237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1385 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1385  Allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 		 242 aa  478  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.949213 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1496  allophanate hydrolase subunit 1  52.42 
 
 		 252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3141  allophanate hydrolase subunit 1  54.09 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1104  Allophanate hydrolase subunit 1  50.43 
 
 		 244 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0177742  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3353  allophanate hydrolase subunit 1  48.29 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2132  allophanate hydrolase subunit 1  50.88 
 
 		 240 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.317589 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2624  hypothetical protein  44.86 
 
 		 249 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2958  Allophanate hydrolase subunit 1  45.91 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1814  Allophanate hydrolase subunit 1  50.23 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21016  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5815  allophanate hydrolase subunit 1  48.47 
 
 		 244 aa  191  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100836  normal  0.0693408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1534  allophanate hydrolase subunit 1  49.77 
 
 		 241 aa  191  9e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4132  putative carboxylase  48.58 
 
 		 243 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2636  hypothetical protein  44.2 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.24477  decreased coverage  0.0000373796 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2832  hypothetical protein  44.2 
 
 		 242 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.812146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2040  hypothetical protein  42.37 
 
 		 243 aa  184  9e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.733064  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1709  Allophanate hydrolase subunit 1  49.31 
 
 		 241 aa  178  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1501  hypothetical protein  43.04 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3430  allophanate hydrolase subunit 1  42.26 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  45.87 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2803  allophanate hydrolase subunit 1  43 
 
 		 221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.733507 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  43.67 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  43.32 
 
 		 229 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3450  hypothetical protein  42.41 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1978  Allophanate hydrolase subunit 1  40.27 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  35.11 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3095  allophanate hydrolase subunit 1  41.78 
 
 		 244 aa  148  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.686624  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  36.13 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  40.37 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2047  allophanate hydrolase subunit 1  40.44 
 
 		 244 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.684193  normal  0.286348 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  37.61 
 
 		 240 aa  142  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1828  Allophanate hydrolase subunit 1  38.01 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700808  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  41.23 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  38.91 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  33.93 
 
 		 229 aa  138  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  34.78 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  39.35 
 
 		 218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  30.63 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1030  allophanate hydrolase subunit 1  36.82 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  35.11 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1172  hypothetical protein  31.39 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1437  putative allophanate hydrolase subunit 1  33.94 
 
 		 239 aa  128  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  32.17 
 
 		 237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  32.17 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1737  allophanate hydrolase subunit 1  29.6 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.215551 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  32.17 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0360  allophanate hydrolase subunit 1  31.39 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.120122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  32.17 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  32.61 
 
 		 237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  33.62 
 
 		 242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  32.17 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0372  allophanate hydrolase subunit 1  36.02 
 
 		 249 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  0.529517 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  31.74 
 
 		 237 aa  124  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  32.17 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2062  allophanate hydrolase subunit 1  32.49 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.206067  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  31.74 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  30.36 
 
 		 244 aa  122  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  30.36 
 
 		 244 aa  122  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  40.18 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  30.87 
 
 		 237 aa  121  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2057  allophanate hydrolase subunit 1  34.33 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1498  allophanate hydrolase subunit 1  34.26 
 
 		 227 aa  119  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1713  hypothetical protein  31 
 
 		 246 aa  118  7.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.115565  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  37.69 
 
 		 499 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  38.28 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1900  hypothetical protein  30.6 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1527  hypothetical protein  31 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  38.07 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0899  Allophanate hydrolase subunit 1  38.92 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  38.28 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  34.2 
 
 		 539 aa  113  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4346  allophanate hydrolase subunit 1  34.85 
 
 		 201 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  34.98 
 
 		 531 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1829  Allophanate hydrolase subunit 2  36.49 
 
 		 506 aa  112  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  35.71 
 
 		 218 aa  111  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0544  putative allophanate hydrolase  32.17 
 
 		 549 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00179093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  36.62 
 
 		 256 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  37.32 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  36.62 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  33.64 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  36.67 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  37.32 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  37.32 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  36.62 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  37.32 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  36.67 
 
 		 218 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  36.67 
 
 		 218 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  36.67 
 
 		 218 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  36.67 
 
 		 218 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  35.75 
 
 		 553 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  34.43 
 
 		 218 aa  109  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  35.75 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05796  allophanate hydrolase, subunit 1  35.71 
 
 		 230 aa  108  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3548  allophanate hydrolase subunit 1  29.44 
 
 		 234 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1214  allophanate hydrolase subunit 1  36.02 
 
 		 218 aa  108  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  0.0321852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3876  allophanate hydrolase subunit 1  36.02 
 
 		 231 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.348545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1969  hypothetical protein  36.19 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.129668  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0466  Allophanate hydrolase subunit 1  35.5 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0322  allophanate hydrolase subunit 2  36.79 
 
 		 522 aa  105  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12460  allophanate hydrolase subunit 1  37.67 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  33.64 
 
 		 541 aa  105  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>