65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_29177 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_29177  predicted protein  100 
 
 		 185 aa  379  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89240  ribosomal protein L17B  48.85 
 
 		 186 aa  171  5.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32234  Ribosomal protein L17, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  48.04 
 
 		 183 aa  169  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.333156 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00776  60S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G14410)  45.98 
 
 		 184 aa  162  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.844288  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01720  60s ribosomal protein l17, putative  49.1 
 
 		 182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0105  50S ribosomal protein L22P  36.6 
 
 		 151 aa  89.4  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0006  50S ribosomal protein L22P  33.33 
 
 		 151 aa  87.4  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000018702  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1388  50S ribosomal protein L22P  33.99 
 
 		 153 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0569  50S ribosomal protein L22P  37.06 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0413889  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1833  ribosomal protein L22  32.69 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0537  50S ribosomal protein L22P  34.9 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.63908 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2297  50S ribosomal protein L22P  31.85 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0714  50S ribosomal protein L22P  35.1 
 
 		 153 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00766872  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1723  ribosomal protein L22  32.68 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00000443469  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2248  50S ribosomal protein L22P  33.79 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000896212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0175  50S ribosomal protein L22P  32.03 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000281865  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0648  50S ribosomal protein L22P  32.03 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000866939  hitchhiker  0.000275224 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1270  50S ribosomal protein L22P  32.03 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000000869512  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0447  50S ribosomal protein L22P  33.57 
 
 		 156 aa  72  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0102501  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0086  50S ribosomal protein L22P  29.37 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.438509 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0556  50S ribosomal protein L22P  30.71 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0215  ribosomal protein L22  32.62 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0770  50S ribosomal protein L22P  32.86 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1773  ribosomal protein L22  34.07 
 
 		 157 aa  67.4  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0748  50S ribosomal protein L22P  28.57 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1732  50S ribosomal protein L22P  29.29 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0805  50S ribosomal protein L22  32.56 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0096  50S ribosomal protein L22P  33.08 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000729368  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1930  50S ribosomal protein L22P  27.84 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.70908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2223  ribosomal protein L22  29.29 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2444  50S ribosomal protein L22P  28.95 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0489  ribosomal protein L22  31.78 
 
 		 127 aa  57.4  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1516  ribosomal protein L22  31.37 
 
 		 151 aa  57  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  9.68145e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1760  50S ribosomal protein L22  35.62 
 
 		 112 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0923883  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  36.62 
 
 		 110 aa  47.8  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0713  50S ribosomal protein L22  33.8 
 
 		 114 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.41885  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0270  ribosomal protein L22  36.49 
 
 		 121 aa  47.4  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000922526  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0665  50S ribosomal protein L22  35.62 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0084  50S ribosomal protein L22  25 
 
 		 112 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100288 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0286  50S ribosomal protein L22  33.33 
 
 		 116 aa  45.4  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2252  50S ribosomal protein L22  24.82 
 
 		 110 aa  44.7  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000407093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  24.83 
 
 		 114 aa  44.7  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  33.78 
 
 		 113 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3900  50S ribosomal protein L22  38.03 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3662  50S ribosomal protein L22  34.78 
 
 		 127 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  33.78 
 
 		 113 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1849  50S ribosomal protein L22  37.84 
 
 		 115 aa  42  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000192046  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1941  50S ribosomal protein L22  28.89 
 
 		 146 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2023  50S ribosomal protein L22  28.89 
 
 		 146 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.734149  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0852  50S ribosomal protein L22P  34.38 
 
 		 113 aa  42  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000720413  hitchhiker  0.0000829756 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1938  50S ribosomal protein L22  28.89 
 
 		 146 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0342  50S ribosomal protein L22  37.84 
 
 		 115 aa  42  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000162922  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  38.24 
 
 		 139 aa  41.6  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16731  50S ribosomal protein L22  32.93 
 
 		 129 aa  41.6  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2319  ribosomal protein L22  32.43 
 
 		 115 aa  41.2  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000611506  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3174  50S ribosomal protein L22  36.76 
 
 		 109 aa  41.2  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00426002  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  36.62 
 
 		 111 aa  41.2  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2945  50S ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 109 aa  41.2  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396583  decreased coverage  0.000000112482 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  36.62 
 
 		 111 aa  41.2  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3292  50S ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 109 aa  41.2  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000257893  hitchhiker  0.00000196654 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0986  ribosomal protein L22  39.73 
 
 		 114 aa  40.8  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.631891  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3312  50S ribosomal protein L22  36.76 
 
 		 109 aa  41.2  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000860749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17110  50S ribosomal protein L22  36.11 
 
 		 121 aa  40.8  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0887543  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1916  50S ribosomal protein L22  28.15 
 
 		 144 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.58558 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3014  50S ribosomal protein L22  35.29 
 
 		 109 aa  40.8  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000615248  decreased coverage  0.00191029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>