248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1104 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1104  Allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 		 244 aa  471  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0177742  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2132  allophanate hydrolase subunit 1  83.61 
 
 		 240 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.317589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3353  allophanate hydrolase subunit 1  68.49 
 
 		 244 aa  291  7e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1496  allophanate hydrolase subunit 1  63.64 
 
 		 252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3141  allophanate hydrolase subunit 1  53.16 
 
 		 239 aa  219  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1385  Allophanate hydrolase subunit 1  50.43 
 
 		 242 aa  192  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.949213 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2624  hypothetical protein  42.86 
 
 		 249 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5815  allophanate hydrolase subunit 1  47.3 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100836  normal  0.0693408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2832  hypothetical protein  40.16 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.812146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2636  hypothetical protein  41.84 
 
 		 242 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.24477  decreased coverage  0.0000373796 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  42.8 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2958  Allophanate hydrolase subunit 1  41.1 
 
 		 242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  38.17 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3430  allophanate hydrolase subunit 1  40.57 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1814  Allophanate hydrolase subunit 1  47.27 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21016  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1534  allophanate hydrolase subunit 1  45.66 
 
 		 241 aa  158  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4132  putative carboxylase  42.98 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2040  hypothetical protein  39.57 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.733064  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1709  Allophanate hydrolase subunit 1  47.46 
 
 		 241 aa  156  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1501  hypothetical protein  39.66 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  38.56 
 
 		 242 aa  151  8.999999999999999e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  38.89 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1978  Allophanate hydrolase subunit 1  38.79 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2047  allophanate hydrolase subunit 1  39.75 
 
 		 244 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.684193  normal  0.286348 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3450  hypothetical protein  39.75 
 
 		 245 aa  148  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3095  allophanate hydrolase subunit 1  40.17 
 
 		 244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.686624  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  37.13 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2803  allophanate hydrolase subunit 1  39.62 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.733507 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  43.5 
 
 		 229 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  42.53 
 
 		 243 aa  138  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  33.19 
 
 		 229 aa  138  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  33.33 
 
 		 237 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  31.72 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  33.48 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  33.91 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  33.48 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  31.3 
 
 		 237 aa  131  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  30.21 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  30.87 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  30.87 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  31.3 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  30.87 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  31.72 
 
 		 238 aa  125  6e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1828  Allophanate hydrolase subunit 1  35.71 
 
 		 227 aa  125  7e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700808  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  33.94 
 
 		 233 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  30.87 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  35.14 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  37.16 
 
 		 218 aa  122  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  40.28 
 
 		 204 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2062  allophanate hydrolase subunit 1  31.44 
 
 		 233 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.206067  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  34.05 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  37.5 
 
 		 499 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3548  allophanate hydrolase subunit 1  31.72 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  37.44 
 
 		 225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  36.56 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0372  allophanate hydrolase subunit 1  33.62 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  0.529517 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1498  allophanate hydrolase subunit 1  33.48 
 
 		 227 aa  112  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1406  allophanate hydrolase subunit 1  35.22 
 
 		 234 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1030  allophanate hydrolase subunit 1  32.6 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  36.45 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  38.01 
 
 		 539 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1737  allophanate hydrolase subunit 1  27.85 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.215551 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  36.64 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1713  hypothetical protein  28.45 
 
 		 246 aa  108  5e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.115565  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  35.68 
 
 		 531 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1437  putative allophanate hydrolase subunit 1  29.25 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  35.08 
 
 		 534 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  36.64 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  36.21 
 
 		 218 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  36.21 
 
 		 218 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1527  hypothetical protein  28.75 
 
 		 246 aa  106  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0899  Allophanate hydrolase subunit 1  37.56 
 
 		 221 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  35.02 
 
 		 217 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  36.29 
 
 		 553 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  35.93 
 
 		 218 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1900  hypothetical protein  27.62 
 
 		 246 aa  105  9e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1984  hypothetical protein  28.7 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2790  Allophanate hydrolase subunit 1  39.67 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0360  allophanate hydrolase subunit 1  29.28 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.120122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  35.5 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12460  allophanate hydrolase subunit 1  36.49 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  35.34 
 
 		 218 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  32.71 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  36.98 
 
 		 539 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  33.95 
 
 		 549 aa  102  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  31.11 
 
 		 549 aa  102  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  36.73 
 
 		 541 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01081  Allophanate hydrolase, subunit 1  28.51 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805249  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3876  allophanate hydrolase subunit 1  34.26 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.348545  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  35.45 
 
 		 218 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  35.45 
 
 		 218 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  35.45 
 
 		 218 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  35.45 
 
 		 218 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  35 
 
 		 259 aa  99.4  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  34.4 
 
 		 217 aa  99.4  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  35.45 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  35.45 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  25.22 
 
 		 244 aa  99  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  25.22 
 
 		 244 aa  99  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  36.87 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>