More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0278 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0278  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 325 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.277872  hitchhiker  0.00340207 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2809  LysR family transcriptional regulator  98.77 
 
 		 325 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0297  LysR family transcriptional regulator  98.77 
 
 		 325 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.479957  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4613  transcriptional regulator, LysR family  58.22 
 
 		 296 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.565718 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4348  transcriptional regulator, LysR family  57.34 
 
 		 297 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.311004 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2230  LysR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5983  LysR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 303 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.231961  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5420  transcriptional regulator, LysR family  43.1 
 
 		 307 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4915  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1973  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4053  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 302 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4313  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 302 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33440  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0395632  normal  0.113428 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3747  LysR, substrate-binding  35.96 
 
 		 301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3472  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01082  transcriptional regulator  39.46 
 
 		 337 aa  196  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000539431  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06237  transcriptional regulator  39.46 
 
 		 337 aa  196  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2842  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 		 322 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.163599  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01787  transcription regulator protein  37.29 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.933146 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1781  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4821  transcriptional regulator, LysR family  42.52 
 
 		 305 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3744  transcriptional regulator, LysR family  42.52 
 
 		 305 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1442  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.6 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0243  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2532  transcriptional regulator, LysR family  38.23 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3985  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 294 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 294 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2104  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1994  LysR family substrate binding transcriptional regulator  40.07 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.415294  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2357  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  40.07 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  0.547268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4759  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 314 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.983634  normal  0.183649 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0773  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00220265  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0999  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4261  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 303 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.902003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8248  transcriptional regulator, LysR family  38.49 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.73 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0615  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.683803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1915  transcriptional regulator, LysR family  41.73 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  36.6 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  36.67 
 
 		 335 aa  179  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 305 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3610  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 302 aa  179  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0830  transcriptional regulator, LysR family  41.87 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.588944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2542  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal  0.053524 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4320  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 307 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1955  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.043876 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39160  LysR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.255585  normal  0.408672 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 295 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_003296  RS05463  transcription regulator protein  39.8 
 
 		 305 aa  176  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.163697 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 301 aa  175  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3214  transcriptional regulator, LysR family  38.51 
 
 		 299 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00397323 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2339  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 317 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4416  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1472  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1688  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1518  transcriptional regulator, LysR family  36.58 
 
 		 317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4992  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.18 
 
 		 304 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170896  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2154  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.224535  normal  0.610808 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  37.97 
 
 		 293 aa  172  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5304  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 303 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5159  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 303 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345446  normal  0.286178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5249  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 303 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3143  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 336 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937784  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0225  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 303 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4685  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 301 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775055  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3986  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0720  transcriptional regulator, LysR family  40.77 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4263  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.391438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3064  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1948  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 325 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0632109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17760  Transcriptional regulator, LysR family  38.44 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3206  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2006  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.126264  normal  0.0111016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0806  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 312 aa  169  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0756  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 305 aa  169  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2361  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4614  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 314 aa  169  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0515888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  39.04 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1127  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1405  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223999  normal  0.124738 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0616  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2632  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0518  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3335  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4153  transcriptional regulator, LysR family  36.73 
 
 		 315 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>