More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3450 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
293 aa  560  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13210  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  51.25 
 
 
290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.139405  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.73 
 
 
284 aa  202  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
310 aa  202  5e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.96 
 
 
312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2756  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
303 aa  195  6e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
287 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.5 
 
 
289 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133944  normal  0.758242 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  38.35 
 
 
299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  38.35 
 
 
299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  38.35 
 
 
299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  38.35 
 
 
299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  38.35 
 
 
299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  39.18 
 
 
288 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
274 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 
289 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00661065  normal  0.0160024 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.6 
 
 
284 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  39.58 
 
 
282 aa  186  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.63 
 
 
280 aa  186  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0643  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.39 
 
 
292 aa  185  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
280 aa  185  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
285 aa  185  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
287 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.144364 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
280 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5089  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  41.27 
 
 
293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.6 
 
 
285 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.35 
 
 
291 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
308 aa  180  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  38.21 
 
 
285 aa  179  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3822  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.58 
 
 
305 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.429723  normal  0.768739 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1343  peptide ABC transporter, permease protein, putative  42.41 
 
 
479 aa  178  7e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.736839  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1282  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.26 
 
 
300 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284613  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
309 aa  176  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
284 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
301 aa  176  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
299 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
304 aa  176  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
310 aa  176  6e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
295 aa  175  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.41 
 
 
310 aa  175  9e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.361284  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.35 
 
 
326 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.0495653 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2574  peptide ABC transporter, permease protein  41.8 
 
 
302 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339829  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  35 
 
 
279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.04 
 
 
650 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0892214 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  37.5 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3739  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146994  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.58779  normal  0.456296 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.7 
 
 
302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.71 
 
 
494 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.16 
 
 
315 aa  172  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.26 
 
 
334 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
278 aa  172  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4006  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
304 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  37.59 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 
310 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362913 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.71 
 
 
485 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.431647  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1251  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  38.32 
 
 
304 aa  172  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
495 aa  172  9e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.99676  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.83 
 
 
284 aa  171  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.317489  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001972  peptide ABC transporter permease component  35.35 
 
 
318 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.32 
 
 
304 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.043674 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 
311 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.23044 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.32 
 
 
304 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.887785  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.32 
 
 
304 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0666762  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
304 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1157  peptide ABC transporter, permease protein, putative  41.35 
 
 
473 aa  169  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 
310 aa  170  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3655  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.52 
 
 
317 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158741  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
301 aa  169  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2265  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.39 
 
 
302 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0825509  normal  0.518355 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
300 aa  169  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.765267  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.35 
 
 
496 aa  169  6e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.3 
 
 
302 aa  169  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.7 
 
 
285 aa  169  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 
293 aa  169  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.02 
 
 
302 aa  168  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2855  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  37.41 
 
 
322 aa  168  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 
309 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  37.4 
 
 
300 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
300 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
291 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0370  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  34.75 
 
 
284 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
301 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0236512  normal  0.473156 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
497 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.826633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.673068  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.673312 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  38.19 
 
 
300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4454  opine ABC transporter, permease protein, putative  37.55 
 
 
290 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000504442 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1093  peptide ABC transporter, permease protein, putative  42.31 
 
 
296 aa  166  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
309 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
300 aa  166  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
309 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.182989 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.61 
 
 
272 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1309  ABC transporter, permease protein  36.86 
 
 
313 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0351291  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.19 
 
 
300 aa  166  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.641847 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.36 
 
 
283 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.292218  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>