More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2083 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2083  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 500 aa  1024    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139687 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 494 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 		 494 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 495 aa  465  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 515 aa  463  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 515 aa  463  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 499 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 499 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 499 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 499 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 499 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 499 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 499 aa  457  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 499 aa  456  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0798  lysyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 493 aa  457  1e-127  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000990239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 510 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 495 aa  451  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 497 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 499 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 		 493 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 496 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 489 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 504 aa  442  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 489 aa  445  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 490 aa  442  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  46.29 
 
 		 508 aa  442  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 496 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 488 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 491 aa  438  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 503 aa  435  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 647 aa  436  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0280  lysyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 		 504 aa  436  1e-121  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0337786  hitchhiker  0.000160762 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 494 aa  436  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  46.29 
 
 		 499 aa  432  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 507 aa  428  1e-119  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 561 aa  429  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 505 aa  430  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 501 aa  430  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 505 aa  428  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 573 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 509 aa  427  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 499 aa  428  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 484 aa  426  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1176  lysyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 		 511 aa  426  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 492 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 505 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 501 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 489 aa  426  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  45.4 
 
 		 505 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 505 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 496 aa  425  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 		 505 aa  424  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 505 aa  422  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 505 aa  422  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 505 aa  422  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 505 aa  422  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 		 499 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 		 502 aa  424  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  46.91 
 
 		 491 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  45.4 
 
 		 505 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_517  lysyl-tRNA synthetase (class II)  45.01 
 
 		 498 aa  422  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 505 aa  423  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 573 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1601  lysyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 		 577 aa  424  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000097302  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1804  lysyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 499 aa  424  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 505 aa  422  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 505 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  44.93 
 
 		 505 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 505 aa  420  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  44.93 
 
 		 505 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 505 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 505 aa  419  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3851  lysyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 505 aa  421  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0982146 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 505 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0551  lysyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 498 aa  419  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 505 aa  419  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 505 aa  420  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 505 aa  420  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 505 aa  420  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 505 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0924  lysyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 505 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 505 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1477  lysyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 502 aa  420  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0701287  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 499 aa  421  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 505 aa  421  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0883  lysyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 505 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 573 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 505 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 		 505 aa  419  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2275  lysyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 507 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 509 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 494 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 631 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 503 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3428  lysyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 509 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>