250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0470 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0470  RarD protein, DMT superfamily transporter  100 
 
 		 284 aa  548  1e-155  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  36.49 
 
 		 301 aa  169  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0806  transporter DMT superfamily protein  33.22 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.86594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2776  transporter DMT superfamily protein  36.84 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2719  transporter DMT superfamily protein  36.84 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  33.57 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  33.57 
 
 		 313 aa  159  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  33.22 
 
 		 313 aa  158  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  33.57 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  34.84 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  33.57 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  33.57 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  33.57 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  32.87 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  32.52 
 
 		 313 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0082  rarD protein  34.6 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1654  RarD protein, DMT superfamily transporter  31.64 
 
 		 296 aa  155  6e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3262  transporter DMT superfamily protein  32.17 
 
 		 313 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2317  RarD protein, DMT superfamily transporter  31.62 
 
 		 305 aa  152  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000109763  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  31.74 
 
 		 295 aa  152  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  30.96 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1614  transporter DMT superfamily protein  30.6 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000443089  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  31.27 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23910  rarD protein  31.41 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00670263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  32.75 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1350  rarD protein  32.85 
 
 		 300 aa  149  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  33.58 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1247  transporter DMT superfamily protein  31.96 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  0.0239516 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  29.83 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  29.01 
 
 		 304 aa  145  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  32.38 
 
 		 294 aa  145  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  31.67 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  30.96 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  32.38 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  32.38 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  30.6 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002091  protein rarD  29.79 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  30.96 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  32.38 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  32.38 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0080  RarD protein, DMT superfamily transporter  33.69 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0239  RarD protein, DMT superfamily transporter  32.32 
 
 		 306 aa  142  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.226389  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  31.69 
 
 		 296 aa  142  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  31.69 
 
 		 296 aa  142  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  31.69 
 
 		 296 aa  142  9e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1207  rarD protein  28.18 
 
 		 319 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0717  transporter DMT superfamily protein  30.58 
 
 		 294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.424655  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  31.71 
 
 		 296 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0190  RarD protein, DMT superfamily transporter  33.22 
 
 		 306 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  29.69 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1183  DMT superfamily efflux pump, RarD  28.52 
 
 		 319 aa  139  7e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  29.69 
 
 		 295 aa  139  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  30.42 
 
 		 293 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  29.59 
 
 		 296 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  29.59 
 
 		 296 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  29.59 
 
 		 296 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  29.59 
 
 		 296 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  29.59 
 
 		 296 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  29.59 
 
 		 296 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  30.95 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  30.64 
 
 		 298 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  30.95 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0866  RarD protein, DMT superfamily transporter  30.27 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.914682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  30.95 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1661  transporter DMT superfamily protein  30.14 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0190  transporter DMT superfamily protein  32.39 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.7183 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0936  rarD protein  29.17 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  29.73 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  31.51 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  31.06 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0851  RarD protein  33.45 
 
 		 292 aa  136  5e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0193705  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  29.45 
 
 		 301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0386  transporter DMT superfamily protein  27.74 
 
 		 295 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000235759  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0588  hypothetical protein  28.47 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0009394  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06320  hypothetical protein  28.47 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257668  normal  0.652211 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0621  transporter DMT superfamily protein  29.79 
 
 		 318 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000105334  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  31.16 
 
 		 295 aa  133  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  27.4 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2413  transporter DMT superfamily protein  28.47 
 
 		 294 aa  132  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.528634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2967  RarD protein, DMT superfamily transporter  32.62 
 
 		 304 aa  132  9e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.895178 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1118  rarD protein  30.41 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  27.4 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  29.01 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0384  transporter DMT superfamily protein  27.05 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000682799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4844  transporter DMT superfamily protein  28.52 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000446481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0599  RarD protein, DMT superfamily transporter  27.4 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2440  RarD protein, DMT superfamily transporter  30.51 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.659696  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1859  RarD protein, DMT superfamily transporter  33.68 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.898363  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4093  transporter DMT superfamily protein  29.01 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  27.84 
 
 		 300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2425  RarD protein, DMT superfamily transporter  30.74 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4403  RarD protein, DMT superfamily transporter  28.27 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4018  rarD protein  27.15 
 
 		 316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1476  hypothetical protein  30.14 
 
 		 307 aa  125  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0297  RarD protein, DMT superfamily transporter  29.35 
 
 		 301 aa  125  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1336  permease  32.09 
 
 		 296 aa  125  7e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0328749  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2679  RarD protein  28.52 
 
 		 312 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3092  transporter DMT superfamily protein  27.48 
 
 		 310 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652908  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0778  RarD protein  29.79 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4081  transporter DMT superfamily protein  30.18 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>