243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3353 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3353  allophanate hydrolase subunit 1  100 
 
 		 244 aa  476  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2132  allophanate hydrolase subunit 1  70.51 
 
 		 240 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.317589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1104  Allophanate hydrolase subunit 1  69.46 
 
 		 244 aa  298  5e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0177742  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1496  allophanate hydrolase subunit 1  59.4 
 
 		 252 aa  270  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5815  allophanate hydrolase subunit 1  49.79 
 
 		 244 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100836  normal  0.0693408 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3141  allophanate hydrolase subunit 1  48.72 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1385  Allophanate hydrolase subunit 1  48.72 
 
 		 242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.949213 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1814  Allophanate hydrolase subunit 1  47.27 
 
 		 241 aa  188  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21016  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1534  allophanate hydrolase subunit 1  47.27 
 
 		 241 aa  188  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2624  hypothetical protein  43.33 
 
 		 249 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2636  hypothetical protein  41.95 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.24477  decreased coverage  0.0000373796 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2832  hypothetical protein  42.37 
 
 		 242 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.812146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2040  hypothetical protein  42.44 
 
 		 243 aa  181  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.733064  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1501  hypothetical protein  42.8 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1709  Allophanate hydrolase subunit 1  46.41 
 
 		 241 aa  178  8e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2958  Allophanate hydrolase subunit 1  39.66 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4132  putative carboxylase  42.06 
 
 		 243 aa  171  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3430  allophanate hydrolase subunit 1  42.86 
 
 		 257 aa  171  7.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2047  allophanate hydrolase subunit 1  40.25 
 
 		 244 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.684193  normal  0.286348 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3095  allophanate hydrolase subunit 1  42.32 
 
 		 244 aa  165  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.686624  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  42.22 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3450  hypothetical protein  41.91 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1978  Allophanate hydrolase subunit 1  40.91 
 
 		 235 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  40.09 
 
 		 253 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  34.19 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2803  allophanate hydrolase subunit 1  38.65 
 
 		 221 aa  148  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.733507 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  37.22 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  37.56 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  31.67 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  36.77 
 
 		 242 aa  145  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  40.17 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  34.13 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  31.25 
 
 		 229 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1828  Allophanate hydrolase subunit 1  39.25 
 
 		 227 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700808  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  35.68 
 
 		 240 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  39.25 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  33.03 
 
 		 238 aa  135  7.000000000000001e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  32.75 
 
 		 237 aa  134  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  33.04 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  34.43 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  31.7 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  31.7 
 
 		 237 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  31.7 
 
 		 237 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  31.7 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  31.7 
 
 		 237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2062  allophanate hydrolase subunit 1  32 
 
 		 233 aa  129  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.206067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  31.25 
 
 		 237 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0899  Allophanate hydrolase subunit 1  38.97 
 
 		 221 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  38.86 
 
 		 204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  32.14 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  31.7 
 
 		 237 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  39.11 
 
 		 499 aa  125  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0372  allophanate hydrolase subunit 1  35.74 
 
 		 249 aa  123  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  0.529517 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  36.97 
 
 		 215 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06200  conserved hypothetical protein TIGR00370  36.97 
 
 		 203 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.288812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  37.61 
 
 		 225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4346  allophanate hydrolase subunit 1  34.48 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  40.41 
 
 		 541 aa  115  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1713  hypothetical protein  28.09 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.115565  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  37.33 
 
 		 539 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1900  hypothetical protein  27.66 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  26.17 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  26.17 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3548  allophanate hydrolase subunit 1  28.83 
 
 		 234 aa  112  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1498  allophanate hydrolase subunit 1  31.51 
 
 		 227 aa  112  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0869  hypothetical protein  34.47 
 
 		 218 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0772  hypothetical protein  34.47 
 
 		 218 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.984819 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0835  hypothetical protein  34.47 
 
 		 218 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.473252  hitchhiker  0.00249119 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0820  hypothetical protein  34.47 
 
 		 218 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0759  hypothetical protein  34.47 
 
 		 218 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  36.32 
 
 		 217 aa  111  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1527  hypothetical protein  28.09 
 
 		 246 aa  111  9e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  36.54 
 
 		 531 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  36.45 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2374  Allophanate hydrolase subunit 1  36.45 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1172  hypothetical protein  25.78 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  38.46 
 
 		 216 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  34.96 
 
 		 225 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2790  Allophanate hydrolase subunit 1  43.85 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  35.21 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  35.38 
 
 		 218 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  35.38 
 
 		 218 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  35.38 
 
 		 218 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  35.38 
 
 		 218 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  32.62 
 
 		 240 aa  108  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  35.21 
 
 		 256 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1030  allophanate hydrolase subunit 1  31.54 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  35.21 
 
 		 256 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  34.91 
 
 		 259 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  34.47 
 
 		 218 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  36.36 
 
 		 216 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1406  allophanate hydrolase subunit 1  36.67 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  35.38 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  33.81 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1984  hypothetical protein  30.09 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  36.62 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  31.71 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01081  Allophanate hydrolase, subunit 1  30.26 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.805249  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  33.17 
 
 		 549 aa  106  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  36.45 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>