More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0798 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0798  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 
493 aa  1019    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000990239  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2083  lysyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 
500 aa  457  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.139687 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 
494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 
494 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 
489 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 
493 aa  442  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 
494 aa  440  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
490 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 
495 aa  432  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
499 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
515 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
499 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
515 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 
510 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
499 aa  427  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
499 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
499 aa  428  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
499 aa  428  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
499 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
489 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
499 aa  428  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
499 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
499 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 
507 aa  423  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
491 aa  425  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
499 aa  422  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 
494 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 
499 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
499 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 
511 aa  413  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0968  lysyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
515 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.685874 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 
503 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
495 aa  408  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1586  lysyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 
507 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1034  lysyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 
496 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
509 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 
484 aa  404  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1642  lysyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 
498 aa  404  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.573049  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 
573 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
502 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
494 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
501 aa  403  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
511 aa  402  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 
496 aa  403  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0538  lysyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 
498 aa  404  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000249001  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
491 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
496 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
488 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 
497 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 
573 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 
509 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 
496 aa  397  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
504 aa  398  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
561 aa  396  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
489 aa  396  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 
501 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 
502 aa  393  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
492 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2341  lysyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 
508 aa  394  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1508  lysyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
514 aa  394  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.781573  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 
504 aa  393  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 
503 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
509 aa  395  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1601  lysyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 
577 aa  392  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000097302  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 
501 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 
508 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 
512 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
492 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 
497 aa  390  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
511 aa  389  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
513 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1667  lysyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
515 aa  389  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.208313  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 
502 aa  391  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2275  lysyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
507 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0797  lysyl-tRNA synthetase  43 
 
 
509 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0164991 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 
513 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
508 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
492 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 
499 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  43 
 
 
501 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  40.16 
 
 
505 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 
505 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 
505 aa  386  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1741  hypothetical protein  42.55 
 
 
496 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1741  hypothetical protein  42.02 
 
 
496 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 
505 aa  386  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
502 aa  385  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  40.85 
 
 
491 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
532 aa  388  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0726  lysyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
504 aa  388  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000447446  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
562 aa  386  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 
505 aa  386  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  40.75 
 
 
505 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  40.16 
 
 
505 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 
505 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1804  lysyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
499 aa  385  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 
505 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 
505 aa  387  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
573 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 
505 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>