40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0556 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0556  50S ribosomal protein L22P  100 
 
 		 168 aa  336  8e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0770  50S ribosomal protein L22P  87.5 
 
 		 185 aa  308  2e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1732  50S ribosomal protein L22P  85.71 
 
 		 198 aa  305  1.0000000000000001e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0748  50S ribosomal protein L22P  81.55 
 
 		 185 aa  298  2e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1930  50S ribosomal protein L22P  57.23 
 
 		 185 aa  201  3e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.70908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0569  50S ribosomal protein L22P  50 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0413889  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2248  50S ribosomal protein L22P  41.5 
 
 		 154 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000896212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0537  50S ribosomal protein L22P  41.22 
 
 		 154 aa  120  7e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.63908 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2297  50S ribosomal protein L22P  41.45 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0086  50S ribosomal protein L22P  40.13 
 
 		 157 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.438509 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0447  50S ribosomal protein L22P  42.57 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0102501  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1388  50S ribosomal protein L22P  39.19 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0489  ribosomal protein L22  52.31 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0105  50S ribosomal protein L22P  41.22 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0006  50S ribosomal protein L22P  41.61 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000018702  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0805  50S ribosomal protein L22  40.15 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1723  ribosomal protein L22  42.07 
 
 		 152 aa  112  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00000443469  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1833  ribosomal protein L22  38.31 
 
 		 153 aa  110  7.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2223  ribosomal protein L22  40.29 
 
 		 159 aa  107  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1270  50S ribosomal protein L22P  36.91 
 
 		 153 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000000869512  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0648  50S ribosomal protein L22P  36.91 
 
 		 153 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000866939  hitchhiker  0.000275224 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0175  50S ribosomal protein L22P  36.91 
 
 		 153 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000281865  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0215  ribosomal protein L22  41.01 
 
 		 165 aa  107  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0714  50S ribosomal protein L22P  36.49 
 
 		 153 aa  103  9e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00766872  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1773  ribosomal protein L22  38.73 
 
 		 157 aa  97.8  6e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2444  50S ribosomal protein L22P  36.49 
 
 		 154 aa  97.4  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1516  ribosomal protein L22  39.46 
 
 		 151 aa  97.1  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  9.68145e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0096  50S ribosomal protein L22P  34.46 
 
 		 156 aa  89  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000729368  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32234  Ribosomal protein L17, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  33.79 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.333156 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00776  60S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G14410)  34.97 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.844288  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01720  60s ribosomal protein l17, putative  34.38 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29177  predicted protein  30.71 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89240  ribosomal protein L17B  28.99 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0270  ribosomal protein L22  47.17 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000922526  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1179  ribosomal protein L22  32.5 
 
 		 110 aa  43.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000146322  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3179  50S ribosomal protein L22  31.08 
 
 		 128 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2300  50S ribosomal protein L22  31.08 
 
 		 128 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.823648  normal  0.116572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1345  ribosomal protein L22  27.94 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  34.78 
 
 		 136 aa  42  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0665  50S ribosomal protein L22  27.74 
 
 		 112 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>