More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4087 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4087  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 180 aa  375  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5099  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  79.78 
 
 		 181 aa  313  6e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4081  NADH dehydrogenase subunit B  81.01 
 
 		 180 aa  309  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.343571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1245  NADH dehydrogenase subunit B  74.01 
 
 		 182 aa  296  9e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7018  NADH dehydrogenase subunit B  75.42 
 
 		 187 aa  295  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1381  NADH dehydrogenase subunit B  76.11 
 
 		 181 aa  293  8e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.186905  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3857  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.32 
 
 		 230 aa  197  6e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  53.16 
 
 		 183 aa  197  7e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1380  NADH dehydrogenase subunit B  56.49 
 
 		 182 aa  195  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.627652  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1279  NADH dehydrogenase subunit B  56.49 
 
 		 182 aa  195  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2569  NADH dehydrogenase subunit B  56.49 
 
 		 182 aa  194  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.64 
 
 		 163 aa  193  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1624  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.64 
 
 		 163 aa  193  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.598307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3192  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  57.64 
 
 		 163 aa  193  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1291  NADH dehydrogenase subunit B  55.03 
 
 		 183 aa  191  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.378148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 		 183 aa  191  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.04 
 
 		 181 aa  189  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.25 
 
 		 183 aa  189  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  53.9 
 
 		 168 aa  188  2.9999999999999997e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.31 
 
 		 183 aa  185  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  50.67 
 
 		 182 aa  185  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  50.66 
 
 		 167 aa  181  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.83 
 
 		 226 aa  181  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  48.08 
 
 		 184 aa  180  9.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4520  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.69 
 
 		 167 aa  180  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  48.72 
 
 		 184 aa  180  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  47.53 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.35 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2157  NADH dehydrogenase subunit B  53.47 
 
 		 193 aa  179  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00451511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  48.72 
 
 		 184 aa  179  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.02 
 
 		 184 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.1 
 
 		 170 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  49.67 
 
 		 184 aa  178  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.35 
 
 		 184 aa  178  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  49.67 
 
 		 184 aa  178  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  49.66 
 
 		 184 aa  178  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  51.7 
 
 		 184 aa  177  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3358  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  53.29 
 
 		 202 aa  177  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.42 
 
 		 170 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  51.23 
 
 		 170 aa  177  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 174 aa  177  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.65 
 
 		 183 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  50.32 
 
 		 183 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.68 
 
 		 183 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  51.02 
 
 		 182 aa  174  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  50.67 
 
 		 179 aa  174  7e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.71 
 
 		 169 aa  174  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  48.98 
 
 		 226 aa  174  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  48.98 
 
 		 226 aa  173  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  47.27 
 
 		 199 aa  174  9e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0574  NADH dehydrogenase subunit B  57.58 
 
 		 222 aa  173  9e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  50 
 
 		 792 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0585  NADH dehydrogenase subunit B  57.58 
 
 		 222 aa  173  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  52.26 
 
 		 170 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 159 aa  173  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  46.15 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  49.37 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  49.37 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2812  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.252149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  49.37 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  45.57 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  55.64 
 
 		 793 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  52.78 
 
 		 791 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  50.71 
 
 		 794 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  48.28 
 
 		 213 aa  171  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1698  NADH dehydrogenase subunit B  56.82 
 
 		 222 aa  171  5.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0268752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.61 
 
 		 170 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.45 
 
 		 180 aa  170  7.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  50 
 
 		 794 aa  169  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.34 
 
 		 183 aa  169  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  51.72 
 
 		 173 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  48 
 
 		 178 aa  169  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0485  NADH dehydrogenase subunit B  48.28 
 
 		 171 aa  169  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 264 aa  168  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2153  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  52.08 
 
 		 194 aa  167  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  53.96 
 
 		 787 aa  167  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1358  NADH dehydrogenase subunit B  52.27 
 
 		 213 aa  167  7e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0635  NADH dehydrogenase subunit B  48.78 
 
 		 190 aa  166  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  50 
 
 		 271 aa  166  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  53.02 
 
 		 268 aa  166  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1425  NADH dehydrogenase subunit B  49.69 
 
 		 159 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.301169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  50.31 
 
 		 268 aa  165  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  50.31 
 
 		 158 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1494  NADH dehydrogenase subunit B  48.73 
 
 		 159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  49.07 
 
 		 159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1630  NADH dehydrogenase subunit B  53.02 
 
 		 264 aa  164  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  52.05 
 
 		 170 aa  164  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3255  NADH dehydrogenase subunit B  48.43 
 
 		 159 aa  165  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.551584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  46.67 
 
 		 170 aa  164  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  51.75 
 
 		 166 aa  164  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  48.3 
 
 		 794 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  46.45 
 
 		 220 aa  164  8e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2441  NADH dehydrogenase subunit B  46.45 
 
 		 220 aa  164  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.675859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0747  NADH dehydrogenase subunit B  45.45 
 
 		 177 aa  164  8e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000169053  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  46.45 
 
 		 220 aa  164  8e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1365  NADH dehydrogenase subunit B  46.45 
 
 		 220 aa  164  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  46.45 
 
 		 220 aa  164  8e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>