158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2544 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2544  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  100 
 
 
212 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000119513 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1669  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  74.24 
 
 
221 aa  310  6.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2925  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.18 
 
 
259 aa  134  9e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2671  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.57 
 
 
253 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.663672 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1126  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.47 
 
 
235 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0082  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.4 
 
 
264 aa  99  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5015  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.53 
 
 
380 aa  94.7  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.641312  normal  0.046521 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  35.33 
 
 
224 aa  93.2  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.47 
 
 
249 aa  92  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1494  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.53 
 
 
295 aa  92  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.363091  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1589  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.53 
 
 
205 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1500  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.21 
 
 
255 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.43423  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2509  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.53 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.567945  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2370  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.87 
 
 
245 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114234  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1870  Uracil-DNA glycosylase-like protein  26.8 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.19 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.59 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0014  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.56 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.73 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.53 
 
 
308 aa  68.6  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.934489  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2882  uracil-DNA glycosylase family 4 protein  29.53 
 
 
308 aa  68.6  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0290  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.61 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0839  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.82 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0413074 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2491  DNA polymerase domain-containing protein  27.07 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0200  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.66 
 
 
305 aa  67  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0074  uracil-DNA glycosylase  26.8 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2596  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.83 
 
 
301 aa  65.5  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.213752 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1116  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.48 
 
 
305 aa  65.5  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0365  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.45 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11480  Uracil-DNA glycosylase  27.2 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353711  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2605  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.03 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2121  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.78 
 
 
271 aa  63.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0503  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.44 
 
 
216 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0552  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.12 
 
 
264 aa  63.2  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446381  hitchhiker  0.00103013 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3067  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.17 
 
 
187 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000874061  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2152  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.95 
 
 
241 aa  62.4  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0483  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  24 
 
 
195 aa  62  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000659964  normal  0.795166 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3901  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.41 
 
 
300 aa  61.6  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.463834  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0044  DNA polymerase-related protein  25.49 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1083  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.17 
 
 
277 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.761546 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0909  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.67 
 
 
285 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.86 
 
 
304 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.78 
 
 
330 aa  60.1  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1983  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.47 
 
 
260 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.643872 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.87 
 
 
264 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1228  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  24.5 
 
 
276 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2416  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  22.37 
 
 
190 aa  59.3  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  24.83 
 
 
209 aa  58.9  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3219  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  24.5 
 
 
289 aa  58.5  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4359  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  23.18 
 
 
277 aa  58.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0982104  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0343  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.1 
 
 
223 aa  58.2  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.202316  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2161  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.59 
 
 
191 aa  58.2  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.336529  hitchhiker  0.000279236 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3864  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.19 
 
 
327 aa  57.8  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0209903 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2276  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.42 
 
 
243 aa  57  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1210  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  23.84 
 
 
282 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal  0.843697 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1397  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.08 
 
 
317 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.60425 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0356  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.91 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.606658  normal  0.0957243 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1940  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  23.57 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000409376 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0333  hypothetical protein  23.24 
 
 
200 aa  56.2  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  22.88 
 
 
186 aa  55.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000159527  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1937  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.4 
 
 
285 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.090684  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0314  hypothetical protein  23.24 
 
 
200 aa  55.5  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0147  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  22.88 
 
 
202 aa  55.5  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1242  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.61 
 
 
264 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.738609 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2515  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.08 
 
 
231 aa  55.1  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0303  putative DNA polymerase-related protein  28.03 
 
 
260 aa  54.7  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440976  normal  0.0410762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2345  putative DNA polymerase  22.52 
 
 
274 aa  54.7  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.191175  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1285  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.67 
 
 
274 aa  54.3  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1369  putative DNA polymerase-related protein, bacteriophage-type  26.61 
 
 
292 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.424674  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1723  putative phage DNA polymerase  28.46 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.821024 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1001  hypothetical protein  28.3 
 
 
260 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2003  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  25 
 
 
433 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.47 
 
 
205 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2075  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.81 
 
 
367 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1944  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.81 
 
 
345 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0689  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.63 
 
 
294 aa  54.7  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614175  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1308  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.81 
 
 
264 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0132537  normal  0.393253 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25 
 
 
341 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1580  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  25 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0245048  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0265  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.59 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.93 
 
 
273 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.858318  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2661  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.38 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.642929  normal  0.357955 
 
 
-
 
NC_002978  WD0164  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  23.53 
 
 
273 aa  53.1  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0440  uracil-DNA glycosylase  23.91 
 
 
275 aa  53.1  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1234  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.81 
 
 
358 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532559  normal  0.188562 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2607  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  25 
 
 
468 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2463  uracil-DNA glycosylase  25 
 
 
455 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2519  uracil-DNA glycosylase  25 
 
 
455 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31218  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0551  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.25 
 
 
324 aa  52.4  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0957804 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2082  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  25 
 
 
455 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.268517  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3230  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  25 
 
 
455 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1355  uracil-DNA glycosylase  25 
 
 
455 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00548958  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5352  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  23.39 
 
 
336 aa  51.6  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_004310  BR0620  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.88 
 
 
290 aa  50.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.316003  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2481  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.2 
 
 
414 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  hitchhiker  0.000867118 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0963  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  26.83 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.342047  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2543  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0670794  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6034  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  23.39 
 
 
346 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0371104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2043  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  23.39 
 
 
346 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0619  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.88 
 
 
290 aa  50.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>