245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3141 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3141  allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 		 239 aa  478  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1104  Allophanate hydrolase subunit 1  53.16 
 
 		 244 aa  239  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0177742  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2132  allophanate hydrolase subunit 1  51.91 
 
 		 240 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.317589 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1385  Allophanate hydrolase subunit 1  54.09 
 
 		 242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.949213 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1496  allophanate hydrolase subunit 1  49.15 
 
 		 252 aa  218  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3353  allophanate hydrolase subunit 1  47.84 
 
 		 244 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2624  hypothetical protein  45.18 
 
 		 249 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1814  Allophanate hydrolase subunit 1  47.42 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21016  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1534  allophanate hydrolase subunit 1  46.95 
 
 		 241 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2958  Allophanate hydrolase subunit 1  43.23 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2832  hypothetical protein  42.36 
 
 		 242 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.812146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1978  Allophanate hydrolase subunit 1  43.1 
 
 		 235 aa  184  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1709  Allophanate hydrolase subunit 1  47.42 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5815  allophanate hydrolase subunit 1  45.85 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100836  normal  0.0693408 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2636  hypothetical protein  40.77 
 
 		 242 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.24477  decreased coverage  0.0000373796 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2040  hypothetical protein  41.48 
 
 		 243 aa  175  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.733064  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3450  hypothetical protein  41.1 
 
 		 245 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3430  allophanate hydrolase subunit 1  41.2 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1501  hypothetical protein  42.11 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3095  allophanate hydrolase subunit 1  40.51 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.686624  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4132  putative carboxylase  44.02 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  41.23 
 
 		 240 aa  166  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2047  allophanate hydrolase subunit 1  39.66 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.684193  normal  0.286348 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  37.33 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  40.77 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  40.43 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  39.35 
 
 		 230 aa  151  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2803  allophanate hydrolase subunit 1  38.39 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.733507 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  35.14 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  36.56 
 
 		 233 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  33.62 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  35.92 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  36.49 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  33.91 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  32.77 
 
 		 237 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  34.89 
 
 		 240 aa  135  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  32.78 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1172  hypothetical protein  34.38 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  35.59 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  33.94 
 
 		 238 aa  132  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  38.16 
 
 		 553 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  32.47 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0372  allophanate hydrolase subunit 1  35.74 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  0.529517 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  38.57 
 
 		 531 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  32.19 
 
 		 237 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  32.19 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  32.19 
 
 		 237 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  32.19 
 
 		 237 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  32.19 
 
 		 237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2062  allophanate hydrolase subunit 1  31.49 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.206067  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  38.32 
 
 		 541 aa  129  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1828  Allophanate hydrolase subunit 1  37.17 
 
 		 227 aa  128  7.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  38.46 
 
 		 534 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  31.76 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  31.86 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  31.86 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  38.22 
 
 		 225 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  35.56 
 
 		 549 aa  122  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2790  Allophanate hydrolase subunit 1  39.57 
 
 		 239 aa  122  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  36.02 
 
 		 204 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  37.78 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  36.49 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  38.84 
 
 		 539 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  35.51 
 
 		 218 aa  118  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  35.75 
 
 		 539 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  36.84 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  34.6 
 
 		 203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1713  hypothetical protein  33.48 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.115565  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  36.36 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  36.36 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0533  urea amidolyase related protein  35.07 
 
 		 518 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.384607  normal  0.0140832 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0360  allophanate hydrolase subunit 1  31.58 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.120122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1030  allophanate hydrolase subunit 1  33.18 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0899  Allophanate hydrolase subunit 1  36.32 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1900  hypothetical protein  32.59 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  36.36 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1801  hypothetical protein  38.16 
 
 		 205 aa  112  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1527  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0082  urea amidolyase related protein  37.32 
 
 		 539 aa  112  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  34 
 
 		 499 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3293  urea amidolyase related protein  34.78 
 
 		 536 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1437  putative allophanate hydrolase subunit 1  30.28 
 
 		 239 aa  110  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  35.55 
 
 		 217 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  33.8 
 
 		 256 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4346  allophanate hydrolase subunit 1  36.63 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  33.8 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  33.97 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  33.8 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  34.12 
 
 		 218 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1498  allophanate hydrolase subunit 1  31.58 
 
 		 227 aa  109  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  34.12 
 
 		 218 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  34.12 
 
 		 218 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  34.12 
 
 		 218 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1100  allophanate hydrolase subunit 1  36.81 
 
 		 217 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.724491  normal  0.149569 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  33.65 
 
 		 259 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  35.41 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3548  allophanate hydrolase subunit 1  29.44 
 
 		 234 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  34.27 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12460  allophanate hydrolase subunit 1  37.44 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2197  Allophanate hydrolase subunit 1  35.75 
 
 		 203 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>