More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0427 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0427  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 127 aa  249  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0439  50S ribosomal protein L21  76.38 
 
 		 146 aa  170  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0514  50S ribosomal protein L21  77.87 
 
 		 128 aa  168  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0589  50S ribosomal protein L21  76.92 
 
 		 128 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0151  50S ribosomal protein L21  75.21 
 
 		 126 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.772781  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0246  50S ribosomal protein L21  74.36 
 
 		 128 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0153  50S ribosomal protein L21  70.23 
 
 		 132 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 		 142 aa  130  7.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  63.11 
 
 		 188 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  62.14 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  59.8 
 
 		 104 aa  127  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  52.03 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 103 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 105 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 105 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  56.44 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  54.46 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  50.46 
 
 		 198 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3461  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  65.45 
 
 		 230 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2589  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  48.62 
 
 		 136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  48.62 
 
 		 131 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  48.62 
 
 		 131 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  45.77 
 
 		 140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  50.46 
 
 		 221 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  54.08 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  49.02 
 
 		 258 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  50 
 
 		 223 aa  101  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  50.5 
 
 		 104 aa  99.8  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 102 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4210  50S ribosomal protein L21  61.76 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4723  50S ribosomal protein L21  61.17 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  47 
 
 		 102 aa  95.9  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 102 aa  94  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 102 aa  93.6  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 171 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 102 aa  92.8  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  92  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4922  50S ribosomal protein L21  47.41 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0179671  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0183  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 102 aa  90.9  5e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4877  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4414  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3141  ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  0.717377 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  41 
 
 		 149 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1416  50S ribosomal protein L21  44 
 
 		 102 aa  89.4  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  43.56 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2001  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 120 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536247  normal  0.99837 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1340  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 102 aa  87.8  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0383215  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2695  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 120 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 102 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  38.71 
 
 		 130 aa  87.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0502  ribosomal protein L21  44 
 
 		 102 aa  86.7  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0089  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 102 aa  86.7  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199465  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0129  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 102 aa  86.7  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  46 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0098  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  36.51 
 
 		 208 aa  85.9  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1538  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  42 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  36.44 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  39.25 
 
 		 224 aa  84  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  43.56 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  37.29 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2142  ribosomal protein L21  56 
 
 		 124 aa  83.6  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 104 aa  83.6  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  40.19 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>