504 aa  115  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.068993  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1525  di-/tripeptide transporter  24.32 
 
 		 528 aa  114  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0251804  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  23.86 
 
 		 517 aa  114  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3826  inner membrane transporter YhiP  23.72 
 
 		 489 aa  114  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03345  predicted transporter  23.72 
 
 		 489 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3978  inner membrane transporter YhiP  23.72 
 
 		 489 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03298  hypothetical protein  23.72 
 
 		 489 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.240113  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0219  amino acid/peptide transporter  23.49 
 
 		 489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0220  inner membrane transporter YhiP  23.49 
 
 		 489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  22.85 
 
 		 499 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2233  putative tripeptide transporter permease  24.55 
 
 		 506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3696  inner membrane transporter YhiP  23.49 
 
 		 489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  22.05 
 
 		 509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3966  inner membrane transporter YhiP  23.64 
 
 		 490 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.826151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3905  inner membrane transporter YhiP  23.64 
 
 		 490 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3862  inner membrane transporter YhiP  23.64 
 
 		 490 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3795  inner membrane transporter YhiP  23.64 
 
 		 490 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2548  putative tripeptide transporter permease  22.98 
 
 		 488 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1886  putative tripeptide transporter permease  22.98 
 
 		 511 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348979  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1778  putative tripeptide transporter permease  22.98 
 
 		 501 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2936  inner membrane transporter YbgH  22.97 
 
 		 486 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3785  inner membrane transporter YhiP  23.49 
 
 		 489 aa  110  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2823  inner membrane transporter YbgH  22.97 
 
 		 486 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2802  inner membrane transporter YbgH  22.97 
 
 		 486 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.883594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2761  inner membrane transporter YbgH  22.97 
 
 		 486 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2719  inner membrane transporter YbgH  22.97 
 
 		 486 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.945342  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4843  inner membrane transporter YhiP  23.26 
 
 		 489 aa  110  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  23.47 
 
 		 527 aa  110  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  23.27 
 
 		 494 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3766  amino acid/peptide transporter  23.64 
 
 		 482 aa  107  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000840749  normal  0.111557 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  22.36 
 
 		 517 aa  107  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  24.07 
 
 		 499 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  21.51 
 
 		 462 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0832  inner membrane transporter YbgH  24.15 
 
 		 493 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  hitchhiker  0.00189799 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0867  inner membrane transporter YbgH  24.15 
 
 		 493 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0770  inner membrane transporter YbgH  24.15 
 
 		 493 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.493131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0757  inner membrane transporter YbgH  24.15 
 
 		 493 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0818  inner membrane transporter YbgH  24.15 
 
 		 493 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04001  predicted transporter  23.25 
 
 		 485 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4685  amino acid/peptide transporter  23.25 
 
 		 485 aa  104  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03963  hypothetical protein  23.25 
 
 		 485 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3861  amino acid/peptide transporter  23.25 
 
 		 485 aa  104  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  23.27 
 
 		 461 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  23.27 
 
 		 461 aa  104  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  23.27 
 
 		 461 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4371  amino acid/peptide transporter  23.25 
 
 		 485 aa  104  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.113976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  23.01 
 
 		 461 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  23.49 
 
 		 461 aa  104  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  23.01 
 
 		 461 aa  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  24.04 
 
 		 497 aa  103  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  23.27 
 
 		 461 aa  103  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  23.79 
 
 		 461 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5646  amino acid/peptide transporter  23.03 
 
 		 485 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  23.04 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  22.77 
 
 		 495 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  23.83 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  22.42 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3897  amino acid/peptide transporter  23.03 
 
 		 485 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  22.15 
 
 		 461 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4599  amino acid/peptide transporter  22.81 
 
 		 485 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.148198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0724  amino acid/peptide transporter  23.09 
 
 		 493 aa  99  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470702  normal  0.430255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0799  amino acid/peptide transporter  22.87 
 
 		 493 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.256216  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00669  predicted transporter  22.87 
 
 		 493 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  23.94 
 
 		 510 aa  97.4  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00658  hypothetical protein  22.87 
 
 		 493 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0734  amino acid/peptide transporter  22.87 
 
 		 493 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>