212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1978 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1978  Allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 		 235 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2803  allophanate hydrolase subunit 1  44.59 
 
 		 221 aa  184  8e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.733507 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3141  allophanate hydrolase subunit 1  43.1 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2132  allophanate hydrolase subunit 1  40.81 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.317589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3353  allophanate hydrolase subunit 1  41.59 
 
 		 244 aa  155  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1496  allophanate hydrolase subunit 1  37.5 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1104  Allophanate hydrolase subunit 1  38.79 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0177742  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1828  Allophanate hydrolase subunit 1  38.36 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700808  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5815  allophanate hydrolase subunit 1  41.92 
 
 		 244 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100836  normal  0.0693408 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2624  hypothetical protein  37.07 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1385  Allophanate hydrolase subunit 1  40.27 
 
 		 242 aa  142  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.949213 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  35.71 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  36.53 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  37.33 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1534  allophanate hydrolase subunit 1  39.15 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2040  hypothetical protein  34.4 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.733064  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1814  Allophanate hydrolase subunit 1  38.68 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21016  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2958  Allophanate hydrolase subunit 1  34.8 
 
 		 242 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  35.81 
 
 		 240 aa  133  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  34.39 
 
 		 243 aa  132  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3450  hypothetical protein  33.92 
 
 		 245 aa  131  9e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  34.09 
 
 		 233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  35.15 
 
 		 240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  37.44 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1709  Allophanate hydrolase subunit 1  42.45 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2832  hypothetical protein  35.87 
 
 		 242 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.812146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  33.63 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  35 
 
 		 242 aa  128  8.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  33.63 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1498  allophanate hydrolase subunit 1  34.55 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3095  allophanate hydrolase subunit 1  33.77 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.686624  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  34.55 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  34.53 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3430  allophanate hydrolase subunit 1  34.55 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381456  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  32.6 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0899  Allophanate hydrolase subunit 1  37.56 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  32.16 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  32.16 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  32.16 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  34.88 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  34.7 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  32.16 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  31.72 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2062  allophanate hydrolase subunit 1  33.19 
 
 		 233 aa  122  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.206067  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  31.78 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1501  hypothetical protein  32.75 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3548  allophanate hydrolase subunit 1  39.56 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  32.6 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4132  putative carboxylase  36.16 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  33.49 
 
 		 229 aa  119  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2636  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.24477  decreased coverage  0.0000373796 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  33.04 
 
 		 549 aa  118  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1900  hypothetical protein  33.49 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  35.65 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1527  hypothetical protein  33.03 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2047  allophanate hydrolase subunit 1  34.21 
 
 		 244 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.684193  normal  0.286348 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3379  allophanate hydrolase subunit 1  32.73 
 
 		 234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.332563  normal  0.85037 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0360  allophanate hydrolase subunit 1  32.74 
 
 		 234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.120122  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1713  hypothetical protein  32.57 
 
 		 246 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.115565  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1030  allophanate hydrolase subunit 1  34.84 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  36.11 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  36.62 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1437  putative allophanate hydrolase subunit 1  31.8 
 
 		 239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4346  allophanate hydrolase subunit 1  34.78 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  32.23 
 
 		 215 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  39.05 
 
 		 217 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  35.24 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2790  Allophanate hydrolase subunit 1  42.75 
 
 		 239 aa  108  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1172  hypothetical protein  28.44 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  36.11 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  38.1 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0008  allophanate hydrolase subunit 1  34.6 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1406  allophanate hydrolase subunit 1  37.08 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  33.8 
 
 		 259 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  34.76 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  34.76 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  35.07 
 
 		 549 aa  105  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  33.94 
 
 		 256 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  33.94 
 
 		 256 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  33.94 
 
 		 256 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  35.35 
 
 		 541 aa  105  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  33.8 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  33.8 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  33.8 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  37.3 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  33.8 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0023  hypothetical protein  33.18 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309648 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3876  allophanate hydrolase subunit 1  33.81 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.348545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  33.81 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  32.86 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4097  allophanate hydrolase subunit 1  33.49 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0199778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  32.86 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  34.91 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1313  allophanate hydrolase subunit 1  33.48 
 
 		 228 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.837273  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4576  allophanate hydrolase subunit 1  33.63 
 
 		 229 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  32.2 
 
 		 215 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1737  allophanate hydrolase subunit 1  33.15 
 
 		 226 aa  102  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.215551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0175  urea amidolyase related protein  33.49 
 
 		 562 aa  102  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  32.2 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  33.18 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>