More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1787 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1787  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  100 
 
 
196 aa  374  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.455491  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0113  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.93 
 
 
206 aa  148  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0503  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.76 
 
 
216 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  47.22 
 
 
186 aa  125  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000159527  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5910  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.18 
 
 
220 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2605  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.61 
 
 
203 aa  120  9e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.99 
 
 
209 aa  120  9e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2840  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.85 
 
 
206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182688  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2690  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.62 
 
 
224 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0483  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.14 
 
 
195 aa  117  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000659964  normal  0.795166 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4407  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.34 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.380012 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0290  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  48.28 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.05 
 
 
213 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150197  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2925  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.2 
 
 
259 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1870  Uracil-DNA glycosylase-like protein  38.15 
 
 
233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2261  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.5 
 
 
225 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.237053  normal  0.0854342 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1116  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.7 
 
 
305 aa  114  6.9999999999999995e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5870  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.2 
 
 
213 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.669863  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4052  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.87 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.833859  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1181  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  45.28 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3354  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.95 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.995704 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12930  uracil-DNA glycosylase, family 4  43.59 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1058  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.96 
 
 
276 aa  112  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2572  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.25 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal  0.578981 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1481  putative phage DNA polymerase  42.2 
 
 
235 aa  111  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1912  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.89 
 
 
199 aa  111  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2785  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.38 
 
 
224 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07331  Uracil-DNA glycosylase  40.82 
 
 
187 aa  110  9e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.444861  hitchhiker  0.00512235 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0108  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.14 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0014  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2187  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.67 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5631  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.94 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609757  normal  0.0369434 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.92 
 
 
304 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0265  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.88 
 
 
211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.94 
 
 
217 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693226  normal  0.500254 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1940  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.38 
 
 
205 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000409376 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3067  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.83 
 
 
187 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000874061  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0935  uracil-DNA glycosylase  37.5 
 
 
255 aa  107  1e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2002  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.1 
 
 
495 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.515023  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0365  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.39 
 
 
208 aa  106  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2974  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  43.62 
 
 
484 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.547002  normal  0.081946 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2671  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.63 
 
 
253 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.663672 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1479  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.94 
 
 
184 aa  106  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1899  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.84 
 
 
480 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.530135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2983  putative Uracil-DNA glycosylase  35.64 
 
 
496 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229765  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2808  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.13 
 
 
237 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.87 
 
 
264 aa  106  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0266  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.64 
 
 
315 aa  105  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0443  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.51 
 
 
281 aa  105  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1085  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.73 
 
 
217 aa  105  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.863324  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2121  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.63 
 
 
271 aa  105  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0343  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.33 
 
 
223 aa  104  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.202316  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0426  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.1 
 
 
193 aa  103  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000629945  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0834  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.98 
 
 
223 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597478  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0411  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.1 
 
 
193 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323475  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0689  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.37 
 
 
294 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614175  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1364  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.67 
 
 
223 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6057  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.67 
 
 
223 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  0.181537 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6465  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.67 
 
 
223 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114604  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0718  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.29 
 
 
290 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1286  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.2 
 
 
209 aa  102  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1244  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40 
 
 
221 aa  102  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3202  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.21 
 
 
217 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.961371 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  39.33 
 
 
224 aa  102  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.5 
 
 
249 aa  102  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.41 
 
 
209 aa  102  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0333  hypothetical protein  34.48 
 
 
200 aa  101  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1363  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.43 
 
 
341 aa  101  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0314  hypothetical protein  34.48 
 
 
200 aa  101  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1393  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.74 
 
 
210 aa  101  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1126  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.19 
 
 
235 aa  101  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.83 
 
 
210 aa  101  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2713  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  41.1 
 
 
484 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0414  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.23 
 
 
330 aa  101  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3194  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.78 
 
 
428 aa  101  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.4407  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1656  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.46 
 
 
401 aa  101  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00964982 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3864  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.96 
 
 
327 aa  101  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0209903 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3539  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.72 
 
 
493 aa  100  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72599  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5015  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.82 
 
 
380 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.641312  normal  0.046521 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2373  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.46 
 
 
307 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2481  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.04 
 
 
414 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  hitchhiker  0.000867118 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0082  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  40.82 
 
 
264 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2581  Uracil-DNA glycosylase superfamily  44.9 
 
 
485 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148154  normal  0.520534 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1521  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  42.13 
 
 
229 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0463679 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0200  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38 
 
 
305 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1083  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.02 
 
 
277 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.761546 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3960  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.65 
 
 
191 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300932  hitchhiker  0.00000000403692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2263  Uracil-DNA glycosylase superfamily  45.03 
 
 
485 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11480  Uracil-DNA glycosylase  38.89 
 
 
210 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353711  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0717  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.23 
 
 
195 aa  99.8  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.667137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2345  putative DNA polymerase  35.48 
 
 
274 aa  99.4  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.191175  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1085  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  38.92 
 
 
189 aa  99.4  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.307792  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1838  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.84 
 
 
185 aa  99.4  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1580  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  37.5 
 
 
220 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0245048  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0044  DNA polymerase-related protein  33.53 
 
 
261 aa  99  4e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2003  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  38.1 
 
 
433 aa  99  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4766  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.42 
 
 
309 aa  99  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6621  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.24 
 
 
493 aa  99  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647751  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2502  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  39.41 
 
 
476 aa  99  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562292  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2306  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.22 
 
 
485 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0113153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>