91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0974 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0974  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  100 
 
 		 320 aa  599  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4619  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.74 
 
 		 260 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3291  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.53 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.517493  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3942  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  52.53 
 
 		 258 aa  109  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3844  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.68 
 
 		 266 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  39.06 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1397  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.52 
 
 		 317 aa  86.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.60425 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5352  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.26 
 
 		 336 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4462  hypothetical protein  65.22 
 
 		 167 aa  84.3  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00243841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2463  uracil-DNA glycosylase  37.7 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2607  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  37.7 
 
 		 468 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2043  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.26 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0372  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.46 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000046016 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2062  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.26 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1580  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  37.7 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0245048  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2003  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  37.7 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6034  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.26 
 
 		 346 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0371104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2519  uracil-DNA glycosylase  37.7 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1234  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.55 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532559  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3230  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  37.7 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1355  uracil-DNA glycosylase  37.7 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00548958  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2082  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  37.7 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268517  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2481  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  hitchhiker  0.000867118 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1308  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.72 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0132537  normal  0.393253 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.26 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.93 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1944  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.26 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1937  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.9 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.090684  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1242  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.72 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.738609 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2121  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.07 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1983  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.34 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.643872 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.61 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0303  putative DNA polymerase-related protein  29.52 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440976  normal  0.0410762 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2882  uracil-DNA glycosylase family 4 protein  29.46 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.46 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.934489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.07 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.1 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  38.14 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1723  putative phage DNA polymerase  36.17 
 
 		 213 aa  72.4  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.04 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2276  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.44 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2152  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.89 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1656  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.29 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00964982 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.62 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2370  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.09 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114234  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1494  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.82 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2515  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.5 
 
 		 231 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1589  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.82 
 
 		 205 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0935  uracil-DNA glycosylase  30.53 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0552  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.8 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446381  hitchhiker  0.00103013 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0689  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.59 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614175  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0014  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.48 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.51 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2605  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.97 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1500  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.21 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.43423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0503  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.15 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0266  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.85 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.21 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2925  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.64 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1116  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.35 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2491  DNA polymerase domain-containing protein  30.51 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0200  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.97 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0333  hypothetical protein  27.78 
 
 		 200 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0314  hypothetical protein  27.78 
 
 		 200 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0551  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.59 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0957804 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0082  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.7 
 
 		 264 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3061  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.52 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.247484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2671  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.38 
 
 		 253 aa  49.7  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.663672 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2543  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.02 
 
 		 235 aa  49.7  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0670794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.91 
 
 		 273 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.858318  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1384  DNA polymerase  32.26 
 
 		 302 aa  49.7  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2166  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.45 
 
 		 272 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.832765  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0936  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.69 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5015  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.66 
 
 		 380 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.641312  normal  0.046521 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  40.51 
 
 		 1217 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1085  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.69 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.735603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1787  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  32.28 
 
 		 196 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.455491  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0909  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.12 
 
 		 285 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1870  Uracil-DNA glycosylase-like protein  30.33 
 
 		 233 aa  47  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1126  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.19 
 
 		 235 aa  46.6  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2028  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.16 
 
 		 290 aa  46.6  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3960  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.33 
 
 		 191 aa  45.8  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300932  hitchhiker  0.00000000403692 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4431  phage SPO1 DNA polymerase-like protein  22.76 
 
 		 226 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.696718  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0443  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.76 
 
 		 281 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0365  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.62 
 
 		 208 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0224  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.06 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.215269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1001  hypothetical protein  32.82 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.78 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2572  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.97 
 
 		 260 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  0.578981 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>