More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0899 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0899  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
373 aa  780    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
375 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.09 
 
 
370 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
373 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.86 
 
 
379 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.83 
 
 
357 aa  383  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.26 
 
 
372 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.53 
 
 
369 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.44 
 
 
373 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.87 
 
 
370 aa  375  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.57 
 
 
374 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.14 
 
 
388 aa  373  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.87 
 
 
379 aa  372  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.92 
 
 
394 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.43 
 
 
371 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.17 
 
 
372 aa  369  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.98 
 
 
369 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.09 
 
 
383 aa  367  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.24 
 
 
383 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.22 
 
 
379 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.09 
 
 
383 aa  367  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.22 
 
 
379 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1315  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.72 
 
 
376 aa  367  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.12 
 
 
373 aa  364  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.41 
 
 
379 aa  362  4e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.98 
 
 
372 aa  362  6e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  48.16 
 
 
371 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1470  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.28 
 
 
377 aa  359  3e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.83 
 
 
375 aa  359  4e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.83 
 
 
375 aa  359  4e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.83 
 
 
375 aa  359  4e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.83 
 
 
375 aa  359  4e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.83 
 
 
375 aa  359  4e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.83 
 
 
375 aa  359  4e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0436  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.83 
 
 
375 aa  359  4e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.83 
 
 
375 aa  359  4e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  46.83 
 
 
375 aa  359  4e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.03 
 
 
372 aa  359  4e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.03 
 
 
372 aa  359  5e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0444  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.56 
 
 
375 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0451  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.56 
 
 
375 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0945287  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0464  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.56 
 
 
375 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.992026  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0505  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.56 
 
 
375 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0445  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.56 
 
 
375 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.05 
 
 
380 aa  359  5e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.01 
 
 
371 aa  358  6e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0875  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.11 
 
 
375 aa  358  7e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68635  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3291  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.01 
 
 
381 aa  358  7e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.01 
 
 
375 aa  358  7e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.15 
 
 
370 aa  358  9e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1019  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.01 
 
 
381 aa  358  9e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.14 
 
 
385 aa  357  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2906  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.52 
 
 
387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.905549  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4345  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.78 
 
 
377 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000330572 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1061  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.14 
 
 
374 aa  356  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3097  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.99 
 
 
387 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3123  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.13 
 
 
374 aa  355  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00561158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3384  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.13 
 
 
374 aa  355  5e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000344335  normal  0.488605 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3264  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.13 
 
 
374 aa  355  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000400897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.19 
 
 
370 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1114  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.21 
 
 
373 aa  355  5.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.34463  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.74 
 
 
374 aa  355  6.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.01 
 
 
392 aa  355  7.999999999999999e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01046  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.31 
 
 
378 aa  355  7.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.32 
 
 
379 aa  354  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.32 
 
 
379 aa  354  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.32 
 
 
379 aa  354  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.32 
 
 
379 aa  354  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.13 
 
 
377 aa  354  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.01 
 
 
392 aa  354  1e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.32 
 
 
379 aa  354  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.32 
 
 
379 aa  354  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.24 
 
 
373 aa  354  1e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004367  tRNA-guanine transglycosylase  44.77 
 
 
382 aa  354  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.32 
 
 
379 aa  354  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0270  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.01 
 
 
379 aa  354  1e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.147453  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.95 
 
 
376 aa  354  1e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2193  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.7 
 
 
374 aa  354  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0616046  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.91 
 
 
370 aa  353  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.93 
 
 
374 aa  354  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  0.0000118913 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.93 
 
 
374 aa  354  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000328041  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.93 
 
 
374 aa  354  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000652098  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3113  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.93 
 
 
374 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.74 
 
 
392 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.32 
 
 
379 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.23 
 
 
380 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.32 
 
 
379 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.05 
 
 
379 aa  353  4e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.45 
 
 
369 aa  353  4e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.05 
 
 
379 aa  353  4e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1401  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.11 
 
 
377 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000397481  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2214  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.03 
 
 
374 aa  352  7e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00238944  normal  0.155586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2702  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.73 
 
 
374 aa  351  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000654614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.21 
 
 
373 aa  350  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2352  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.55 
 
 
391 aa  350  2e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1290  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.98 
 
 
375 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3407  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.11 
 
 
370 aa  350  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38542  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.4 
 
 
370 aa  350  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.36 
 
 
374 aa  350  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0833  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.92 
 
 
371 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.936074  normal  0.0233256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>