More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2505 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 220 aa  438  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0429687  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.83 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0300911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.06 
 
 		 286 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.72 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09850  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  45.63 
 
 		 297 aa  128  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.414551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.930868  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21900  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  45.32 
 
 		 272 aa  118  7.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.509976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41710  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 		 266 aa  102  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  34.13 
 
 		 294 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.01 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 		 339 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  36.23 
 
 		 292 aa  99  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  33.17 
 
 		 270 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.11 
 
 		 238 aa  96.7  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 		 279 aa  97.1  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.74 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.21 
 
 		 239 aa  96.3  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2965  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 		 293 aa  96.3  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1934  hypothetical protein  33.78 
 
 		 300 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0777827  normal  0.376049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.81 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.21 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.21 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.21 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.21 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.21 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.21 
 
 		 239 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.21 
 
 		 239 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.21 
 
 		 239 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.21 
 
 		 239 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4106  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 295 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  33.17 
 
 		 271 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1791  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 		 285 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  33.66 
 
 		 269 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 275 aa  93.6  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  33.66 
 
 		 271 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.02 
 
 		 246 aa  93.6  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1810  short chain dehydrogenase  37.24 
 
 		 285 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.68 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1857  short chain dehydrogenase  37.24 
 
 		 285 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  33.68 
 
 		 257 aa  92.8  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 		 289 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163818  normal  0.320822 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 		 270 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.349709 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13073  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein  32.32 
 
 		 253 aa  92.4  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  34.62 
 
 		 289 aa  91.7  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  33.17 
 
 		 269 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.51 
 
 		 246 aa  91.3  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  33.66 
 
 		 269 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 		 253 aa  90.9  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0429  short chain dehydrogenase  34.72 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0101  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36 
 
 		 302 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1539  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36 
 
 		 302 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 308 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  hitchhiker  0.00146118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0293  short chain dehydrogenase  34.9 
 
 		 267 aa  90.5  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0120  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36 
 
 		 302 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.5 
 
 		 274 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1262  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36 
 
 		 302 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 		 263 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2596  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 		 287 aa  89.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1074  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36 
 
 		 302 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 		 299 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 		 263 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.5 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 		 263 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 		 263 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2820  dehydrogenases with different specificities  36 
 
 		 302 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2673  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36 
 
 		 302 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 		 263 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0404  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.5 
 
 		 302 aa  89.4  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  31.71 
 
 		 270 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0974  acetoin reductase  32.99 
 
 		 257 aa  89.4  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 		 250 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0741311 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 		 263 aa  89  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 263 aa  89  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 		 263 aa  89  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  34.52 
 
 		 263 aa  89  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 		 263 aa  89  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.03 
 
 		 274 aa  89  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.239905  normal  0.858139 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 		 263 aa  89  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 		 351 aa  89  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 		 263 aa  89  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 		 263 aa  89  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 		 263 aa  89  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 		 253 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3918  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 		 267 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 242 aa  88.6  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3588  short chain dehydrogenase  35.68 
 
 		 267 aa  88.6  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  31.71 
 
 		 270 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3844  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 		 267 aa  88.6  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000447473 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0441  short chain dehydrogenase  35.68 
 
 		 267 aa  88.6  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0416  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 		 267 aa  88.6  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0437  short chain dehydrogenase  35.68 
 
 		 267 aa  88.6  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4040  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 		 267 aa  88.6  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 		 253 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37 
 
 		 308 aa  88.2  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 		 300 aa  88.2  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514987 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 295 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  35.82 
 
 		 253 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.21 
 
 		 285 aa  87.8  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>