245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1493 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1490  hypothetical protein  99.6 
 
 
495 aa  989    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1493  hypothetical protein  100 
 
 
495 aa  992    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1932  amino acid/peptide transporter  49.02 
 
 
536 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000463259  hitchhiker  0.00239553 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2116  di-/tripeptide transporter  40.84 
 
 
492 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2148  hypothetical protein  39.71 
 
 
493 aa  358  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2122  hypothetical protein  39.47 
 
 
493 aa  358  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0006  hypothetical protein  38.59 
 
 
484 aa  349  7e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.28636  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0003  hypothetical protein  38.82 
 
 
484 aa  340  4e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.992067  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  28.75 
 
 
501 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  28.75 
 
 
501 aa  190  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  28.54 
 
 
501 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  28.54 
 
 
501 aa  189  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  28.33 
 
 
501 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3785  inner membrane transporter YhiP  27.41 
 
 
490 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0323752  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3966  inner membrane transporter YhiP  27.79 
 
 
490 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.826151  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  28.66 
 
 
502 aa  181  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3905  inner membrane transporter YhiP  27.79 
 
 
490 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3862  inner membrane transporter YhiP  27.79 
 
 
490 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31175  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3795  inner membrane transporter YhiP  27.79 
 
 
490 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2346  putative tripeptide transporter permease  28.09 
 
 
500 aa  179  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0609489  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  28.09 
 
 
500 aa  178  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3826  inner membrane transporter YhiP  26.99 
 
 
489 aa  176  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  27.88 
 
 
500 aa  176  8e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2006  amino acid/peptide transporter  27.88 
 
 
500 aa  176  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0749107  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  27.88 
 
 
500 aa  176  8e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1995  putative tripeptide transporter permease  27.88 
 
 
500 aa  176  8e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46141  normal  0.0309863 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01594  hypothetical protein  27.88 
 
 
500 aa  176  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00471162  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03345  predicted transporter  26.99 
 
 
489 aa  176  9e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03298  hypothetical protein  26.99 
 
 
489 aa  176  9e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.240113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3978  inner membrane transporter YhiP  26.99 
 
 
489 aa  176  9e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  27.88 
 
 
500 aa  176  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  27.88 
 
 
500 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  27.9 
 
 
495 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0219  amino acid/peptide transporter  26.78 
 
 
489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3696  inner membrane transporter YhiP  26.78 
 
 
489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0220  inner membrane transporter YhiP  26.78 
 
 
489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3785  inner membrane transporter YhiP  27.35 
 
 
489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3766  amino acid/peptide transporter  27.56 
 
 
482 aa  174  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000840749  normal  0.111557 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4843  inner membrane transporter YhiP  26.57 
 
 
489 aa  174  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2720  hypothetical protein  26.96 
 
 
500 aa  171  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  26.72 
 
 
506 aa  170  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2851  hypothetical protein  26.96 
 
 
500 aa  170  6e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  26.36 
 
 
506 aa  169  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2233  putative tripeptide transporter permease  26.94 
 
 
506 aa  166  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  27.04 
 
 
492 aa  164  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  27.04 
 
 
492 aa  163  6e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0509  putative tripeptide transporter permease  25.26 
 
 
514 aa  162  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  27.2 
 
 
510 aa  162  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1886  putative tripeptide transporter permease  28.57 
 
 
511 aa  161  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348979  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2548  putative tripeptide transporter permease  28.57 
 
 
488 aa  161  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1778  putative tripeptide transporter permease  28.57 
 
 
501 aa  161  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0652  tripeptide permease TppB  26.49 
 
 
504 aa  159  8e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.068993  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1525  di-/tripeptide transporter  26.49 
 
 
528 aa  159  8e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0251804  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  27.1 
 
 
499 aa  153  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  25.87 
 
 
510 aa  152  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04001  predicted transporter  27.03 
 
 
485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3861  amino acid/peptide transporter  27.03 
 
 
485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03963  hypothetical protein  27.03 
 
 
485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5646  amino acid/peptide transporter  27.03 
 
 
485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4371  amino acid/peptide transporter  27.03 
 
 
485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.113976  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4685  amino acid/peptide transporter  27.03 
 
 
485 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3897  amino acid/peptide transporter  27.03 
 
 
485 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4599  amino acid/peptide transporter  27.03 
 
 
485 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.148198  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  24.9 
 
 
497 aa  148  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  24.49 
 
 
497 aa  147  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2802  inner membrane transporter YbgH  26.47 
 
 
486 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.883594  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2719  inner membrane transporter YbgH  26.47 
 
 
486 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.945342  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2936  inner membrane transporter YbgH  26.47 
 
 
486 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2823  inner membrane transporter YbgH  26.47 
 
 
486 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2761  inner membrane transporter YbgH  26.47 
 
 
486 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  24.64 
 
 
498 aa  143  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  25.92 
 
 
483 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  26.27 
 
 
517 aa  140  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  25.1 
 
 
461 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  25 
 
 
461 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  25.1 
 
 
489 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  25.36 
 
 
489 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  25.36 
 
 
489 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  25.17 
 
 
461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  26.7 
 
 
517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  22.73 
 
 
516 aa  134  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  24.95 
 
 
499 aa  134  5e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  25.46 
 
 
497 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0770  inner membrane transporter YbgH  24.41 
 
 
493 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.493131 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  25.98 
 
 
501 aa  133  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  25.1 
 
 
489 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0867  inner membrane transporter YbgH  24.41 
 
 
493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0818  inner membrane transporter YbgH  24.41 
 
 
493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0832  inner membrane transporter YbgH  24.41 
 
 
493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  hitchhiker  0.00189799 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0757  inner membrane transporter YbgH  24.41 
 
 
493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  26.17 
 
 
502 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  24.16 
 
 
527 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  26.85 
 
 
491 aa  131  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  24.18 
 
 
495 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  24.8 
 
 
528 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2239  amino acid/peptide transporter  24.69 
 
 
603 aa  130  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478529  normal  0.0257492 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  22.86 
 
 
461 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  23.78 
 
 
461 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  26.56 
 
 
512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  22.86 
 
 
461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>