281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0714 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0714  50S ribosomal protein L22P  100 
 
 
153 aa  313  4e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00766872  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0648  50S ribosomal protein L22P  84.31 
 
 
153 aa  275  1e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000866939  hitchhiker  0.000275224 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1270  50S ribosomal protein L22P  84.31 
 
 
153 aa  275  1e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000000869512  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0175  50S ribosomal protein L22P  84.31 
 
 
153 aa  275  1e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000281865  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1388  50S ribosomal protein L22P  75.82 
 
 
153 aa  249  8.000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1723  ribosomal protein L22  52.32 
 
 
152 aa  158  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00000443469  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2248  50S ribosomal protein L22P  46.36 
 
 
154 aa  150  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000896212  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0105  50S ribosomal protein L22P  49.34 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379943  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0006  50S ribosomal protein L22P  45.39 
 
 
151 aa  136  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000018702  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0447  50S ribosomal protein L22P  43.33 
 
 
156 aa  133  9e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0102501  normal  0.42812 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1773  ribosomal protein L22  45.16 
 
 
157 aa  132  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0569  50S ribosomal protein L22P  41.06 
 
 
153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0413889  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2297  50S ribosomal protein L22P  42.95 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1833  ribosomal protein L22  41.89 
 
 
153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0537  50S ribosomal protein L22P  40.13 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.63908 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0096  50S ribosomal protein L22P  40.65 
 
 
156 aa  120  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000729368  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0086  50S ribosomal protein L22P  41.29 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.438509 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0805  50S ribosomal protein L22  37.25 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2223  ribosomal protein L22  41.79 
 
 
159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0215  ribosomal protein L22  41.79 
 
 
165 aa  107  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0556  50S ribosomal protein L22P  36.49 
 
 
168 aa  103  7e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1930  50S ribosomal protein L22P  34.64 
 
 
185 aa  102  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.70908  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1516  ribosomal protein L22  41.22 
 
 
151 aa  101  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  9.68145e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2444  50S ribosomal protein L22P  38.26 
 
 
154 aa  100  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0770  50S ribosomal protein L22P  33.11 
 
 
185 aa  97.8  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0748  50S ribosomal protein L22P  34.44 
 
 
185 aa  94.4  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32234  Ribosomal protein L17, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  39.31 
 
 
183 aa  92.4  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1732  50S ribosomal protein L22P  32.43 
 
 
198 aa  90.9  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0489  ribosomal protein L22  42.52 
 
 
127 aa  90.5  7e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89240  ribosomal protein L17B  38.1 
 
 
186 aa  89.4  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00776  60S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G14410)  37.59 
 
 
184 aa  86.7  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.844288  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29177  predicted protein  35.1 
 
 
185 aa  77.4  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01720  60s ribosomal protein l17, putative  33.1 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1072  50S ribosomal protein L22  45.21 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186157  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1351  50S ribosomal protein L22  43.66 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.622659  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  45.21 
 
 
110 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2252  50S ribosomal protein L22  31.16 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000407093  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  43.84 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  46.58 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  46.58 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  30.66 
 
 
113 aa  57.4  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  40.85 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0685  50S ribosomal protein L22  40.85 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.735331  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  42.25 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0084  50S ribosomal protein L22  28.99 
 
 
112 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100288 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  29.5 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  43.28 
 
 
119 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  41.1 
 
 
110 aa  54.3  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  30.22 
 
 
114 aa  53.9  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4312  50S ribosomal protein L22  41.43 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000184145  unclonable  0.0000000000444445 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4685  50S ribosomal protein L22  41.43 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000490323  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0189  50S ribosomal protein L22  41.43 
 
 
110 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000913672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4920  ribosomal protein L22  38.03 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0979364  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  43.28 
 
 
119 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  27.54 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0175  50S ribosomal protein L22  40 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  29.5 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0286  50S ribosomal protein L22  27.74 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  29.08 
 
 
118 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  28.26 
 
 
113 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4000  ribosomal protein L22  39.73 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248751  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3519  ribosomal protein L22  40 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000743779  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1760  50S ribosomal protein L22  27.54 
 
 
112 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0923883  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17351  50S ribosomal protein L22  39.44 
 
 
128 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0236  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17441  50S ribosomal protein L22  38.03 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4051  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000608091  unclonable  0.00000000000572517 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  29.93 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0205  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000176221  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3754  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000037277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0201  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000591248  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0270  ribosomal protein L22  40.58 
 
 
121 aa  51.2  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000922526  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0204  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  unclonable  0.0000000000170547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0199  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0119828  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  44.12 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4165  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708825  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0204  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013887  hitchhiker  0.0000000012298 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  41.43 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17601  50S ribosomal protein L22  38.03 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  43.28 
 
 
117 aa  50.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2060  ribosomal protein L22  26.81 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000300396  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0153  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202891  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0691  50S ribosomal protein L22  39.13 
 
 
111 aa  50.8  0.000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  41.43 
 
 
111 aa  50.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04516  50S ribosomal protein L22  31.85 
 
 
111 aa  50.8  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000201226  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1645  50S ribosomal protein L22  38.03 
 
 
128 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  29.2 
 
 
117 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  29.2 
 
 
117 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0713  50S ribosomal protein L22  38.96 
 
 
114 aa  50.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.41885  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0696  50S ribosomal protein L22  40.3 
 
 
119 aa  50.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00931457  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  27.74 
 
 
113 aa  50.4  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  27.74 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  27.74 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  27.74 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  27.74 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  40.28 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  39.13 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  27.74 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  38.57 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>