More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0504 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0504  ABC transporter related  100 
 
 		 498 aa  994    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  39.83 
 
 		 512 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  38.16 
 
 		 499 aa  322  7e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  39.57 
 
 		 497 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  39.62 
 
 		 514 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  39.41 
 
 		 512 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  39.41 
 
 		 512 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  39.54 
 
 		 513 aa  319  9e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.04 
 
 		 512 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  39.55 
 
 		 513 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3058  ABC transporter related  37.63 
 
 		 502 aa  312  9e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00083367  normal  0.295827 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  36.08 
 
 		 495 aa  311  1e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  38.41 
 
 		 503 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  36.62 
 
 		 507 aa  309  9e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  39.71 
 
 		 504 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  38.95 
 
 		 508 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  36.88 
 
 		 509 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  33.54 
 
 		 500 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  38.61 
 
 		 516 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  36.88 
 
 		 520 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.83 
 
 		 517 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  38.83 
 
 		 517 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  38.83 
 
 		 517 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  37.45 
 
 		 503 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  38.21 
 
 		 495 aa  302  9e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  36.06 
 
 		 504 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2683  ABC transporter related  39.58 
 
 		 499 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  38.4 
 
 		 510 aa  302  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  37.77 
 
 		 508 aa  301  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  36.4 
 
 		 517 aa  301  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  37.18 
 
 		 503 aa  301  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.32 
 
 		 517 aa  300  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  35.43 
 
 		 501 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3182  ABC transporter related  38.63 
 
 		 518 aa  300  6e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.868778  normal  0.140125 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1920  ABC transporter related  39.25 
 
 		 526 aa  299  8e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.528555  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  38.32 
 
 		 517 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2783  ABC transporter related  37.76 
 
 		 513 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  38.32 
 
 		 517 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2827  ABC transporter related  37.76 
 
 		 513 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.877357  normal  0.0187049 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  35.7 
 
 		 494 aa  298  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  38.32 
 
 		 517 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2907  ABC transporter related  39.58 
 
 		 499 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.78181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2810  ABC transporter related  37.55 
 
 		 513 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  35.57 
 
 		 497 aa  298  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  35.85 
 
 		 527 aa  297  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3644  ABC transporter related  37.68 
 
 		 508 aa  297  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6154  putative sugar (D-ribose) ABC transporter ATP-binding protein  38.31 
 
 		 500 aa  297  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328934 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1247  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.2 
 
 		 499 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.886783  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  37.13 
 
 		 520 aa  296  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  37.7 
 
 		 517 aa  296  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  37.89 
 
 		 517 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  36.06 
 
 		 513 aa  296  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  38.32 
 
 		 514 aa  296  7e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  38.32 
 
 		 514 aa  296  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  38.32 
 
 		 514 aa  296  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  36.48 
 
 		 513 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  37.26 
 
 		 515 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  37.22 
 
 		 503 aa  295  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  38.78 
 
 		 514 aa  295  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  37.89 
 
 		 517 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  38.14 
 
 		 504 aa  295  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3109  ABC transporter related  35.84 
 
 		 500 aa  294  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00977673  hitchhiker  0.0000567489 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0962  ABC transporter related  37.37 
 
 		 495 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3726  ABC transporter related  38.74 
 
 		 522 aa  294  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136325  hitchhiker  0.00703863 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  36.21 
 
 		 506 aa  295  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  37.53 
 
 		 508 aa  294  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  36.15 
 
 		 516 aa  294  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1905  ABC transporter related  39.42 
 
 		 507 aa  294  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308353  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2244  ABC transporter related  38 
 
 		 495 aa  294  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3418  ABC transporter related  37.76 
 
 		 526 aa  294  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.247847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  33.6 
 
 		 493 aa  293  4e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  35.44 
 
 		 524 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  35.44 
 
 		 524 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  35.85 
 
 		 506 aa  293  5e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  35.44 
 
 		 524 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  37.11 
 
 		 517 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  35.85 
 
 		 506 aa  293  6e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  35.44 
 
 		 524 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  36.18 
 
 		 503 aa  292  9e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  35.99 
 
 		 505 aa  292  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3675  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.34 
 
 		 495 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.973573  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  38.46 
 
 		 513 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4263  ABC transporter related  36.95 
 
 		 508 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  36.34 
 
 		 495 aa  291  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1351  ABC transporter related  36.98 
 
 		 508 aa  291  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.387252 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0437  ABC transporter related  35.77 
 
 		 501 aa  291  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1825  ABC transporter related  39.49 
 
 		 505 aa  291  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0788496  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  36.22 
 
 		 528 aa  290  3e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.47 
 
 		 517 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  36.82 
 
 		 519 aa  291  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  36.44 
 
 		 514 aa  290  4e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  36.61 
 
 		 498 aa  290  5.0000000000000004e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  35.81 
 
 		 495 aa  289  8e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  39 
 
 		 507 aa  289  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  32.99 
 
 		 500 aa  288  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4943  xylose transporter ATP-binding subunit  36.51 
 
 		 513 aa  289  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0106818 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43610  ABC transporter  39.62 
 
 		 516 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00213135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  33.4 
 
 		 501 aa  288  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3890  xylose transporter ATP-binding subunit  36.51 
 
 		 513 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4600  ABC transporter related  38.25 
 
 		 513 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.911905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>