More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2569 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2569  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
182 aa  377  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1279  NADH dehydrogenase subunit B  97.8 
 
 
182 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1380  NADH dehydrogenase subunit B  97.25 
 
 
182 aa  371  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.627652  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1291  NADH dehydrogenase subunit B  86.67 
 
 
183 aa  335  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.378148  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.39 
 
 
163 aa  223  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1624  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.39 
 
 
163 aa  223  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.598307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3192  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.39 
 
 
163 aa  223  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4520  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.83 
 
 
167 aa  216  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77546  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4087  NADH dehydrogenase subunit B  56.49 
 
 
180 aa  194  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1245  NADH dehydrogenase subunit B  55.48 
 
 
182 aa  189  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  59.12 
 
 
168 aa  188  2.9999999999999997e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1381  NADH dehydrogenase subunit B  55.33 
 
 
181 aa  187  7e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.186905  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4081  NADH dehydrogenase subunit B  54.67 
 
 
180 aa  187  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.343571  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5099  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.1 
 
 
181 aa  186  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0585  NADH dehydrogenase subunit B  51.85 
 
 
222 aa  182  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0574  NADH dehydrogenase subunit B  51.85 
 
 
222 aa  182  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  50.57 
 
 
183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1698  NADH dehydrogenase subunit B  54.73 
 
 
222 aa  179  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0268752  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7018  NADH dehydrogenase subunit B  52.03 
 
 
187 aa  178  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  54.55 
 
 
184 aa  177  4.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  54.48 
 
 
199 aa  177  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3857  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.45 
 
 
230 aa  177  8e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  53.47 
 
 
216 aa  175  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  53.15 
 
 
183 aa  174  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  54.42 
 
 
182 aa  173  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.23 
 
 
202 aa  173  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.24 
 
 
184 aa  173  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.15 
 
 
183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3198  NADH dehydrogenase subunit B  50.62 
 
 
224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722049  normal  0.022092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3604  NADH dehydrogenase subunit B  50.62 
 
 
224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  53.1 
 
 
182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.69 
 
 
179 aa  171  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28450  NADH dehydrogenase subunit B  49.38 
 
 
224 aa  171  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3366  NADH dehydrogenase I, B subunit  50 
 
 
224 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.01 
 
 
183 aa  171  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30010  NADH dehydrogenase subunit B  48.77 
 
 
225 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  55.86 
 
 
184 aa  170  7.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2569  NADH dehydrogenase subunit B  48.77 
 
 
225 aa  170  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  53.9 
 
 
271 aa  170  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  49.69 
 
 
264 aa  170  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  55.86 
 
 
184 aa  170  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4120  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
225 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  49.68 
 
 
179 aa  170  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1872  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
225 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.681353  normal  0.231818 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  55.17 
 
 
185 aa  170  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  55.86 
 
 
184 aa  169  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.78 
 
 
226 aa  170  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3692  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
225 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.779049  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2413  NADH dehydrogenase subunit B  48.77 
 
 
225 aa  170  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.119197  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1745  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
225 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.440453  normal  0.328312 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  50.34 
 
 
183 aa  169  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.17 
 
 
184 aa  169  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3131  NADH dehydrogenase subunit B  46.43 
 
 
226 aa  169  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  55.17 
 
 
184 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  55.17 
 
 
184 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  59.26 
 
 
787 aa  169  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  48.99 
 
 
178 aa  169  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.69 
 
 
183 aa  168  4e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3307  NADH dehydrogenase subunit B  48.15 
 
 
224 aa  167  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000318013  normal  0.583268 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  46.71 
 
 
220 aa  167  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1370  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.71 
 
 
220 aa  167  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00721379  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  46.71 
 
 
220 aa  167  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  46.71 
 
 
220 aa  167  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1365  NADH dehydrogenase subunit B  46.71 
 
 
220 aa  167  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3426  NADH dehydrogenase subunit B  46.71 
 
 
220 aa  167  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101338  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2580  NADH dehydrogenase subunit B  46.71 
 
 
220 aa  167  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2436  NADH dehydrogenase subunit B  46.71 
 
 
220 aa  167  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2441  NADH dehydrogenase subunit B  46.71 
 
 
220 aa  167  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.675859  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1126  NADH dehydrogenase subunit B  42.7 
 
 
212 aa  167  8e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.75 
 
 
184 aa  167  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2831  NADH dehydrogenase subunit B  48.15 
 
 
224 aa  166  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00179676  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
226 aa  166  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2511  NADH dehydrogenase subunit B  46.71 
 
 
220 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0438233  normal  0.552577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2555  NADH dehydrogenase subunit B  46.71 
 
 
220 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225165  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2566  NADH dehydrogenase subunit B  46.71 
 
 
220 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112494  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2673  NADH dehydrogenase subunit B  46.71 
 
 
220 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104558  normal  0.525556 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1815  NADH dehydrogenase subunit B  47.53 
 
 
225 aa  166  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.65 
 
 
183 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  50.69 
 
 
226 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2466  NADH dehydrogenase subunit B  46.71 
 
 
220 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000315164  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1561  NADH dehydrogenase subunit B  47.53 
 
 
225 aa  166  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  50.35 
 
 
213 aa  166  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 
184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2157  NADH dehydrogenase subunit B  45.18 
 
 
193 aa  165  2.9999999999999998e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00451511 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.05 
 
 
181 aa  165  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4742  NADH dehydrogenase subunit B  53.02 
 
 
208 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578905  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  51.97 
 
 
792 aa  164  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2771  NADH dehydrogenase subunit B  46.3 
 
 
224 aa  164  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1493  NADH dehydrogenase subunit B  46.3 
 
 
224 aa  164  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.195904  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0485  NADH dehydrogenase subunit B  52.82 
 
 
171 aa  164  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  47.56 
 
 
174 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  51.97 
 
 
791 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  50 
 
 
794 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1020  NADH dehydrogenase subunit B  46.91 
 
 
224 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1119  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  45.88 
 
 
231 aa  164  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.722994  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  47.4 
 
 
167 aa  164  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  52.21 
 
 
169 aa  164  9e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  49.09 
 
 
179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1327  NADH dehydrogenase subunit B  52.35 
 
 
208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  55.64 
 
 
793 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>