More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4520 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4520  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 		 167 aa  347  3e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1291  NADH dehydrogenase subunit B  60.61 
 
 		 183 aa  221  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.378148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1279  NADH dehydrogenase subunit B  59.04 
 
 		 182 aa  217  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1380  NADH dehydrogenase subunit B  61.54 
 
 		 182 aa  217  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.627652  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2569  NADH dehydrogenase subunit B  57.83 
 
 		 182 aa  216  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.26 
 
 		 163 aa  213  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1624  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.26 
 
 		 163 aa  213  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.598307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3192  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.26 
 
 		 163 aa  213  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0158  NADH-quinone oxidoreductase chain b  53.85 
 
 		 168 aa  189  1e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1381  NADH dehydrogenase subunit B  53.8 
 
 		 181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.186905  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4087  NADH dehydrogenase subunit B  49.69 
 
 		 180 aa  180  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1245  NADH dehydrogenase subunit B  53.62 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0975  NADH dehydrogenase subunit B  49.34 
 
 		 199 aa  177  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0585  NADH dehydrogenase (quinone)  48.7 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5099  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  54.07 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0282  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  47.37 
 
 		 183 aa  175  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1275  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  46.47 
 
 		 216 aa  174  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99313  normal  0.170871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.13 
 
 		 226 aa  173  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7018  NADH dehydrogenase subunit B  49.38 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  48.03 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  44.79 
 
 		 264 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2252  NADH dehydrogenase subunit B  49.66 
 
 		 213 aa  171  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.66 
 
 		 184 aa  171  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4081  NADH dehydrogenase subunit B  49.68 
 
 		 180 aa  170  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.343571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  47.71 
 
 		 271 aa  170  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0485  NADH dehydrogenase subunit B  47.65 
 
 		 171 aa  170  7.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  48.03 
 
 		 182 aa  169  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0268  NADH dehydrogenase subunit B  45.09 
 
 		 184 aa  169  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.220523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4064  NADH dehydrogenase subunit B  43.79 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.108394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4462  NADH dehydrogenase subunit B  46.67 
 
 		 226 aa  168  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  45.22 
 
 		 174 aa  168  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13167  NADH dehydrogenase subunit B  48.68 
 
 		 184 aa  168  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0400  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.68 
 
 		 184 aa  168  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1549  NADH dehydrogenase subunit B  48.68 
 
 		 184 aa  168  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0528108  normal  0.21195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1579  NADH dehydrogenase subunit B  48.68 
 
 		 184 aa  168  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  48.03 
 
 		 184 aa  167  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2157  NADH dehydrogenase subunit B  45.34 
 
 		 193 aa  167  5e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00451511 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5054  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.05 
 
 		 181 aa  167  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4742  NADH dehydrogenase subunit B  54.73 
 
 		 208 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578905  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1884  NADH dehydrogenase subunit B  48.03 
 
 		 184 aa  167  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2694  NADH dehydrogenase subunit B  47.4 
 
 		 185 aa  167  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  46.58 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0540  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.29 
 
 		 183 aa  166  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.687461  normal  0.404608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2715  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  44.97 
 
 		 183 aa  166  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  43.31 
 
 		 180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7690  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.03 
 
 		 184 aa  164  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0470  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  45.7 
 
 		 183 aa  164  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677887  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07390  NADH dehydrogenase subunit B  46.36 
 
 		 183 aa  164  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1348  NADH dehydrogenase subunit B  53.38 
 
 		 208 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.675338 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3857  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.64 
 
 		 230 aa  164  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4417  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  41.57 
 
 		 183 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0521  NADH dehydrogenase subunit B  43.64 
 
 		 184 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3677  NADH dehydrogenase subunit B  42.76 
 
 		 167 aa  162  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974896 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0585  NADH dehydrogenase subunit B  48.2 
 
 		 222 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1327  NADH dehydrogenase subunit B  53.9 
 
 		 208 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0574  NADH dehydrogenase subunit B  48.2 
 
 		 222 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.97 
 
 		 170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2153  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.59 
 
 		 194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  50 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.97 
 
 		 170 aa  162  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1323  NADH dehydrogenase subunit B  42.76 
 
 		 167 aa  162  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  44.94 
 
 		 794 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.97 
 
 		 170 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1698  NADH dehydrogenase subunit B  48.2 
 
 		 222 aa  161  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0268752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0924  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.55 
 
 		 200 aa  160  7e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  46.81 
 
 		 791 aa  160  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  46.36 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  42.95 
 
 		 169 aa  160  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  42.68 
 
 		 794 aa  159  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1126  NADH dehydrogenase subunit B  47.52 
 
 		 212 aa  159  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1828  NADH dehydrogenase subunit B  42.95 
 
 		 169 aa  159  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.124676  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3307  NADH dehydrogenase subunit B  48.92 
 
 		 224 aa  159  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000318013  normal  0.583268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  46.36 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  53.85 
 
 		 787 aa  160  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1264  NADH dehydrogenase subunit B  46.36 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233516 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02212  NADH dehydrogenase subunit B  48.57 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1370  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.57 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00721379  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2511  NADH dehydrogenase subunit B  48.57 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0438233  normal  0.552577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2566  NADH dehydrogenase subunit B  48.57 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3228  NADH dehydrogenase subunit B  44.08 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2555  NADH dehydrogenase subunit B  48.57 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.225165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2466  NADH dehydrogenase subunit B  48.57 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000315164  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2441  NADH dehydrogenase subunit B  48.57 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.675859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2436  NADH dehydrogenase subunit B  48.57 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2580  NADH dehydrogenase subunit B  48.57 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2663  NADH dehydrogenase subunit B  48.57 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102783  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2673  NADH dehydrogenase subunit B  48.57 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.104558  normal  0.525556 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3426  NADH dehydrogenase subunit B  48.57 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1365  NADH dehydrogenase subunit B  48.57 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.806532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02172  hypothetical protein  48.57 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  47.3 
 
 		 170 aa  158  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2831  NADH dehydrogenase subunit B  48.92 
 
 		 224 aa  158  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00179676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  47.52 
 
 		 794 aa  158  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_795  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.48 
 
 		 200 aa  158  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1561  NADH dehydrogenase subunit B  48.92 
 
 		 225 aa  158  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4070  NADH dehydrogenase subunit B  53.1 
 
 		 205 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1815  NADH dehydrogenase subunit B  48.92 
 
 		 225 aa  158  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  45.77 
 
 		 793 aa  158  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  45.03 
 
 		 159 aa  157  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0808  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.14 
 
 		 200 aa  157  7e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>