More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0096 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0096  50S ribosomal protein L22P  100 
 
 
156 aa  319  7e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000729368  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1773  ribosomal protein L22  69.23 
 
 
157 aa  228  3e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0714  50S ribosomal protein L22P  40.65 
 
 
153 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00766872  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1388  50S ribosomal protein L22P  38.71 
 
 
153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0805  50S ribosomal protein L22  36.54 
 
 
152 aa  112  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1723  ribosomal protein L22  39.1 
 
 
152 aa  108  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00000443469  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1516  ribosomal protein L22  43.54 
 
 
151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  9.68145e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0105  50S ribosomal protein L22P  40.38 
 
 
151 aa  105  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379943  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0175  50S ribosomal protein L22P  36.13 
 
 
153 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000281865  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0648  50S ribosomal protein L22P  36.13 
 
 
153 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000866939  hitchhiker  0.000275224 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1270  50S ribosomal protein L22P  36.13 
 
 
153 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000000869512  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2248  50S ribosomal protein L22P  35.71 
 
 
154 aa  98.2  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000896212  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0569  50S ribosomal protein L22P  37.41 
 
 
153 aa  96.7  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0413889  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0447  50S ribosomal protein L22P  38.1 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0102501  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2444  50S ribosomal protein L22P  35.57 
 
 
154 aa  90.5  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2223  ribosomal protein L22  38.69 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0556  50S ribosomal protein L22P  34.46 
 
 
168 aa  89  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0006  50S ribosomal protein L22P  34.93 
 
 
151 aa  89  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000018702  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0215  ribosomal protein L22  37.23 
 
 
165 aa  89.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0489  ribosomal protein L22  38.93 
 
 
127 aa  87.4  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0770  50S ribosomal protein L22P  34.46 
 
 
185 aa  87.4  7e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1833  ribosomal protein L22  33.11 
 
 
153 aa  87  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2297  50S ribosomal protein L22P  33.78 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89240  ribosomal protein L17B  36.15 
 
 
186 aa  85.9  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0086  50S ribosomal protein L22P  32.65 
 
 
157 aa  85.5  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.438509 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0537  50S ribosomal protein L22P  35.88 
 
 
154 aa  84  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.63908 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0748  50S ribosomal protein L22P  32.43 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1732  50S ribosomal protein L22P  35.88 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01720  60s ribosomal protein l17, putative  30.71 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00776  60S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G14410)  33.85 
 
 
184 aa  73.9  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.844288  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1930  50S ribosomal protein L22P  29.77 
 
 
185 aa  72  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.70908  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32234  Ribosomal protein L17, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  29.66 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4000  ribosomal protein L22  49.32 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248751  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0713  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.41885  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29177  predicted protein  33.08 
 
 
185 aa  63.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0431  50S ribosomal protein L22  52.17 
 
 
109 aa  63.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491035  decreased coverage  0.00000564548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  47.14 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0286  50S ribosomal protein L22  36.7 
 
 
116 aa  62.8  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0761  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000305048  decreased coverage  0.00987219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1072  50S ribosomal protein L22  47.14 
 
 
111 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  47.14 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0270  ribosomal protein L22  44.93 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000922526  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  48.57 
 
 
110 aa  62.4  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04516  50S ribosomal protein L22  51.47 
 
 
111 aa  62  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000201226  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 
111 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0236  50S ribosomal protein L22  48.57 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3754  50S ribosomal protein L22  48.57 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000037277  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0494  50S ribosomal protein L22  49.28 
 
 
109 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000320971  hitchhiker  0.00360456 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  47.83 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0205  50S ribosomal protein L22  48.57 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000176221  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  50.72 
 
 
110 aa  61.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4051  50S ribosomal protein L22  48.57 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000608091  unclonable  0.00000000000572517 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0489  50S ribosomal protein L22  49.28 
 
 
109 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000394007  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4165  50S ribosomal protein L22  48.57 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708825  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  48.57 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0204  50S ribosomal protein L22  48.57 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  unclonable  0.0000000000170547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0199  50S ribosomal protein L22  48.57 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0119828  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0153  50S ribosomal protein L22  48.57 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202891  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0201  50S ribosomal protein L22  48.57 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000591248  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0204  50S ribosomal protein L22  48.57 
 
 
110 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013887  hitchhiker  0.0000000012298 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4312  50S ribosomal protein L22  48.57 
 
 
110 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000184145  unclonable  0.0000000000444445 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4685  50S ribosomal protein L22  48.57 
 
 
110 aa  61.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000490323  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0189  50S ribosomal protein L22  48.57 
 
 
110 aa  61.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000913672  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0175  50S ribosomal protein L22  47.14 
 
 
110 aa  60.8  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0685  50S ribosomal protein L22  45.07 
 
 
111 aa  60.8  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.735331  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  44.29 
 
 
110 aa  60.5  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  45.71 
 
 
110 aa  60.5  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03166  50S ribosomal protein L22  50.72 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  50.72 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  50.72 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  50.72 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  50.72 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  50.72 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3631  50S ribosomal protein L22  50.72 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221962  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3817  50S ribosomal protein L22  50.72 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000551944  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  50.72 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  50.72 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  50.72 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4539  50S ribosomal protein L22  50.72 
 
 
110 aa  60.5  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175116  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  50.72 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  50.72 
 
 
110 aa  60.5  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3910  50S ribosomal protein L22  50.72 
 
 
110 aa  60.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000355521  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  50.72 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0589  50S ribosomal protein L22  50.72 
 
 
110 aa  60.5  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118161  normal  0.432956 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  50.72 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  50.72 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  48.57 
 
 
111 aa  60.5  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  50.72 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0288  50S ribosomal protein L22  50.72 
 
 
110 aa  60.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000016922  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  50.72 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3996  50S ribosomal protein L22  50.72 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000093676  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1179  ribosomal protein L22  48.57 
 
 
110 aa  59.7  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000146322  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2060  ribosomal protein L22  46.48 
 
 
110 aa  59.7  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000300396  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2319  ribosomal protein L22  50 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000611506  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  45.71 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  47.83 
 
 
110 aa  58.5  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0084  50S ribosomal protein L22  48.57 
 
 
112 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  42.86 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  47.83 
 
 
110 aa  57.8  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>