124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3844 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3844  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  100 
 
 
266 aa  518  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4619  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.31 
 
 
260 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0372  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.71 
 
 
294 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000046016 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0303  putative DNA polymerase-related protein  35.27 
 
 
260 aa  106  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440976  normal  0.0410762 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  43.75 
 
 
292 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1308  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.61 
 
 
264 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0132537  normal  0.393253 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1937  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.56 
 
 
285 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.090684  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1397  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.26 
 
 
317 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.60425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0974  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40 
 
 
320 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1242  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.61 
 
 
264 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.738609 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5083  Uracil-DNA glycosylase superfamily  46.53 
 
 
260 aa  95.9  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2152  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.16 
 
 
241 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1656  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.78 
 
 
401 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00964982 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2481  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.1 
 
 
414 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  hitchhiker  0.000867118 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.89 
 
 
296 aa  92.4  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2276  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.92 
 
 
243 aa  92  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2003  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  40.28 
 
 
433 aa  92  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5352  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.58 
 
 
336 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2463  uracil-DNA glycosylase  40.28 
 
 
455 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2519  uracil-DNA glycosylase  40.28 
 
 
455 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1580  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  40.28 
 
 
220 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0245048  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2607  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  40.28 
 
 
468 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6034  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.58 
 
 
346 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0371104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2043  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.58 
 
 
346 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2082  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  40.28 
 
 
455 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268517  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3230  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  40.28 
 
 
455 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1355  uracil-DNA glycosylase  40.28 
 
 
455 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00548958  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2062  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.58 
 
 
342 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1234  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.28 
 
 
358 aa  89.7  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532559  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0689  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.65 
 
 
294 aa  89  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614175  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1944  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.89 
 
 
345 aa  89  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.89 
 
 
367 aa  88.6  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1723  putative phage DNA polymerase  41.38 
 
 
213 aa  87.4  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.1 
 
 
341 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.27 
 
 
264 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.19 
 
 
330 aa  86.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4571  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.23 
 
 
266 aa  86.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2882  uracil-DNA glycosylase family 4 protein  36.99 
 
 
308 aa  86.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3291  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.9 
 
 
257 aa  86.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.517493  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.99 
 
 
308 aa  86.3  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.934489  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3942  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.9 
 
 
258 aa  85.5  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.51 
 
 
304 aa  82.4  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2515  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.32 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2121  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.04 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  38.71 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1126  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.52 
 
 
235 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2925  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.28 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1500  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.76 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.43423  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.38 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1983  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.97 
 
 
260 aa  72.8  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.643872 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4462  hypothetical protein  46.25 
 
 
167 aa  70.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00243841  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1494  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.4 
 
 
295 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1589  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.4 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2671  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.08 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.663672 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0014  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.48 
 
 
263 aa  68.6  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0082  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.88 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2370  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.6 
 
 
245 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114234  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0552  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.02 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446381  hitchhiker  0.00103013 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0333  hypothetical protein  32.2 
 
 
200 aa  62.8  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.93 
 
 
249 aa  62  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0314  hypothetical protein  32.2 
 
 
200 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.91 
 
 
199 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2605  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.4 
 
 
203 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3061  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.06 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.247484  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1116  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.82 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3864  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.57 
 
 
327 aa  58.9  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0209903 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5015  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.2 
 
 
380 aa  58.9  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.641312  normal  0.046521 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.06 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0551  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.62 
 
 
324 aa  57  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0957804 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0074  uracil-DNA glycosylase  31.79 
 
 
261 aa  55.8  0.0000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2509  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  33.09 
 
 
227 aa  55.8  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.567945  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2491  DNA polymerase domain-containing protein  36 
 
 
264 aa  55.5  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0266  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.8 
 
 
315 aa  55.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0164  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.82 
 
 
273 aa  55.5  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.4 
 
 
300 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1669  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.65 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0044  DNA polymerase-related protein  31.13 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2543  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.19 
 
 
235 aa  52.8  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0670794  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0200  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.33 
 
 
305 aa  53.1  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.35 
 
 
273 aa  52.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.858318  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1001  hypothetical protein  36 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0935  uracil-DNA glycosylase  30.71 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2661  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.642929  normal  0.357955 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0224  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.2 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.215269  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0365  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.08 
 
 
208 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3901  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.56 
 
 
300 aa  50.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.463834  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2189  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.59 
 
 
286 aa  49.7  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5828  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.98 
 
 
209 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2544  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 
212 aa  49.3  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000119513 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0265  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.99 
 
 
211 aa  48.9  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2373  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 
307 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2166  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.89 
 
 
272 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.832765  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2028  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.15 
 
 
290 aa  47  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3090  uracil-DNA glycosylase  30.25 
 
 
265 aa  46.6  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.646333  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2596  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.54 
 
 
301 aa  46.6  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.213752 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07301  Uracil-DNA glycosylase  27.48 
 
 
167 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07481  Uracil-DNA glycosylase  25.35 
 
 
167 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0675  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.72 
 
 
167 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1899  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.59 
 
 
480 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.530135 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1870  Uracil-DNA glycosylase-like protein  28.1 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>