More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1516 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1516  ribosomal protein L22  100 
 
 		 151 aa  306  6.999999999999999e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  9.68145e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1773  ribosomal protein L22  51.77 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0105  50S ribosomal protein L22P  47.92 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0006  50S ribosomal protein L22P  45.83 
 
 		 151 aa  134  4e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000018702  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0569  50S ribosomal protein L22P  43.15 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0413889  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1723  ribosomal protein L22  45.21 
 
 		 152 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00000443469  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0096  50S ribosomal protein L22P  43.54 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000729368  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0537  50S ribosomal protein L22P  40.94 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.63908 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1388  50S ribosomal protein L22P  39.19 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0714  50S ribosomal protein L22P  41.22 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00766872  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0447  50S ribosomal protein L22P  38.51 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0102501  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0175  50S ribosomal protein L22P  39.19 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000281865  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1270  50S ribosomal protein L22P  39.19 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000000869512  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0648  50S ribosomal protein L22P  39.19 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000866939  hitchhiker  0.000275224 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0556  50S ribosomal protein L22P  39.46 
 
 		 168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0086  50S ribosomal protein L22P  38 
 
 		 157 aa  107  6e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.438509 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0748  50S ribosomal protein L22P  39.46 
 
 		 185 aa  106  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0770  50S ribosomal protein L22P  38.1 
 
 		 185 aa  105  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1732  50S ribosomal protein L22P  38.78 
 
 		 198 aa  105  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2248  50S ribosomal protein L22P  36.05 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000896212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1833  ribosomal protein L22  38.51 
 
 		 153 aa  102  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0805  50S ribosomal protein L22  35.71 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2444  50S ribosomal protein L22P  35.76 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2297  50S ribosomal protein L22P  37.84 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1930  50S ribosomal protein L22P  32.65 
 
 		 185 aa  91.7  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.70908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0489  ribosomal protein L22  45.6 
 
 		 127 aa  90.1  9e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00776  60S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G14410)  36.11 
 
 		 184 aa  89.4  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.844288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2223  ribosomal protein L22  38.93 
 
 		 159 aa  88.6  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32234  Ribosomal protein L17, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  32.88 
 
 		 183 aa  84.7  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0215  ribosomal protein L22  35.11 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89240  ribosomal protein L17B  32.14 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01720  60s ribosomal protein l17, putative  32.37 
 
 		 182 aa  73.6  0.0000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29177  predicted protein  31.72 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0286  50S ribosomal protein L22  46.67 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  45.07 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  46.48 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  39.51 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  42.67 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0763  50S ribosomal protein L22  42.86 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000122399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1072  50S ribosomal protein L22  43.66 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186157  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  42.25 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  40.85 
 
 		 110 aa  57  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  40.54 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  42.25 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  48.44 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  43.94 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  42.86 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1180  50S ribosomal protein L22  39.24 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78172  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4021  50S ribosomal protein L22  39.24 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552506  hitchhiker  0.00000514416 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1351  50S ribosomal protein L22  39.44 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.622659  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  39.44 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  39.44 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0271  ribosomal protein L22  41.54 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163143  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0084  50S ribosomal protein L22  40 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  41.43 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0685  50S ribosomal protein L22  41.43 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.735331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1684  ribosomal protein L22  41.18 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000041198  hitchhiker  0.0000116755 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0713  50S ribosomal protein L22  36.47 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.41885  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  42.67 
 
 		 212 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  38.03 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  41.1 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3333  50S ribosomal protein L22  33.63 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000000899002  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1960  50S ribosomal protein L22  38.89 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  39.47 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17441  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1359  50S ribosomal protein L22  30 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0319534 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23420  LSU ribosomal protein L22P  38.36 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000199226  hitchhiker  0.000000104974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2445  50S ribosomal protein L22  39.71 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0371  50S ribosomal protein L22  37.5 
 
 		 121 aa  51.6  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.300281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  42.42 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0231  50S ribosomal protein L22/unknown domain fusion protein  36.36 
 
 		 311 aa  51.6  0.000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.415119  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2167  50S ribosomal protein L22  39.71 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.191137 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  38.16 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  40.54 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17601  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0244  50S ribosomal protein L22  38.67 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1124  50S ribosomal protein L22  40.91 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1645  50S ribosomal protein L22  37.14 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19981  50S ribosomal protein L22  40.91 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.508737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  35.21 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0247  50S ribosomal protein L22  38.67 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3662  50S ribosomal protein L22  39.71 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  40.58 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2128  50S ribosomal protein L22  39.71 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.570722 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23071  50S ribosomal protein L22  37.5 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0696  50S ribosomal protein L22  40.91 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00931457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  40 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3443  50S ribosomal protein L22  39.71 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  40.85 
 
 		 115 aa  50.8  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1550  50S ribosomal protein L22  38.24 
 
 		 128 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  42.19 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2300  50S ribosomal protein L22  39.71 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.823648  normal  0.116572 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3179  50S ribosomal protein L22  39.71 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  43.75 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  42.19 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  38.03 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0055  50S ribosomal protein L22  34.23 
 
 		 111 aa  50.4  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000185707  hitchhiker  6.04207e-20 
 
 
-
 
NC_002978  WD0676  50S ribosomal protein L22  41.79 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0432957  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl128  50S ribosomal protein L22  39.39 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3519  ribosomal protein L22  32.32 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000743779  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>