More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA0998 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0998  transporter, putative  100 
 
 		 246 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.19161  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2251  putative ABC transport system, membrane protein  99.19 
 
 		 246 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.713684  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2056  ABC-2 type transporter, permease protein  99.19 
 
 		 246 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2111  ABC-2 type transporter, permease protein  99.19 
 
 		 246 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  93.09 
 
 		 246 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  34.94 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.51 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  35.62 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  36.59 
 
 		 270 aa  125  5e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  31.96 
 
 		 264 aa  115  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.99 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  31.84 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.62 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  33.04 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  30.18 
 
 		 284 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  34.88 
 
 		 289 aa  111  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  35.05 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  31.06 
 
 		 249 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.62 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  30.95 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.69 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.09 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.98 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 258 aa  102  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  28.98 
 
 		 249 aa  99.8  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  33.18 
 
 		 281 aa  99.4  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  32.04 
 
 		 270 aa  97.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  35.41 
 
 		 280 aa  97.1  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  34.56 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  29.61 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.56 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.22 
 
 		 253 aa  96.3  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  26.73 
 
 		 260 aa  95.9  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  31.22 
 
 		 255 aa  95.9  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3136  ABC-2 type transporter  32.6 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  32.78 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.67 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.51 
 
 		 256 aa  92.8  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.67 
 
 		 253 aa  92.8  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  29.7 
 
 		 276 aa  92.8  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.51 
 
 		 256 aa  92.4  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 		 297 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  30.54 
 
 		 280 aa  90.5  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  31.68 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000116393 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  29.64 
 
 		 272 aa  89.7  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  30.73 
 
 		 270 aa  88.6  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  32 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3036  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 		 263 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0030  ABC-2 type transporter  29.51 
 
 		 272 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2667  ABC transporter  30.49 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0137793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3096  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 263 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  31.63 
 
 		 286 aa  85.5  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  29.95 
 
 		 251 aa  85.1  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  27.87 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1281  ABC transporter, permease protein  30.67 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640698  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1789  ABC-2 type transporter  33.62 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5008  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2845  ABC-2 type transporter  30.13 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  31.88 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  31.88 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  23.88 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5312  ABC-2 type transporter  29.51 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  29.57 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2716  ABC-2 type transporter  29.65 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722099  normal  0.404026 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  26.7 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2668  putative ABC-2 type transporter  31.53 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.149875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  29.1 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3261  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  30.26 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  27.96 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2829  daunorubicin resistance protein C  29.52 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2858  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  29.52 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2873  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  29.52 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0411  ABC-2 type transporter  31.49 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.164581 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  27.15 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0379  ABC-2 type transporter  31.49 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0899  ABC transporter, inner membrane subunit  35.78 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208954  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  25.99 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2590  efflux ABC transporter, permease protein  32.54 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.717698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0447  ABC-2 type transporter  31.36 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  25.85 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0010  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0265688  normal  0.974707 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4200  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 286 aa  72  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0950  ABC-2 type transporter  35.32 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  27.36 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0948  ABC-2 type transporter  35.05 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0389515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>