153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4619 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4619  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  100 
 
 
260 aa  503  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3844  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.15 
 
 
266 aa  208  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0303  putative DNA polymerase-related protein  37.04 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440976  normal  0.0410762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0372  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.82 
 
 
294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000046016 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1308  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.5 
 
 
264 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0132537  normal  0.393253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1242  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.5 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.738609 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  41.18 
 
 
292 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1397  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.21 
 
 
317 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.60425 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1937  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.03 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.090684  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3291  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.34 
 
 
257 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.517493  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2152  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.46 
 
 
241 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2276  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.29 
 
 
243 aa  102  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1580  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  37.34 
 
 
220 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0245048  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2003  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  38.16 
 
 
433 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5083  Uracil-DNA glycosylase superfamily  48.59 
 
 
260 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2463  uracil-DNA glycosylase  38.16 
 
 
455 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2519  uracil-DNA glycosylase  38.16 
 
 
455 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2607  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  38.16 
 
 
468 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2082  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  38.16 
 
 
455 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268517  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3230  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  38.16 
 
 
455 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1355  uracil-DNA glycosylase  38.16 
 
 
455 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00548958  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0974  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.49 
 
 
320 aa  99.8  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3942  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.45 
 
 
258 aa  99.4  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2481  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38 
 
 
414 aa  99  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  hitchhiker  0.000867118 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1656  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38 
 
 
401 aa  99  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00964982 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.72 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5352  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.32 
 
 
336 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1234  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.33 
 
 
358 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532559  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2121  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.03 
 
 
271 aa  96.3  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2062  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.98 
 
 
342 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6034  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.98 
 
 
346 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0371104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2043  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.98 
 
 
346 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.57 
 
 
304 aa  96.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.73 
 
 
341 aa  96.3  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.62 
 
 
367 aa  95.5  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1944  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.81 
 
 
345 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.94 
 
 
330 aa  93.6  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4571  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.44 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1723  putative phage DNA polymerase  39.26 
 
 
213 aa  92.8  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2515  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.9 
 
 
231 aa  91.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1983  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.66 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.643872 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2882  uracil-DNA glycosylase family 4 protein  36.31 
 
 
308 aa  86.3  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.31 
 
 
308 aa  86.3  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.934489  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.66 
 
 
296 aa  85.9  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  34.59 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4462  hypothetical protein  49.43 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00243841  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0552  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.81 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446381  hitchhiker  0.00103013 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1500  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.89 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.43423  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1494  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.33 
 
 
295 aa  75.5  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2370  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.93 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114234  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1589  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.93 
 
 
205 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0689  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.38 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614175  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.82 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0200  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.5 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0333  hypothetical protein  28.1 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1126  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.33 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0314  hypothetical protein  28.1 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2605  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.24 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0082  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.3 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.86 
 
 
249 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.91 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0266  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.73 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2925  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.2 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0014  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.97 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.9 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.858318  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5015  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32 
 
 
380 aa  65.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.641312  normal  0.046521 
 
 
-
 
NC_002978  WD0164  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.12 
 
 
273 aa  63.2  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0935  uracil-DNA glycosylase  28.31 
 
 
255 aa  62.4  0.000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.91 
 
 
199 aa  62  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3960  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.87 
 
 
191 aa  62  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300932  hitchhiker  0.00000000403692 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1870  Uracil-DNA glycosylase-like protein  27.22 
 
 
233 aa  61.6  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2491  DNA polymerase domain-containing protein  31.29 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0074  uracil-DNA glycosylase  28.75 
 
 
261 aa  60.8  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1669  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.33 
 
 
221 aa  60.1  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0365  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.14 
 
 
208 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.53 
 
 
300 aa  59.7  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3061  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.28 
 
 
255 aa  58.9  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.247484  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0551  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.88 
 
 
324 aa  58.5  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0957804 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2509  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  29.93 
 
 
227 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.567945  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0044  DNA polymerase-related protein  27.5 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1058  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.55 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3864  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.29 
 
 
327 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0209903 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0265  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.01 
 
 
211 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2544  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.2 
 
 
212 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000119513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2345  putative DNA polymerase  30.19 
 
 
274 aa  56.2  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.191175  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2671  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.33 
 
 
253 aa  55.8  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.663672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2166  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.92 
 
 
272 aa  55.8  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.832765  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0224  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.68 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.215269  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3090  uracil-DNA glycosylase  29.45 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.646333  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1116  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.8 
 
 
305 aa  53.9  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2596  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.01 
 
 
301 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.213752 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0839  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.17 
 
 
297 aa  54.3  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0413074 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1001  hypothetical protein  31.68 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0343  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.97 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.202316  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2661  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.35 
 
 
260 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.642929  normal  0.357955 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2373  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.54 
 
 
307 aa  52.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4359  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.4 
 
 
277 aa  52.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0982104  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3901  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.86 
 
 
300 aa  52  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.463834  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2543  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.88 
 
 
235 aa  51.6  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0670794  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1228  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.86 
 
 
276 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>