40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1930 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1930  50S ribosomal protein L22P  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.70908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1732  50S ribosomal protein L22P  55.81 
 
 		 198 aa  208  4e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0748  50S ribosomal protein L22P  54.65 
 
 		 185 aa  204  5e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0770  50S ribosomal protein L22P  56.98 
 
 		 185 aa  202  2e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0556  50S ribosomal protein L22P  57.23 
 
 		 168 aa  201  4e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0569  50S ribosomal protein L22P  39.87 
 
 		 153 aa  124  9e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0413889  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2248  50S ribosomal protein L22P  44 
 
 		 154 aa  117  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000896212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0537  50S ribosomal protein L22P  38.51 
 
 		 154 aa  115  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.63908 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0086  50S ribosomal protein L22P  35.26 
 
 		 157 aa  111  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.438509 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1723  ribosomal protein L22  39.33 
 
 		 152 aa  109  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00000443469  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0105  50S ribosomal protein L22P  38.51 
 
 		 151 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0447  50S ribosomal protein L22P  37.16 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0102501  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0006  50S ribosomal protein L22P  37.58 
 
 		 151 aa  106  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000018702  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0489  ribosomal protein L22  42.31 
 
 		 127 aa  104  7e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1388  50S ribosomal protein L22P  33.99 
 
 		 153 aa  103  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0714  50S ribosomal protein L22P  34.64 
 
 		 153 aa  102  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00766872  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1270  50S ribosomal protein L22P  35.29 
 
 		 153 aa  98.2  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000000869512  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0648  50S ribosomal protein L22P  35.29 
 
 		 153 aa  98.2  6e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000866939  hitchhiker  0.000275224 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0175  50S ribosomal protein L22P  35.29 
 
 		 153 aa  98.2  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000281865  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0805  50S ribosomal protein L22  37.21 
 
 		 152 aa  94.7  7e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2223  ribosomal protein L22  36.57 
 
 		 159 aa  91.7  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1833  ribosomal protein L22  32.43 
 
 		 153 aa  85.1  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.271117 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00776  60S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G14410)  33.33 
 
 		 184 aa  84.7  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.844288  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1773  ribosomal protein L22  31.69 
 
 		 157 aa  84  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2297  50S ribosomal protein L22P  31.08 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1516  ribosomal protein L22  32.45 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  9.68145e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0215  ribosomal protein L22  32.09 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2444  50S ribosomal protein L22P  31.33 
 
 		 154 aa  77.4  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32234  Ribosomal protein L17, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  28.77 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0096  50S ribosomal protein L22P  29.77 
 
 		 156 aa  72  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000729368  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01720  60s ribosomal protein l17, putative  29.41 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29177  predicted protein  27.84 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89240  ribosomal protein L17B  28.99 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  35.82 
 
 		 119 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0270  ribosomal protein L22  38.33 
 
 		 121 aa  44.7  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000922526  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1179  ribosomal protein L22  34.29 
 
 		 110 aa  43.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000146322  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0286  50S ribosomal protein L22  36.21 
 
 		 116 aa  42.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0247  50S ribosomal protein L22  36.84 
 
 		 120 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0244  50S ribosomal protein L22  36.84 
 
 		 120 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  32.91 
 
 		 125 aa  41.2  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>