More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0582 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0582  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 169 aa  328  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0609  response regulator receiver protein  92.59 
 
 		 135 aa  243  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.246424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0617  response regulator receiver protein  91.85 
 
 		 135 aa  242  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.827725  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0625  response regulator receiver protein  80.83 
 
 		 121 aa  194  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0268  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.61 
 
 		 456 aa  72  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540037 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0283  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.61 
 
 		 456 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 126 aa  72  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 457 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2915  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  31.4 
 
 		 457 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 810 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  32.2 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0495  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  30 
 
 		 456 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 758 aa  68.2  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 396 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  34.65 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2406  response regulator receiver domain-containing protein  34.75 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  32.48 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1961  CheA signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 1057 aa  67.8  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 130 aa  67  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  39.53 
 
 		 239 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02147  fused response regulator of ato operon, in two-component system with AtoS: response regulator/sigma54 interaction protein  39.34 
 
 		 461 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1438  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.34 
 
 		 461 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.445705  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2361  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  39.34 
 
 		 461 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.18992  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02106  hypothetical protein  39.34 
 
 		 461 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  32.2 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 935 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1215  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  36.89 
 
 		 471 aa  66.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1319  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1430  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  39.34 
 
 		 461 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.324678  hitchhiker  0.00137179 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  35.25 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0238  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  33.64 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  31.73 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2013  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  36.36 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.067134 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2192  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.74 
 
 		 303 aa  65.1  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.19 
 
 		 423 aa  65.1  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3740  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 454 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0840186  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2369  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  38.52 
 
 		 461 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0790211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  31.93 
 
 		 391 aa  64.7  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0853  sensor histidine kinase/reponse regulator  35.25 
 
 		 845 aa  64.7  0.0000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00134282  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 		 860 aa  64.3  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  35.25 
 
 		 254 aa  64.3  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  35.25 
 
 		 254 aa  64.3  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  35.25 
 
 		 254 aa  64.3  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2784  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0945133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0280  Fis family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.928901  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2666  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.77 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 		 844 aa  63.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3993  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0199898 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0085  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1715  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  35.45 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0766  two component signal transduction response regulator  34.15 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2855  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  35.45 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1919  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  33.08 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1608  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  35.45 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  36.43 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1615  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000138875  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2080  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.59 
 
 		 461 aa  63.5  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  39.25 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2366  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000342445  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.92 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2798  response regulator receiver  32.77 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.151747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0001  response regulator receiver protein  25.21 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000051182 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1847  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 459 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.122843  normal  0.436579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000651793  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2976  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1993  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.4 
 
 		 486 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2623  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35 
 
 		 456 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0467  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117091  normal  0.827791 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0355  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3334  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.42 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3251  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.04 
 
 		 465 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  31.09 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  32.28 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.93 
 
 		 1262 aa  62.4  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0316  two component transcriptional regulator, Fis family  35 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  34.48 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5599  response regulator receiver  40 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.833931  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3485  response regulator  31.78 
 
 		 422 aa  62.4  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3444  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 647 aa  62.4  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1811  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.83 
 
 		 347 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2407  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.83 
 
 		 347 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.21688  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1734  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 461 aa  62.4  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.473605 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1579  response regulator receiver  31.53 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.410227  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0323  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.47332  normal  0.784994 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 182 aa  62  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.29 
 
 		 234 aa  62  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 121 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>