More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0514 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0514  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 128 aa  248  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0439  50S ribosomal protein L21  92.13 
 
 		 146 aa  204  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0153  50S ribosomal protein L21  91.45 
 
 		 132 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0246  50S ribosomal protein L21  88.89 
 
 		 128 aa  183  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0589  50S ribosomal protein L21  88.89 
 
 		 128 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0151  50S ribosomal protein L21  88.89 
 
 		 126 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.772781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0427  50S ribosomal protein L21  79.46 
 
 		 127 aa  155  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  52.31 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  59.62 
 
 		 142 aa  126  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  59.62 
 
 		 188 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  58.65 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  56.19 
 
 		 198 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 		 105 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  49.52 
 
 		 131 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  49.52 
 
 		 131 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3461  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  62.39 
 
 		 230 aa  110  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2589  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  49.52 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  46.56 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  50.46 
 
 		 221 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  49.52 
 
 		 258 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4414  50S ribosomal protein L21  50.43 
 
 		 130 aa  100  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4877  50S ribosomal protein L21  50.43 
 
 		 130 aa  100  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4210  50S ribosomal protein L21  61.54 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  55.1 
 
 		 100 aa  99.8  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4922  50S ribosomal protein L21  49.57 
 
 		 130 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0179671  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  49.51 
 
 		 104 aa  99.4  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  50 
 
 		 223 aa  99  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4723  50S ribosomal protein L21  59.05 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 102 aa  94.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  45.1 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  43 
 
 		 102 aa  90.5  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  90.5  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  90.5  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 102 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 102 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 102 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 102 aa  88.2  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 102 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3141  ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 104 aa  87  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  0.717377 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  87  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 102 aa  87  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2142  ribosomal protein L21  50.43 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  45.28 
 
 		 171 aa  86.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0108  50S ribosomal protein L21  53.85 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.111218 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 115 aa  85.9  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0183  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  84.7  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  43.69 
 
 		 103 aa  84.3  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1340  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0383215  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  84.3  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 104 aa  84  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1416  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2001  50S ribosomal protein L21  36.21 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536247  normal  0.99837 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>